RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM229BQ4G0N7 80 aa9.7□□□□□ -0.86
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LRP1BQ9NZR2 4599 aa9.67□□□□□ -0.86
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PMAIP1Q13794 54 aa8.8□□□□□ -1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SPTSSBQ8NFR3 76 aa8.8□□□□□ -1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa8.76□□□□□ -1.01
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 A6NN06 94 aa8.7□□□□□ -1.02
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 UQCR11O14957 56 aa8.69□□□□□ -1.02
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SPATA8Q6RVD6 105 aa8.69□□□□□ -1.02
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RPL37P61927 97 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 COX6B2Q6YFQ2 88 aa8.67□□□□□ -1.02
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MT1HL1P0DM35 61 aa8.64□□□□□ -1.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SEC61GP60059 68 aa8.64□□□□□ -1.03
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