RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582232.1

GGA3-211, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene GGA3, Length 598 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-211ENST00000582232 NDUFB1O75438 58 aa6.33□□□□□ -1.4
GGA3-211ENST00000582232 DSCR10P59022 87 aa6.33□□□□□ -1.4
GGA3-211ENST00000582232 LRP2P98164 4655 aa6.33□□□□□ -1.4
GGA3-211ENST00000582232 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.31□□□□□ -1.4
GGA3-211ENST00000582232 K7ERU9 68 aa6.31□□□□□ -1.4
GGA3-211ENST00000582232 CXCL6P80162 114 aa6.31□□□□□ -1.4
GGA3-211ENST00000582232 PRR15Q8IV56 129 aa6.31□□□□□ -1.4
GGA3-211ENST00000582232 C8orf87E5RJ46 101 aa6.3□□□□□ -1.4
GGA3-211ENST00000582232 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa6.29□□□□□ -1.4
GGA3-211ENST00000582232 C9orf92A6NGG3 77 aa6.29□□□□□ -1.4
GGA3-211ENST00000582232 LINC00313P59037 77 aa6.29□□□□□ -1.4
GGA3-211ENST00000582232 CDIP1Q9H305 208 aa6.29□□□□□ -1.4
GGA3-211ENST00000582232 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.28□□□□□ -1.4
GGA3-211ENST00000582232 LINC00643Q86TS7 51 aa6.28□□□□□ -1.4
GGA3-211ENST00000582232 K7EQZ3 153 aa6.27□□□□□ -1.41
GGA3-211ENST00000582232 XP32Q5T750 250 aa6.27□□□□□ -1.41
GGA3-211ENST00000582232 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6.27□□□□□ -1.41
GGA3-211ENST00000582232 RNF213Q63HN8 5207 aa6.27□□□□□ -1.41
GGA3-211ENST00000582232 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.25□□□□□ -1.41
GGA3-211ENST00000582232 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.25□□□□□ -1.41
GGA3-211ENST00000582232 Q8N9L7 120 aa6.24□□□□□ -1.41
GGA3-211ENST00000582232 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.23□□□□□ -1.41
GGA3-211ENST00000582232 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.23□□□□□ -1.41
GGA3-211ENST00000582232 A8MUU9 505 aa6.21□□□□□ -1.42
GGA3-211ENST00000582232 Q75L30 129 aa6.21□□□□□ -1.42
GGA3-211ENST00000582232 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
GGA3-211ENST00000582232 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.2□□□□□ -1.42
GGA3-211ENST00000582232 MUC17Q685J3 4493 aa6.2□□□□□ -1.42
GGA3-211ENST00000582232 hDV103S1A0JD37 113 aa6.19□□□□□ -1.42
GGA3-211ENST00000582232 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
GGA3-211ENST00000582232 HCG22E2RYF7 251 aa6.18□□□□□ -1.42
GGA3-211ENST00000582232 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
GGA3-211ENST00000582232 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
GGA3-211ENST00000582232 CASC2Q6XLA1 102 aa6.16□□□□□ -1.42
GGA3-211ENST00000582232 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.15□□□□□ -1.42
GGA3-211ENST00000582232 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
GGA3-211ENST00000582232 IMUPQ9GZP8 106 aa6.14□□□□□ -1.43
GGA3-211ENST00000582232 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.12□□□□□ -1.43
GGA3-211ENST00000582232 MT-ATP8P03928 68 aa6.11□□□□□ -1.43
GGA3-211ENST00000582232 PCOTHQ58A44 107 aa6.11□□□□□ -1.43
GGA3-211ENST00000582232 A0A087WVE0 104 aa6.1□□□□□ -1.43
GGA3-211ENST00000582232 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
GGA3-211ENST00000582232 NDUFS5O43920 106 aa6.07□□□□□ -1.44
GGA3-211ENST00000582232 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.06□□□□□ -1.44
GGA3-211ENST00000582232 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.03□□□□□ -1.44
GGA3-211ENST00000582232 Q5W150 140 aa6.02□□□□□ -1.45
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GGA3-211ENST00000582232 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa5.97□□□□□ -1.45
GGA3-211ENST00000582232 SCGB1A1P11684 91 aa5.97□□□□□ -1.45
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GGA3-211ENST00000582232 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa5.89□□□□□ -1.47
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GGA3-211ENST00000582232 FAT4Q6V0I7 4981 aa5.88□□□□□ -1.47
GGA3-211ENST00000582232 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa5.88□□□□□ -1.47
GGA3-211ENST00000582232 H3BPC8 53 aa5.87□□□□□ -1.47
GGA3-211ENST00000582232 MP68P56378 58 aa5.87□□□□□ -1.47
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GGA3-211ENST00000582232 A0A0U1RQV1 116 aa5.86□□□□□ -1.47
GGA3-211ENST00000582232 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa5.86□□□□□ -1.47
GGA3-211ENST00000582232 SERP2Q8N6R1 65 aa5.84□□□□□ -1.47
GGA3-211ENST00000582232 C1orf64Q8NEQ6 169 aa5.84□□□□□ -1.47
GGA3-211ENST00000582232 LINC00208Q96KT6 92 aa5.84□□□□□ -1.47
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GGA3-211ENST00000582232 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.83□□□□□ -1.48
GGA3-211ENST00000582232 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa5.83□□□□□ -1.48
GGA3-211ENST00000582232 LCE2CQ5TA81 110 aa5.82□□□□□ -1.48
GGA3-211ENST00000582232 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
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GGA3-211ENST00000582232 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa5.76□□□□□ -1.49
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GGA3-211ENST00000582232 COX7CP15954 63 aa5.76□□□□□ -1.49
GGA3-211ENST00000582232 KLKP1Q107X0 134 aa5.75□□□□□ -1.49
GGA3-211ENST00000582232 ANAPC13Q9BS18 74 aa5.73□□□□□ -1.49
GGA3-211ENST00000582232 C20orf197Q8N268 126 aa5.72□□□□□ -1.49
GGA3-211ENST00000582232 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.72□□□□□ -1.49
GGA3-211ENST00000582232 MT1HP80294 61 aa5.71□□□□□ -1.5
GGA3-211ENST00000582232 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa5.71□□□□□ -1.5
GGA3-211ENST00000582232 SNURFQ9Y675 71 aa5.7□□□□□ -1.5
GGA3-211ENST00000582232 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.67□□□□□ -1.5
GGA3-211ENST00000582232 A8MUN3 132 aa5.67□□□□□ -1.5
GGA3-211ENST00000582232 NDUFC1O43677 76 aa5.63□□□□□ -1.51
GGA3-211ENST00000582232 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa5.63□□□□□ -1.51
GGA3-211ENST00000582232 DMAC1Q96GE9 116 aa5.62□□□□□ -1.51
GGA3-211ENST00000582232 CCDC179H3BU77 68 aa5.6□□□□□ -1.51
GGA3-211ENST00000582232 M0R2T5 61 aa5.6□□□□□ -1.51
GGA3-211ENST00000582232 H7BZZ5 65 aa5.59□□□□□ -1.51
GGA3-211ENST00000582232 CYSTM1Q9H1C7 97 aa5.59□□□□□ -1.51
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