RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556496.2

NRXN3-213, Transcript of neurexin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NRXN3, Length 2,737 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3-213ENST00000556496 NDUFS5O43920 106 aa6.2□□□□□ -1.42
NRXN3-213ENST00000556496 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.2□□□□□ -1.42
NRXN3-213ENST00000556496 HYDINQ4G0P3 5121 aa6.2□□□□□ -1.42
NRXN3-213ENST00000556496 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.2□□□□□ -1.42
NRXN3-213ENST00000556496 CD164Q04900 197 aa6.19□□□□□ -1.42
NRXN3-213ENST00000556496 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
NRXN3-213ENST00000556496 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa6.18□□□□□ -1.42
NRXN3-213ENST00000556496 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.17□□□□□ -1.42
NRXN3-213ENST00000556496 LRP1BQ9NZR2 4599 aa6.16□□□□□ -1.42
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NRXN3-213ENST00000556496 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.15□□□□□ -1.42
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NRXN3-213ENST00000556496 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.13□□□□□ -1.43
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NRXN3-213ENST00000556496 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.11□□□□□ -1.43
NRXN3-213ENST00000556496 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.11□□□□□ -1.43
NRXN3-213ENST00000556496 Q1T7F1 81 aa6.09□□□□□ -1.43
NRXN3-213ENST00000556496 C1orf195Q5TG92 126 aa6.09□□□□□ -1.43
NRXN3-213ENST00000556496 C8orf87E5RJ46 101 aa6.09□□□□□ -1.43
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NRXN3-213ENST00000556496 LINC00313P59037 77 aa6.07□□□□□ -1.44
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NRXN3-213ENST00000556496 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.05□□□□□ -1.44
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NRXN3-213ENST00000556496 PSPHP1O15172 72 aa6.05□□□□□ -1.44
NRXN3-213ENST00000556496 LIMD2Q9BT23 127 aa6.05□□□□□ -1.44
NRXN3-213ENST00000556496 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.04□□□□□ -1.44
NRXN3-213ENST00000556496 BRK1Q8WUW1 75 aa6.04□□□□□ -1.44
NRXN3-213ENST00000556496 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.04□□□□□ -1.44
NRXN3-213ENST00000556496 PKHD1P08F94 4074 aa6.03□□□□□ -1.44
NRXN3-213ENST00000556496 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
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NRXN3-213ENST00000556496 V9GYY9 64 aa6.02□□□□□ -1.45
NRXN3-213ENST00000556496 RETNLBQ9BQ08 111 aa6□□□□□ -1.45
NRXN3-213ENST00000556496 FAM229AH3BQW9 127 aa6□□□□□ -1.45
NRXN3-213ENST00000556496 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
NRXN3-213ENST00000556496 A8MUN3 132 aa5.99□□□□□ -1.45
NRXN3-213ENST00000556496 SPINK1P00995 79 aa5.99□□□□□ -1.45
NRXN3-213ENST00000556496 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa5.98□□□□□ -1.45
NRXN3-213ENST00000556496 PRR26Q8N8Z3 221 aa5.98□□□□□ -1.45
NRXN3-213ENST00000556496 HRES1P13985 223 aa5.97□□□□□ -1.45
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NRXN3-213ENST00000556496 Q5VV11 94 aa5.95□□□□□ -1.46
NRXN3-213ENST00000556496 PRR15LQ9BU68 103 aa5.94□□□□□ -1.46
NRXN3-213ENST00000556496 IGKV2-30P06310 120 aa5.93□□□□□ -1.46
NRXN3-213ENST00000556496 SPAG11AQ6PDA7 123 aa5.93□□□□□ -1.46
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NRXN3-213ENST00000556496 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa5.9□□□□□ -1.46
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NRXN3-213ENST00000556496 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa5.89□□□□□ -1.47
NRXN3-213ENST00000556496 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
NRXN3-213ENST00000556496 DMAC1Q96GE9 116 aa5.89□□□□□ -1.47
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NRXN3-213ENST00000556496 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa5.77□□□□□ -1.49
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NRXN3-213ENST00000556496 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa5.76□□□□□ -1.49
NRXN3-213ENST00000556496 A8MUU9 505 aa5.75□□□□□ -1.49
NRXN3-213ENST00000556496 Q8N1X5 172 aa5.74□□□□□ -1.49
NRXN3-213ENST00000556496 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.74□□□□□ -1.49
NRXN3-213ENST00000556496 SPTSSBQ8NFR3 76 aa5.73□□□□□ -1.49
NRXN3-213ENST00000556496 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
NRXN3-213ENST00000556496 A0A1B0GU69 56 aa5.71□□□□□ -1.49
NRXN3-213ENST00000556496 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa5.7□□□□□ -1.5
NRXN3-213ENST00000556496 Q5VSD8 79 aa5.69□□□□□ -1.5
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NRXN3-213ENST00000556496 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
NRXN3-213ENST00000556496 TNXBP22105 4242 aa5.62□□□□□ -1.51
NRXN3-213ENST00000556496 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.62□□□□□ -1.51
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NRXN3-213ENST00000556496 A6NN06 94 aa5.6□□□□□ -1.51
NRXN3-213ENST00000556496 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa5.6□□□□□ -1.51
NRXN3-213ENST00000556496 RYR1P21817 5038 aa5.6□□□□□ -1.51
NRXN3-213ENST00000556496 UQCR11O14957 56 aa5.59□□□□□ -1.52
NRXN3-213ENST00000556496 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.58□□□□□ -1.52
NRXN3-213ENST00000556496 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.57□□□□□ -1.52
NRXN3-213ENST00000556496 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5.56□□□□□ -1.52
NRXN3-213ENST00000556496 KIAA1109Q2LD37 5005 aa5.55□□□□□ -1.52
NRXN3-213ENST00000556496 COX6B2Q6YFQ2 88 aa5.55□□□□□ -1.52
NRXN3-213ENST00000556496 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa5.55□□□□□ -1.52
NRXN3-213ENST00000556496 RPL37P61927 97 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
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