RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553843.5

RHOXF1-AS1-201, RHOXF1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RHOXF1-AS1, Length 2,102 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 LINC00483Q53H64 154 aa4.77□□□□□ -1.65
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 HMCN2Q8NDA2 5059 aa4.77□□□□□ -1.65
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 CYSTM1Q9H1C7 97 aa4.75□□□□□ -1.65
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 K7EQZ3 153 aa4.75□□□□□ -1.65
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa4.74□□□□□ -1.65
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 C20orf197Q8N268 126 aa4.74□□□□□ -1.65
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 DEFB116Q30KQ4 102 aa4.73□□□□□ -1.65
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 LINC00304Q8N9R0 145 aa4.73□□□□□ -1.65
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 OCR1Q9BZK8 76 aa4.73□□□□□ -1.65
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 LINC00472Q9H8W2 130 aa4.72□□□□□ -1.65
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 TMEM258P61165 79 aa4.71□□□□□ -1.66
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 KLKP1Q107X0 134 aa4.71□□□□□ -1.66
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 HCG22E2RYF7 251 aa4.7□□□□□ -1.66
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 MOBPQ13875 183 aa4.7□□□□□ -1.66
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 PRR4Q16378 134 aa4.69□□□□□ -1.66
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 A8MWP4 228 aa4.69□□□□□ -1.66
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 SNURFQ9Y675 71 aa4.69□□□□□ -1.66
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 J3KT08 172 aa4.68□□□□□ -1.66
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 PRR15Q8IV56 129 aa4.68□□□□□ -1.66
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 TMEM254Q8TBM7 123 aa4.68□□□□□ -1.66
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 H7BZZ5 65 aa4.67□□□□□ -1.66
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 HRCT1Q6UXD1 115 aa4.67□□□□□ -1.66
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 RETNLBQ9BQ08 111 aa4.67□□□□□ -1.66
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 SPAG11AQ6PDA7 123 aa4.66□□□□□ -1.66
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 WFDC13Q8IUB5 93 aa4.66□□□□□ -1.66
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 Q96NJ1 140 aa4.66□□□□□ -1.66
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 NDUFC1O43677 76 aa4.66□□□□□ -1.66
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa4.66□□□□□ -1.66
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 A0A0U1RQV1 116 aa4.65□□□□□ -1.67
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 NDUFB1O75438 58 aa4.65□□□□□ -1.67
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 LPAP08519 4548 aa4.65□□□□□ -1.67
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 CASC2Q6XLA1 102 aa4.64□□□□□ -1.67
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 LRP2P98164 4655 aa4.64□□□□□ -1.67
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 UBR4Q5T4S7 5183 aa4.64□□□□□ -1.67
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 CD164Q04900 197 aa4.63□□□□□ -1.67
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa4.63□□□□□ -1.67
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 SPINK1P00995 79 aa4.63□□□□□ -1.67
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 FAM236CP0DP71 79 aa4.63□□□□□ -1.67
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 RPS28P62857 69 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 C5orf47Q569G3 176 aa4.63□□□□□ -1.67
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa4.62□□□□□ -1.67
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 LCE2BO14633 110 aa4.61□□□□□ -1.67
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 hDV103S1A0JD37 113 aa4.6□□□□□ -1.67
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 SEC61GP60059 68 aa4.6□□□□□ -1.67
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa4.6□□□□□ -1.67
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 A0A1B0GVX0 72 aa4.6□□□□□ -1.67
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa4.59□□□□□ -1.67
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 C8orf17Q9NRJ1 99 aa4.59□□□□□ -1.67
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 RPS29P62273 56 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa4.58□□□□□ -1.68
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 MP68P56378 58 aa4.58□□□□□ -1.68
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 H3BS24 57 aa4.57□□□□□ -1.68
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 LIMD2Q9BT23 127 aa4.57□□□□□ -1.68
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 SERP1Q9Y6X1 66 aa4.57□□□□□ -1.68
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 H0Y9P7 68 aa4.56□□□□□ -1.68
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 H3BPC8 53 aa4.55□□□□□ -1.68
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 Q5XG85 94 aa4.55□□□□□ -1.68
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 TPRXLQ17RH7 258 aa4.55□□□□□ -1.68
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 LINC00208Q96KT6 92 aa4.55□□□□□ -1.68
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa4.55□□□□□ -1.68
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 TRAV22A0A0B4J277 110 aa4.54□□□□□ -1.68
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa4.54□□□□□ -1.68
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 RNF213Q63HN8 5207 aa4.53□□□□□ -1.68
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 C8orf87E5RJ46 101 aa4.52□□□□□ -1.69
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 NDUFS5O43920 106 aa4.52□□□□□ -1.69
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa4.52□□□□□ -1.69
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 C1orf195Q5TG92 126 aa4.52□□□□□ -1.69
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 C1orf64Q8NEQ6 169 aa4.51□□□□□ -1.69
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 A0A0A0MQY5 61 aa4.5□□□□□ -1.69
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 XP32Q5T750 250 aa4.5□□□□□ -1.69
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 LINC00313P59037 77 aa4.48□□□□□ -1.69
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa4.48□□□□□ -1.69
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 C9orf92A6NGG3 77 aa4.48□□□□□ -1.69
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa4.48□□□□□ -1.69
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 MUC17Q685J3 4493 aa4.47□□□□□ -1.69
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 SMIM26A0A096LP01 95 aa4.47□□□□□ -1.69
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 LCE2CQ5TA81 110 aa4.46□□□□□ -1.69
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 Q5W150 140 aa4.44□□□□□ -1.7
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa4.43□□□□□ -1.7
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 PCOTHQ58A44 107 aa4.43□□□□□ -1.7
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa4.42□□□□□ -1.7
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 MUC2Q02817 5179 aa4.41□□□□□ -1.7
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 C4orf26Q17RF5 130 aa4.41□□□□□ -1.7
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP4.37□□□□□ -1.71
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 MPLKIPQ8TAP9 179 aa4.37□□□□□ -1.71
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa4.37□□□□□ -1.71
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 IGKV2-30P06310 120 aa4.36□□□□□ -1.71
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 RPL37P61927 97 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 COA5Q86WW8 74 aa4.35□□□□□ -1.71
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 Q1T7F1 81 aa4.34□□□□□ -1.71
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 HRES1P13985 223 aa4.32□□□□□ -1.72
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 FAT4Q6V0I7 4981 aa4.31□□□□□ -1.72
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 V9GYY9 64 aa4.31□□□□□ -1.72
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa4.3□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.7 ms