RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552253.1

PTPRB-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 2,373 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-211ENST00000552253 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRB-211ENST00000552253 LCE3BQ5TA77 95 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRB-211ENST00000552253 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRB-211ENST00000552253 DNAH2Q9P225 4427 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRB-211ENST00000552253 A0A087X002 238 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRB-211ENST00000552253 RTL8CO15255 209 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRB-211ENST00000552253 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRB-211ENST00000552253 C8orf17Q9NRJ1 99 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRB-211ENST00000552253 FBN3Q75N90 2809 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRB-211ENST00000552253 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRB-211ENST00000552253 PSPHP1O15172 72 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRB-211ENST00000552253 A0A0A0MQY5 61 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRB-211ENST00000552253 ZNF861PO60384 105 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRB-211ENST00000552253 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRB-211ENST00000552253 A0A1B0GVX0 72 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRB-211ENST00000552253 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRB-211ENST00000552253 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRB-211ENST00000552253 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PTPRB-211ENST00000552253 CD164Q04900 197 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRB-211ENST00000552253 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
PTPRB-211ENST00000552253 A8MUN3 132 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRB-211ENST00000552253 KMT2AQ03164 3969 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRB-211ENST00000552253 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRB-211ENST00000552253 NDUFS5O43920 106 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRB-211ENST00000552253 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRB-211ENST00000552253 Q5VV11 94 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRB-211ENST00000552253 IGLV7-43P04211 117 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRB-211ENST00000552253 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PTPRB-211ENST00000552253 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRB-211ENST00000552253 PCOTHQ58A44 107 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRB-211ENST00000552253 Q5W150 140 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRB-211ENST00000552253 Q75L30 129 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRB-211ENST00000552253 COA5Q86WW8 74 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRB-211ENST00000552253 FRAS1Q86XX4 4008 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRB-211ENST00000552253 A8MU10 97 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRB-211ENST00000552253 CDK2AP2O75956 126 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRB-211ENST00000552253 PRR15LQ9BU68 103 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRB-211ENST00000552253 ALMS1Q8TCU4 4167 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRB-211ENST00000552253 A6NED7 52 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRB-211ENST00000552253 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRB-211ENST00000552253 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRB-211ENST00000552253 C1orf134Q5TEV5 83 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRB-211ENST00000552253 DNAH11Q96DT5 4516 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRB-211ENST00000552253 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRB-211ENST00000552253 KRTAP10-2P60368 255 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRB-211ENST00000552253 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRB-211ENST00000552253 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRB-211ENST00000552253 DNAH6Q9C0G6 4158 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRB-211ENST00000552253 TGP01266 2768 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRB-211ENST00000552253 HRES1P13985 223 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRB-211ENST00000552253 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRB-211ENST00000552253 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRB-211ENST00000552253 DNAH5Q8TE73 4624 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRB-211ENST00000552253 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRB-211ENST00000552253 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRB-211ENST00000552253 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRB-211ENST00000552253 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRB-211ENST00000552253 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRB-211ENST00000552253 SPTSSBQ8NFR3 76 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRB-211ENST00000552253 SPINK6Q6UWN8 80 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRB-211ENST00000552253 LRP1BQ9NZR2 4599 aa3.4□□□□□ -1.86
PTPRB-211ENST00000552253 Q6ZSA8 131 aa3.4□□□□□ -1.86
PTPRB-211ENST00000552253 LCA10Q71F78 164 aa3.4□□□□□ -1.86
PTPRB-211ENST00000552253 KRTAP23-1A1A580 65 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRB-211ENST00000552253 PKD1P98161 4303 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRB-211ENST00000552253 LY6G6CO95867 125 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRB-211ENST00000552253 KRTAP10-1P60331 282 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRB-211ENST00000552253 HYDINQ4G0P3 5121 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRB-211ENST00000552253 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRB-211ENST00000552253 C8orf87E5RJ46 101 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRB-211ENST00000552253 DNHD1Q96M86 4753 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRB-211ENST00000552253 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRB-211ENST00000552253 ACYP2P14621 99 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRB-211ENST00000552253 SPAG11AQ6PDA7 123 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRB-211ENST00000552253 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRB-211ENST00000552253 C7orf65Q6ZTY9 151 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRB-211ENST00000552253 FAT2Q9NYQ8 4349 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRB-211ENST00000552253 A6NN06 94 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRB-211ENST00000552253 LINC00313P59037 77 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRB-211ENST00000552253 PRR26Q8N8Z3 221 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRB-211ENST00000552253 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRB-211ENST00000552253 IGKV2-30P06310 120 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRB-211ENST00000552253 SPINK7P58062 85 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRB-211ENST00000552253 DMAC1Q96GE9 116 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRB-211ENST00000552253 RETNLBQ9BQ08 111 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRB-211ENST00000552253 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRB-211ENST00000552253 SACSQ9NZJ4 4579 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRB-211ENST00000552253 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRB-211ENST00000552253 A0A1B0GU69 56 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRB-211ENST00000552253 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRB-211ENST00000552253 UQCR11O14957 56 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRB-211ENST00000552253 LCE1DQ5T752 114 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRB-211ENST00000552253 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRB-211ENST00000552253 TYMSOSQ8TAI1 123 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRB-211ENST00000552253 SPINK1P00995 79 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRB-211ENST00000552253 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRB-211ENST00000552253 SPATA8Q6RVD6 105 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRB-211ENST00000552253 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRB-211ENST00000552253 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRB-211ENST00000552253 RPS29P62273 56 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.5 ms