RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544276.1

LMO3-230, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 3

Gene LMO3, Length 460 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-230ENST00000544276 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.23□□□□□ -1.57
LMO3-230ENST00000544276 TRACP01848 142 aa5.23□□□□□ -1.57
LMO3-230ENST00000544276 CCKP06307 115 aa5.23□□□□□ -1.57
LMO3-230ENST00000544276 COX6CP09669 75 aa5.23□□□□□ -1.57
LMO3-230ENST00000544276 UBE2V1Q13404 147 aa5.23□□□□□ -1.57
LMO3-230ENST00000544276 C8orf87E5RJ46 101 aa5.22□□□□□ -1.57
LMO3-230ENST00000544276 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa5.21□□□□□ -1.58
LMO3-230ENST00000544276 PSMB2P49721 201 aa5.21□□□□□ -1.58
LMO3-230ENST00000544276 HSD52Q0P140 79 aa5.21□□□□□ -1.58
LMO3-230ENST00000544276 DEFB116Q30KQ4 102 aa5.21□□□□□ -1.58
LMO3-230ENST00000544276 SSPOA2VEC9 5147 aa5.2□□□□□ -1.58
LMO3-230ENST00000544276 MT1FP04733 61 aa5.2□□□□□ -1.58
LMO3-230ENST00000544276 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.2□□□□□ -1.58
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LMO3-230ENST00000544276 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-230ENST00000544276 LCE1DQ5T752 114 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-230ENST00000544276 MTURNQ8N3F0 131 aa5.19□□□□□ -1.58
LMO3-230ENST00000544276 A0A1B0GV72 72 aa5.18□□□□□ -1.58
LMO3-230ENST00000544276 K7ERJ3 54 aa5.18□□□□□ -1.58
LMO3-230ENST00000544276 J3KT08 172 aa5.17□□□□□ -1.58
LMO3-230ENST00000544276 KRTAP10-10P60014 251 aa5.17□□□□□ -1.58
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LMO3-230ENST00000544276 DSCR8Q96T75 97 aa5.16□□□□□ -1.58
LMO3-230ENST00000544276 PYY3Q5JQD4 70 aa5.15□□□□□ -1.59
LMO3-230ENST00000544276 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
LMO3-230ENST00000544276 SPINK7P58062 85 aa5.14□□□□□ -1.59
LMO3-230ENST00000544276 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
LMO3-230ENST00000544276 Q6ZQT0 140 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-230ENST00000544276 VPS25Q9BRG1 176 aa5.13□□□□□ -1.59
LMO3-230ENST00000544276 A0A1B0GW54 56 aa5.12□□□□□ -1.59
LMO3-230ENST00000544276 C9JAW5 83 aa5.12□□□□□ -1.59
LMO3-230ENST00000544276 SCGB1C2P0DMR2 95 aa5.12□□□□□ -1.59
LMO3-230ENST00000544276 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.12□□□□□ -1.59
LMO3-230ENST00000544276 UQCR10Q9UDW1 63 aa5.12□□□□□ -1.59
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LMO3-230ENST00000544276 BAALC-AS2P0C853 105 aa5.1□□□□□ -1.59
LMO3-230ENST00000544276 A8MWP4 228 aa5.08□□□□□ -1.6
LMO3-230ENST00000544276 LINC00846Q9NV44 126 aa5.08□□□□□ -1.6
LMO3-230ENST00000544276 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa5.07□□□□□ -1.6
LMO3-230ENST00000544276 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-230ENST00000544276 PDE6GP18545 87 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-230ENST00000544276 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-230ENST00000544276 C8orf17Q9NRJ1 99 aa5.06□□□□□ -1.6
LMO3-230ENST00000544276 LCE4AQ5TA78 99 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-230ENST00000544276 WFDC13Q8IUB5 93 aa5.05□□□□□ -1.6
LMO3-230ENST00000544276 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa5.04□□□□□ -1.6
LMO3-230ENST00000544276 ATXN8Q156A1 80 aa5.03□□□□□ -1.6
LMO3-230ENST00000544276 LYRM7Q5U5X0 104 aa5.03□□□□□ -1.6
LMO3-230ENST00000544276 Q6ZVQ6 151 aa5.03□□□□□ -1.6
LMO3-230ENST00000544276 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
LMO3-230ENST00000544276 PRR15Q8IV56 129 aa5.02□□□□□ -1.61
LMO3-230ENST00000544276 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.02□□□□□ -1.61
LMO3-230ENST00000544276 M0R143 59 aa4.99□□□□□ -1.61
LMO3-230ENST00000544276 TMEM254Q8TBM7 123 aa4.99□□□□□ -1.61
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LMO3-230ENST00000544276 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa4.98□□□□□ -1.61
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LMO3-230ENST00000544276 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa4.97□□□□□ -1.61
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LMO3-230ENST00000544276 hDV103S1A0JD37 113 aa4.95□□□□□ -1.62
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LMO3-230ENST00000544276 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
LMO3-230ENST00000544276 K7EQZ3 153 aa4.92□□□□□ -1.62
LMO3-230ENST00000544276 NDUFS5O43920 106 aa4.9□□□□□ -1.63
LMO3-230ENST00000544276 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.9□□□□□ -1.63
LMO3-230ENST00000544276 C7orf65Q6ZTY9 151 aa4.9□□□□□ -1.63
LMO3-230ENST00000544276 H3BT86 120 aa4.88□□□□□ -1.63
LMO3-230ENST00000544276 BPY2O14599 106 aa4.88□□□□□ -1.63
LMO3-230ENST00000544276 Q5W150 140 aa4.88□□□□□ -1.63
LMO3-230ENST00000544276 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa4.87□□□□□ -1.63
LMO3-230ENST00000544276 IGKV2-30P06310 120 aa4.87□□□□□ -1.63
LMO3-230ENST00000544276 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.87□□□□□ -1.63
LMO3-230ENST00000544276 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.86□□□□□ -1.63
LMO3-230ENST00000544276 SMIM6P0DI80 62 aa4.85□□□□□ -1.63
LMO3-230ENST00000544276 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.85□□□□□ -1.63
LMO3-230ENST00000544276 CXCL6P80162 114 aa4.83□□□□□ -1.64
LMO3-230ENST00000544276 CASC2Q6XLA1 102 aa4.83□□□□□ -1.64
LMO3-230ENST00000544276 C9orf118A6NHY6 69 aa4.82□□□□□ -1.64
LMO3-230ENST00000544276 HCG22E2RYF7 251 aa4.82□□□□□ -1.64
LMO3-230ENST00000544276 C4orf26Q17RF5 130 aa4.82□□□□□ -1.64
LMO3-230ENST00000544276 TSTD3H0UI37 97 aa4.81□□□□□ -1.64
LMO3-230ENST00000544276 A0A1W2PPM0 123 aa4.8□□□□□ -1.64
LMO3-230ENST00000544276 BATFQ16520 125 aa4.79□□□□□ -1.64
LMO3-230ENST00000544276 Q8N9L7 120 aa4.79□□□□□ -1.64
LMO3-230ENST00000544276 TAX1BP3O14907 124 aa4.78□□□□□ -1.64
LMO3-230ENST00000544276 C5orf47Q569G3 176 aa4.77□□□□□ -1.65
LMO3-230ENST00000544276 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa4.77□□□□□ -1.65
LMO3-230ENST00000544276 SPRR2GQ9BYE4 73 aa4.76□□□□□ -1.65
LMO3-230ENST00000544276 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa4.75□□□□□ -1.65
LMO3-230ENST00000544276 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa4.75□□□□□ -1.65
LMO3-230ENST00000544276 A6NN06 94 aa4.75□□□□□ -1.65
LMO3-230ENST00000544276 MT1BP07438 61 aa4.75□□□□□ -1.65
LMO3-230ENST00000544276 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa4.75□□□□□ -1.65
LMO3-230ENST00000544276 CSAG1Q6PB30 78 aa4.75□□□□□ -1.65
LMO3-230ENST00000544276 Q5VV11 94 aa4.74□□□□□ -1.65
LMO3-230ENST00000544276 UBL5Q9BZL1 73 aa4.74□□□□□ -1.65
LMO3-230ENST00000544276 S4R3F8 94 aa4.74□□□□□ -1.65
LMO3-230ENST00000544276 C1orf64Q8NEQ6 169 aa4.72□□□□□ -1.65
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