RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541869.5

POLR1B-217, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

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Gene POLR1B, Length 5,059 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-217ENST00000541869 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa5.87□□□□□ -1.47
POLR1B-217ENST00000541869 FREM2Q5SZK8 3169 aa5.87□□□□□ -1.47
POLR1B-217ENST00000541869 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
POLR1B-217ENST00000541869 VCANP13611 3396 aa5.86□□□□□ -1.47
POLR1B-217ENST00000541869 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa5.86□□□□□ -1.47
POLR1B-217ENST00000541869 ZANQ9Y493 2812 aa5.86□□□□□ -1.47
POLR1B-217ENST00000541869 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa5.86□□□□□ -1.47
POLR1B-217ENST00000541869 CELSR2Q9HCU4 2923 aa5.85□□□□□ -1.47
POLR1B-217ENST00000541869 NF1P21359 2839 aa5.84□□□□□ -1.47
POLR1B-217ENST00000541869 CYSTM1Q9H1C7 97 aa5.84□□□□□ -1.47
POLR1B-217ENST00000541869 DCHS2Q6V1P9 2916 aa5.82□□□□□ -1.48
POLR1B-217ENST00000541869 ADM2Q7Z4H4 148 aa5.81□□□□□ -1.48
POLR1B-217ENST00000541869 USP34Q70CQ2 3546 aa5.81□□□□□ -1.48
POLR1B-217ENST00000541869 LUZP6Q538Z0 58 aa5.8□□□□□ -1.48
POLR1B-217ENST00000541869 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa5.8□□□□□ -1.48
POLR1B-217ENST00000541869 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
POLR1B-217ENST00000541869 TPRXLQ17RH7 258 aa5.78□□□□□ -1.48
POLR1B-217ENST00000541869 MXRA5Q9NR99 2828 aa5.78□□□□□ -1.48
POLR1B-217ENST00000541869 Q1T7F1 81 aa5.77□□□□□ -1.49
POLR1B-217ENST00000541869 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
POLR1B-217ENST00000541869 A8MUU9 505 aa5.73□□□□□ -1.49
POLR1B-217ENST00000541869 A0A1B0GVY2 172 aa5.71□□□□□ -1.49
POLR1B-217ENST00000541869 DNAH14Q0VDD8 3507 aa5.7□□□□□ -1.5
POLR1B-217ENST00000541869 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa5.7□□□□□ -1.5
POLR1B-217ENST00000541869 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa5.69□□□□□ -1.5
POLR1B-217ENST00000541869 KRTAP10-10P60014 251 aa5.68□□□□□ -1.5
POLR1B-217ENST00000541869 XP32Q5T750 250 aa5.67□□□□□ -1.5
POLR1B-217ENST00000541869 PDZD2O15018 2839 aa5.67□□□□□ -1.5
POLR1B-217ENST00000541869 PRAC1Q96KF2 57 aa5.66□□□□□ -1.5
POLR1B-217ENST00000541869 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.66□□□□□ -1.5
POLR1B-217ENST00000541869 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa5.65□□□□□ -1.51
POLR1B-217ENST00000541869 FBN2P35556 2912 aa5.63□□□□□ -1.51
POLR1B-217ENST00000541869 SPEGQ15772 3267 aa5.62□□□□□ -1.51
POLR1B-217ENST00000541869 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.6□□□□□ -1.51
POLR1B-217ENST00000541869 LOC400499M0QZD8 3231 aa5.57□□□□□ -1.52
POLR1B-217ENST00000541869 VWFP04275 2813 aa5.57□□□□□ -1.52
POLR1B-217ENST00000541869 OTOGQ6ZRI0 2925 aa5.56□□□□□ -1.52
POLR1B-217ENST00000541869 FBN3Q75N90 2809 aa5.55□□□□□ -1.52
POLR1B-217ENST00000541869 KRTAP10-8P60410 259 aa5.54□□□□□ -1.52
POLR1B-217ENST00000541869 Q5VV11 94 aa5.54□□□□□ -1.52
POLR1B-217ENST00000541869 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa5.52□□□□□ -1.53
POLR1B-217ENST00000541869 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
POLR1B-217ENST00000541869 TNP1P09430 55 aa5.5□□□□□ -1.53
POLR1B-217ENST00000541869 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa5.5□□□□□ -1.53
POLR1B-217ENST00000541869 DCHS1Q96JQ0 3298 aa5.48□□□□□ -1.53
POLR1B-217ENST00000541869 TGP01266 2768 aa5.46□□□□□ -1.54
POLR1B-217ENST00000541869 ROMO1P60602 79 aa5.46□□□□□ -1.54
POLR1B-217ENST00000541869 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.45□□□□□ -1.54
POLR1B-217ENST00000541869 A8MU10 97 aa5.41□□□□□ -1.54
POLR1B-217ENST00000541869 MYO15AQ9UKN7 3530 aa5.41□□□□□ -1.54
POLR1B-217ENST00000541869 A0A0A0MQY5 61 aa5.4□□□□□ -1.55
POLR1B-217ENST00000541869 RELNP78509 3460 aa5.38□□□□□ -1.55
POLR1B-217ENST00000541869 A6NN06 94 aa5.37□□□□□ -1.55
POLR1B-217ENST00000541869 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa5.35□□□□□ -1.55
POLR1B-217ENST00000541869 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
POLR1B-217ENST00000541869 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa5.32□□□□□ -1.56
POLR1B-217ENST00000541869 ZFHX3Q15911 3703 aa5.3□□□□□ -1.56
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POLR1B-217ENST00000541869 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa5.22□□□□□ -1.57
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POLR1B-217ENST00000541869 PP632Q6XCG6 107 aa5.16□□□□□ -1.58
POLR1B-217ENST00000541869 MT1HL1P0DM35 61 aa5.14□□□□□ -1.59
POLR1B-217ENST00000541869 ASPMQ8IZT6 3477 aa5.12□□□□□ -1.59
POLR1B-217ENST00000541869 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa5.1□□□□□ -1.59
POLR1B-217ENST00000541869 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.1□□□□□ -1.59
POLR1B-217ENST00000541869 DMDP11532 3685 aa5.06□□□□□ -1.6
POLR1B-217ENST00000541869 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
POLR1B-217ENST00000541869 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.02□□□□□ -1.61
POLR1B-217ENST00000541869 P0C880 135 aa5.02□□□□□ -1.61
POLR1B-217ENST00000541869 COL7A1Q02388 2944 aa5□□□□□ -1.61
POLR1B-217ENST00000541869 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
POLR1B-217ENST00000541869 ZFHX4Q86UP3 3567 aa4.99□□□□□ -1.61
POLR1B-217ENST00000541869 CSMD1Q96PZ7 3565 aa4.99□□□□□ -1.61
POLR1B-217ENST00000541869 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa4.96□□□□□ -1.61
POLR1B-217ENST00000541869 CSMD2Q7Z408 3487 aa4.96□□□□□ -1.62
POLR1B-217ENST00000541869 H0YAA0 97 aa4.96□□□□□ -1.62
POLR1B-217ENST00000541869 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa4.94□□□□□ -1.62
POLR1B-217ENST00000541869 CUBNO60494 3623 aa4.92□□□□□ -1.62
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POLR1B-217ENST00000541869 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa4.8□□□□□ -1.64
POLR1B-217ENST00000541869 SVEP1Q4LDE5 3571 aa4.79□□□□□ -1.64
POLR1B-217ENST00000541869 BSNQ9UPA5 3926 aa4.79□□□□□ -1.64
POLR1B-217ENST00000541869 DNAH9Q9NYC9 4486 aa4.73□□□□□ -1.65
POLR1B-217ENST00000541869 DNHD1Q96M86 4753 aa4.73□□□□□ -1.65
POLR1B-217ENST00000541869 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa4.72□□□□□ -1.65
POLR1B-217ENST00000541869 KRTAP12-2P59991 146 aa4.7□□□□□ -1.66
POLR1B-217ENST00000541869 LORP23490 312 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
POLR1B-217ENST00000541869 KRTAP12-1P59990 96 aa4.67□□□□□ -1.66
POLR1B-217ENST00000541869 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.66□□□□□ -1.66
POLR1B-217ENST00000541869 DNAH11Q96DT5 4516 aa4.65□□□□□ -1.67
POLR1B-217ENST00000541869 DNAH1Q9P2D7 4330 aa4.64□□□□□ -1.67
POLR1B-217ENST00000541869 AKAP9Q99996 3911 aa4.63□□□□□ -1.67
POLR1B-217ENST00000541869 DNAH5Q8TE73 4624 aa4.62□□□□□ -1.67
POLR1B-217ENST00000541869 KRTAP10-12P60413 245 aa4.62□□□□□ -1.67
POLR1B-217ENST00000541869 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa4.61□□□□□ -1.67
POLR1B-217ENST00000541869 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
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