RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530474.5

TSTA3-212, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 5

Gene TSTA3, Length 823 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-212ENST00000530474 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa7.45□□□□□ -1.22
TSTA3-212ENST00000530474 ATOX1O00244 68 aa7.44□□□□□ -1.22
TSTA3-212ENST00000530474 Q96NJ1 140 aa7.44□□□□□ -1.22
TSTA3-212ENST00000530474 HMCN2Q8NDA2 5059 aa7.43□□□□□ -1.22
TSTA3-212ENST00000530474 C8orf87E5RJ46 101 aa7.43□□□□□ -1.22
TSTA3-212ENST00000530474 PCP4P48539 62 aa7.43□□□□□ -1.22
TSTA3-212ENST00000530474 PRR4Q16378 134 aa7.43□□□□□ -1.22
TSTA3-212ENST00000530474 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.42□□□□□ -1.22
TSTA3-212ENST00000530474 DEFB116Q30KQ4 102 aa7.42□□□□□ -1.22
TSTA3-212ENST00000530474 A0A087WVE0 104 aa7.41□□□□□ -1.22
TSTA3-212ENST00000530474 A0A1B0GVX0 72 aa7.41□□□□□ -1.22
TSTA3-212ENST00000530474 DSCR10P59022 87 aa7.41□□□□□ -1.22
TSTA3-212ENST00000530474 PRR15Q8IV56 129 aa7.41□□□□□ -1.22
TSTA3-212ENST00000530474 TNXBP22105 4242 aa7.39□□□□□ -1.23
TSTA3-212ENST00000530474 LINC00313P59037 77 aa7.39□□□□□ -1.23
TSTA3-212ENST00000530474 SMIM20Q8N5G0 67 aa7.39□□□□□ -1.23
TSTA3-212ENST00000530474 RETNLBQ9BQ08 111 aa7.39□□□□□ -1.23
TSTA3-212ENST00000530474 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa7.38□□□□□ -1.23
TSTA3-212ENST00000530474 ANAPC13Q9BS18 74 aa7.38□□□□□ -1.23
TSTA3-212ENST00000530474 K7EQZ3 153 aa7.35□□□□□ -1.23
TSTA3-212ENST00000530474 TPRXLQ17RH7 258 aa7.34□□□□□ -1.23
TSTA3-212ENST00000530474 Q8N9L7 120 aa7.34□□□□□ -1.23
TSTA3-212ENST00000530474 HCG22E2RYF7 251 aa7.33□□□□□ -1.24
TSTA3-212ENST00000530474 C8orf17Q9NRJ1 99 aa7.32□□□□□ -1.24
TSTA3-212ENST00000530474 hDV103S1A0JD37 113 aa7.31□□□□□ -1.24
TSTA3-212ENST00000530474 SERP2Q8N6R1 65 aa7.31□□□□□ -1.24
TSTA3-212ENST00000530474 CASC2Q6XLA1 102 aa7.3□□□□□ -1.24
TSTA3-212ENST00000530474 UBR4Q5T4S7 5183 aa7.29□□□□□ -1.24
TSTA3-212ENST00000530474 TRAV7A0A075B6U4 112 aa7.29□□□□□ -1.24
TSTA3-212ENST00000530474 UQCRQO14949 82 aa7.29□□□□□ -1.24
TSTA3-212ENST00000530474 TMEM254Q8TBM7 123 aa7.29□□□□□ -1.24
TSTA3-212ENST00000530474 COX7CP15954 63 aa7.28□□□□□ -1.24
TSTA3-212ENST00000530474 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa7.27□□□□□ -1.25
TSTA3-212ENST00000530474 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
TSTA3-212ENST00000530474 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa7.25□□□□□ -1.25
TSTA3-212ENST00000530474 C9orf92A6NGG3 77 aa7.25□□□□□ -1.25
TSTA3-212ENST00000530474 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa7.25□□□□□ -1.25
TSTA3-212ENST00000530474 OCR1Q9BZK8 76 aa7.24□□□□□ -1.25
TSTA3-212ENST00000530474 WFDC13Q8IUB5 93 aa7.23□□□□□ -1.25
TSTA3-212ENST00000530474 LRP2P98164 4655 aa7.22□□□□□ -1.25
TSTA3-212ENST00000530474 NDUFS5O43920 106 aa7.22□□□□□ -1.25
TSTA3-212ENST00000530474 Q75L30 129 aa7.22□□□□□ -1.25
TSTA3-212ENST00000530474 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa7.21□□□□□ -1.26
TSTA3-212ENST00000530474 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa7.21□□□□□ -1.26
TSTA3-212ENST00000530474 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
TSTA3-212ENST00000530474 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
TSTA3-212ENST00000530474 XP32Q5T750 250 aa7.18□□□□□ -1.26
TSTA3-212ENST00000530474 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa7.18□□□□□ -1.26
TSTA3-212ENST00000530474 A8MUU9 505 aa7.17□□□□□ -1.26
TSTA3-212ENST00000530474 CCDC179H3BU77 68 aa7.17□□□□□ -1.26
TSTA3-212ENST00000530474 C5orf47Q569G3 176 aa7.17□□□□□ -1.26
TSTA3-212ENST00000530474 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa7.16□□□□□ -1.26
TSTA3-212ENST00000530474 RPL37P61927 97 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
TSTA3-212ENST00000530474 KLKP1Q107X0 134 aa7.14□□□□□ -1.27
TSTA3-212ENST00000530474 H3BPC8 53 aa7.13□□□□□ -1.27
TSTA3-212ENST00000530474 NDUFC1O43677 76 aa7.11□□□□□ -1.27
TSTA3-212ENST00000530474 MP68P56378 58 aa7.11□□□□□ -1.27
TSTA3-212ENST00000530474 C20orf197Q8N268 126 aa7.11□□□□□ -1.27
TSTA3-212ENST00000530474 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
TSTA3-212ENST00000530474 RNF213Q63HN8 5207 aa7.08□□□□□ -1.28
TSTA3-212ENST00000530474 TRAV22A0A0B4J277 110 aa7.07□□□□□ -1.28
TSTA3-212ENST00000530474 A0A0U1RQV1 116 aa7.07□□□□□ -1.28
TSTA3-212ENST00000530474 LPAP08519 4548 aa7.06□□□□□ -1.28
TSTA3-212ENST00000530474 H0Y9P7 68 aa7.04□□□□□ -1.28
TSTA3-212ENST00000530474 TMEM258P61165 79 aa7.03□□□□□ -1.28
TSTA3-212ENST00000530474 PCOTHQ58A44 107 aa7.01□□□□□ -1.29
TSTA3-212ENST00000530474 SNURFQ9Y675 71 aa7.01□□□□□ -1.29
TSTA3-212ENST00000530474 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa7□□□□□ -1.29
TSTA3-212ENST00000530474 H7BZZ5 65 aa7□□□□□ -1.29
TSTA3-212ENST00000530474 LINC00208Q96KT6 92 aa6.99□□□□□ -1.29
TSTA3-212ENST00000530474 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
TSTA3-212ENST00000530474 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.98□□□□□ -1.29
TSTA3-212ENST00000530474 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.98□□□□□ -1.29
TSTA3-212ENST00000530474 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.96□□□□□ -1.3
TSTA3-212ENST00000530474 Q5W150 140 aa6.95□□□□□ -1.3
TSTA3-212ENST00000530474 SPINK7P58062 85 aa6.93□□□□□ -1.3
TSTA3-212ENST00000530474 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.92□□□□□ -1.3
TSTA3-212ENST00000530474 IGKV2-30P06310 120 aa6.92□□□□□ -1.3
TSTA3-212ENST00000530474 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.91□□□□□ -1.3
TSTA3-212ENST00000530474 FAM236CP0DP71 79 aa6.91□□□□□ -1.3
TSTA3-212ENST00000530474 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.91□□□□□ -1.3
TSTA3-212ENST00000530474 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.89□□□□□ -1.31
TSTA3-212ENST00000530474 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.89□□□□□ -1.31
TSTA3-212ENST00000530474 MUC2Q02817 5179 aa6.86□□□□□ -1.31
TSTA3-212ENST00000530474 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
TSTA3-212ENST00000530474 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.79□□□□□ -1.32
TSTA3-212ENST00000530474 A8MUN3 132 aa6.76□□□□□ -1.33
TSTA3-212ENST00000530474 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.75□□□□□ -1.33
TSTA3-212ENST00000530474 MUC17Q685J3 4493 aa6.75□□□□□ -1.33
TSTA3-212ENST00000530474 HRES1P13985 223 aa6.74□□□□□ -1.33
TSTA3-212ENST00000530474 C4orf26Q17RF5 130 aa6.72□□□□□ -1.33
TSTA3-212ENST00000530474 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.7□□□□□ -1.34
TSTA3-212ENST00000530474 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.69□□□□□ -1.34
TSTA3-212ENST00000530474 DMAC1Q96GE9 116 aa6.69□□□□□ -1.34
TSTA3-212ENST00000530474 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.69□□□□□ -1.34
TSTA3-212ENST00000530474 ACYP2P14621 99 aa6.68□□□□□ -1.34
TSTA3-212ENST00000530474 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.68□□□□□ -1.34
TSTA3-212ENST00000530474 SMIM26A0A096LP01 95 aa6.62□□□□□ -1.35
TSTA3-212ENST00000530474 COA5Q86WW8 74 aa6.61□□□□□ -1.35
TSTA3-212ENST00000530474 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 168.9 ms