RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514141.5

POLK-215, Transcript of DNA polymerase kappa, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene POLK, Length 4,345 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLK-215ENST00000514141 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
POLK-215ENST00000514141 A0A1B0GVY2 172 aa3.32□□□□□ -1.88
POLK-215ENST00000514141 HIVEP1P15822 2718 aa3.31□□□□□ -1.88
POLK-215ENST00000514141 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa3.31□□□□□ -1.88
POLK-215ENST00000514141 FLNCQ14315 2725 aa3.31□□□□□ -1.88
POLK-215ENST00000514141 C9orf92A6NGG3 77 aa3.31□□□□□ -1.88
POLK-215ENST00000514141 TPRXLQ17RH7 258 aa3.31□□□□□ -1.88
POLK-215ENST00000514141 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-215ENST00000514141 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
POLK-215ENST00000514141 A0A1B0GU33 70 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-215ENST00000514141 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
POLK-215ENST00000514141 A0A0G2JQZ4 141 aa3.29□□□□□ -1.88
POLK-215ENST00000514141 C4orf26Q17RF5 130 aa3.29□□□□□ -1.88
POLK-215ENST00000514141 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa3.29□□□□□ -1.88
POLK-215ENST00000514141 ANK2Q01484 3957 aa3.29□□□□□ -1.88
POLK-215ENST00000514141 COL6A5A8TX70 2615 aa3.28□□□□□ -1.88
POLK-215ENST00000514141 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.28□□□□□ -1.88
POLK-215ENST00000514141 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa3.28□□□□□ -1.88
POLK-215ENST00000514141 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa3.28□□□□□ -1.88
POLK-215ENST00000514141 DSPP15924 2871 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
POLK-215ENST00000514141 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
POLK-215ENST00000514141 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
POLK-215ENST00000514141 CELSR2Q9HCU4 2923 aa3.27□□□□□ -1.89
POLK-215ENST00000514141 M0QZ58 72 aa3.27□□□□□ -1.89
POLK-215ENST00000514141 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP3.26□□□□□ -1.89
POLK-215ENST00000514141 PDZD2O15018 2839 aa3.26□□□□□ -1.89
POLK-215ENST00000514141 LCA10Q71F78 164 aa3.25□□□□□ -1.89
POLK-215ENST00000514141 CRIPTQ9P021 101 aa3.24□□□□□ -1.89
POLK-215ENST00000514141 KRTAP10-8P60410 259 aa3.24□□□□□ -1.89
POLK-215ENST00000514141 SPATA8Q6RVD6 105 aa3.24□□□□□ -1.89
POLK-215ENST00000514141 ITPR1Q14643 2758 aa3.23□□□□□ -1.89
POLK-215ENST00000514141 Q5VV11 94 aa3.23□□□□□ -1.89
POLK-215ENST00000514141 STAB1Q9NY15 2570 aa3.22□□□□□ -1.89
POLK-215ENST00000514141 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa3.22□□□□□ -1.89
POLK-215ENST00000514141 XP32Q5T750 250 aa3.21□□□□□ -1.9
POLK-215ENST00000514141 CENPEQ02224 2701 aa3.21□□□□□ -1.9
POLK-215ENST00000514141 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa3.21□□□□□ -1.9
POLK-215ENST00000514141 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.2□□□□□ -1.9
POLK-215ENST00000514141 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.2□□□□□ -1.9
POLK-215ENST00000514141 CMYA5Q8N3K9 4069 aa3.2□□□□□ -1.9
POLK-215ENST00000514141 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa3.17□□□□□ -1.9
POLK-215ENST00000514141 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
POLK-215ENST00000514141 H0YAA0 97 aa3.16□□□□□ -1.9
POLK-215ENST00000514141 CYSTM1Q9H1C7 97 aa3.16□□□□□ -1.9
POLK-215ENST00000514141 NOTCH1P46531 2555 aa3.14□□□□□ -1.91
POLK-215ENST00000514141 R4GN34 69 aa3.14□□□□□ -1.91
POLK-215ENST00000514141 LYSTQ99698 3801 aa3.13□□□□□ -1.91
POLK-215ENST00000514141 TENM4Q6N022 2769 aa3.13□□□□□ -1.91
POLK-215ENST00000514141 ROMO1P60602 79 aa3.12□□□□□ -1.91
POLK-215ENST00000514141 LRBAP50851 2863 aa3.1□□□□□ -1.91
POLK-215ENST00000514141 FBN2P35556 2912 aa3.1□□□□□ -1.91
POLK-215ENST00000514141 PP632Q6XCG6 107 aa3.09□□□□□ -1.91
POLK-215ENST00000514141 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa3.09□□□□□ -1.91
POLK-215ENST00000514141 ALMS1Q8TCU4 4167 aa3.09□□□□□ -1.92
POLK-215ENST00000514141 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa3.09□□□□□ -1.92
POLK-215ENST00000514141 STAB2Q8WWQ8 2551 aa3.08□□□□□ -1.92
POLK-215ENST00000514141 PLAC4Q8WY50 150 aa3.07□□□□□ -1.92
POLK-215ENST00000514141 ADM2Q7Z4H4 148 aa3.06□□□□□ -1.92
POLK-215ENST00000514141 SPINT4Q6UDR6 99 aa3.06□□□□□ -1.92
POLK-215ENST00000514141 M0R2T5 61 aa3.05□□□□□ -1.92
POLK-215ENST00000514141 MXRA5Q9NR99 2828 aa3.05□□□□□ -1.92
POLK-215ENST00000514141 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
POLK-215ENST00000514141 TACC2O95359 2948 aa3.04□□□□□ -1.92
POLK-215ENST00000514141 A6NN06 94 aa3.04□□□□□ -1.92
POLK-215ENST00000514141 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
POLK-215ENST00000514141 OTOGQ6ZRI0 2925 aa3.03□□□□□ -1.92
POLK-215ENST00000514141 ZANQ9Y493 2812 aa3.02□□□□□ -1.93
POLK-215ENST00000514141 DNAH7Q8WXX0 4024 aa3.02□□□□□ -1.93
POLK-215ENST00000514141 LINC01554Q52M75 96 aa3.02□□□□□ -1.93
POLK-215ENST00000514141 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa3.02□□□□□ -1.93
POLK-215ENST00000514141 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
POLK-215ENST00000514141 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.01□□□□□ -1.93
POLK-215ENST00000514141 LUZP6Q538Z0 58 aa3□□□□□ -1.93
POLK-215ENST00000514141 A0A0D9SG42 100 aa2.99□□□□□ -1.93
POLK-215ENST00000514141 TNP1P09430 55 aa2.98□□□□□ -1.93
POLK-215ENST00000514141 LCE2BO14633 110 aa2.97□□□□□ -1.93
POLK-215ENST00000514141 FRAS1Q86XX4 4008 aa2.96□□□□□ -1.94
POLK-215ENST00000514141 MT1HL1P0DM35 61 aa2.95□□□□□ -1.94
POLK-215ENST00000514141 PRO2289Q9P1D8 64 aa2.94□□□□□ -1.94
POLK-215ENST00000514141 DNAH3Q8TD57 4116 aa2.93□□□□□ -1.94
POLK-215ENST00000514141 TENM3Q9P273 2699 aa2.93□□□□□ -1.94
POLK-215ENST00000514141 COL7A1Q02388 2944 aa2.92□□□□□ -1.94
POLK-215ENST00000514141 DNAH10Q8IVF4 4471 aa2.92□□□□□ -1.94
POLK-215ENST00000514141 DNAH6Q9C0G6 4158 aa2.92□□□□□ -1.94
POLK-215ENST00000514141 KRTAP23-1A1A580 65 aa2.9□□□□□ -1.95
POLK-215ENST00000514141 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
POLK-215ENST00000514141 NF1P21359 2839 aa2.89□□□□□ -1.95
POLK-215ENST00000514141 DNAH1Q9P2D7 4330 aa2.88□□□□□ -1.95
POLK-215ENST00000514141 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa2.88□□□□□ -1.95
POLK-215ENST00000514141 DNAH2Q9P225 4427 aa2.88□□□□□ -1.95
POLK-215ENST00000514141 VWFP04275 2813 aa2.86□□□□□ -1.95
POLK-215ENST00000514141 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
POLK-215ENST00000514141 TENM1Q9UKZ4 2725 aa2.85□□□□□ -1.95
POLK-215ENST00000514141 DNHD1Q96M86 4753 aa2.83□□□□□ -1.96
POLK-215ENST00000514141 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa2.83□□□□□ -1.96
POLK-215ENST00000514141 FAT2Q9NYQ8 4349 aa2.83□□□□□ -1.96
POLK-215ENST00000514141 A0A0A0MQY5 61 aa2.83□□□□□ -1.96
POLK-215ENST00000514141 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa2.82□□□□□ -1.96
POLK-215ENST00000514141 DNAH9Q9NYC9 4486 aa2.81□□□□□ -1.96
POLK-215ENST00000514141 VPS13DQ5THJ4 4388 aa2.81□□□□□ -1.96
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