RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513593.1

RUFY3-211, Transcript of RUN and FYVE domain containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene RUFY3, Length 356 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3-211ENST00000513593 NCR2O95944 276 aa-0.03□□□□□ -2.41
RUFY3-211ENST00000513593 SLC25A6P12236 298 aa-0.03□□□□□ -2.41
RUFY3-211ENST00000513593 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RUFY3-211ENST00000513593 PPP3R1P63098 170 aa-0.03□□□□□ -2.41
RUFY3-211ENST00000513593 CCDC153Q494R4 210 aa-0.03□□□□□ -2.41
RUFY3-211ENST00000513593 CCDC58Q4VC31 144 aa-0.03□□□□□ -2.41
RUFY3-211ENST00000513593 MORN2Q502X0 79 aa-0.03□□□□□ -2.41
RUFY3-211ENST00000513593 SPANXN1Q5VSR9 72 aa-0.03□□□□□ -2.41
RUFY3-211ENST00000513593 CFAP126Q5VTH2 177 aa-0.03□□□□□ -2.41
RUFY3-211ENST00000513593 Q6AWC8 147 aa-0.03□□□□□ -2.41
RUFY3-211ENST00000513593 SMIM15Q7Z3B0 74 aa-0.03□□□□□ -2.41
RUFY3-211ENST00000513593 COMMD6Q7Z4G1 85 aa-0.03□□□□□ -2.41
RUFY3-211ENST00000513593 TSC22D3Q99576 134 aa-0.03□□□□□ -2.41
RUFY3-211ENST00000513593 C2orf88Q9BSF0 95 aa-0.03□□□□□ -2.41
RUFY3-211ENST00000513593 NMES1Q9C002 83 aa-0.03□□□□□ -2.41
RUFY3-211ENST00000513593 HIGD1AQ9Y241 93 aa-0.03□□□□□ -2.41
RUFY3-211ENST00000513593 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa-0.04□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa-0.04□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa-0.04□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa-0.04□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa-0.04□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 FAM24AA6NFZ4 105 aa-0.04□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 A6NIN4 97 aa-0.04□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 CEBPZOSA8MTT3 80 aa-0.04□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 F8VRH5 84 aa-0.04□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa-0.04□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 H3BVH4 76 aa-0.04□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 IFNGP01579 166 aa-0.04□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 TSPAN19P0C672 248 aa-0.04□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 LINC00158P58513 81 aa-0.04□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 RPS28P62857 69 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa-0.04□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 MEIG1Q5JSS6 88 aa-0.04□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa-0.04□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 Q6JHZ5 121 aa-0.04□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 ALKAL2Q6UX46 152 aa-0.04□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 Q8IZM0 81 aa-0.04□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 SPTSSBQ8NFR3 76 aa-0.04□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 CNFNQ9BYD5 112 aa-0.04□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 TMEM191AQ9H0A3 160 aa-0.04□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa-0.04□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 TAS2R8Q9NYW2 309 aa-0.04□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 C6orf48Q9UBA6 75 aa-0.04□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 SPCS1Q9Y6A9 102 aa-0.04□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 A0A087WXM4 84 aa-0.05□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa-0.05□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa-0.05□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 A0A1B0GWA3 101 aa-0.05□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 hADV29S1A0JD25 119 aa-0.05□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 IGLC7A0M8Q6 106 aa-0.05□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 D6R8Y8 96 aa-0.05□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 F6UZH7 168 aa-0.05□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 J3KT08 172 aa-0.05□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 K7EIM0 57 aa-0.05□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 NMBP08949 121 aa-0.05□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 IGLC6P0CF74 106 aa-0.05□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 UBE2G1P62253 170 aa-0.05□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 RPL38P63173 70 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 SEC11AP67812 179 aa-0.05□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 PIGYQ3MUY2 71 aa-0.05□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa-0.05□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 Q6ZRX8 168 aa-0.05□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 PFDN5Q99471 154 aa-0.05□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 C12orf57Q99622 126 aa-0.05□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 VPS25Q9BRG1 176 aa-0.05□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 SNHG12Q9BXW3 62 aa-0.05□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 LINC00472Q9H8W2 130 aa-0.05□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 AP4S1Q9Y587 144 aa-0.05□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 TMEM218A2RU14 115 aa-0.06□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 LINC00587B1AMM8 73 aa-0.06□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa-0.06□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 TSTD3H0UI37 97 aa-0.06□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa-0.06□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 I3L3M4 83 aa-0.06□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 M0R3E3 92 aa-0.06□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 DPM2O94777 84 aa-0.06□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 MT-ND4LP03901 98 aa-0.06□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 ARMS2P0C7Q2 107 aa-0.06□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 IGLC1P0CG04 106 aa-0.06□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 COX7BP24311 80 aa-0.06□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 S100A3P33764 101 aa-0.06□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 SPRR1AP35321 89 aa-0.06□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 WT1-ASQ06250 92 aa-0.06□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 SMCO1Q147U7 214 aa-0.06□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 TMEM244Q5VVB8 128 aa-0.06□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 C10orf113Q5VZT2 155 aa-0.06□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 SFTA2Q6UW10 78 aa-0.06□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 BAGE3Q86Y29 109 aa-0.06□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 TCTE3Q8IZS6 198 aa-0.06□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 COX7B2Q8TF08 81 aa-0.06□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 C1orf54Q8WWF1 131 aa-0.06□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 S100ZQ8WXG8 99 aa-0.06□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 MAFIPQ8WZ33 124 aa-0.06□□□□□ -2.42
RUFY3-211ENST00000513593 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 145 ms