RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494420.1

HOXB-AS3-215, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 431 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ATXN8Q156A1 80 aa9.78□□□□□ -0.84
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 FAM236CP0DP71 79 aa9.77□□□□□ -0.85
HOXB-AS3-215ENST00000494420 J3KT08 172 aa9.76□□□□□ -0.85
HOXB-AS3-215ENST00000494420 Q6ZQT0 140 aa9.75□□□□□ -0.85
HOXB-AS3-215ENST00000494420 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa9.73□□□□□ -0.85
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa9.73□□□□□ -0.85
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 C14orf132Q9NPU4 83 aa9.64□□□□□ -0.87
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 MT1FP04733 61 aa9.44□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-215ENST00000494420 USH2AO75445 5202 aa9.43□□□□□ -0.9
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa9.42□□□□□ -0.9
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 K7EQZ3 153 aa9.41□□□□□ -0.9
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa9.36□□□□□ -0.91
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 C7orf65Q6ZTY9 151 aa9.22□□□□□ -0.93
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa9.04□□□□□ -0.96
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa9.01□□□□□ -0.97
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 C5orf47Q569G3 176 aa8.96□□□□□ -0.98
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 CSAG1Q6PB30 78 aa8.88□□□□□ -0.99
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa8.8□□□□□ -1
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HOXB-AS3-215ENST00000494420 TRAV22A0A0B4J277 110 aa8.74□□□□□ -1.01
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa8.72□□□□□ -1.01
HOXB-AS3-215ENST00000494420 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa8.69□□□□□ -1.02
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa8.69□□□□□ -1.02
HOXB-AS3-215ENST00000494420 Q5VV11 94 aa8.68□□□□□ -1.02
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SPRR2GQ9BYE4 73 aa8.67□□□□□ -1.02
HOXB-AS3-215ENST00000494420 UQCRQO14949 82 aa8.66□□□□□ -1.02
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KLKP1Q107X0 134 aa8.66□□□□□ -1.02
HOXB-AS3-215ENST00000494420 A0A087WVE0 104 aa8.65□□□□□ -1.02
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