RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494037.1

TSPAN7-208, Transcript of tetraspanin 7, humanhuman

TSL 4

Gene TSPAN7, Length 575 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN7-208ENST00000494037 CRCT1Q9UGL9 99 aa4.23□□□□□ -1.73
TSPAN7-208ENST00000494037 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa4.22□□□□□ -1.73
TSPAN7-208ENST00000494037 BAALC-AS2P0C853 105 aa4.22□□□□□ -1.73
TSPAN7-208ENST00000494037 DSCR8Q96T75 97 aa4.22□□□□□ -1.73
TSPAN7-208ENST00000494037 USH2AO75445 5202 aa4.21□□□□□ -1.74
TSPAN7-208ENST00000494037 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa4.21□□□□□ -1.74
TSPAN7-208ENST00000494037 A0A1B0GVX0 72 aa4.2□□□□□ -1.74
TSPAN7-208ENST00000494037 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa4.19□□□□□ -1.74
TSPAN7-208ENST00000494037 C9JAW5 83 aa4.19□□□□□ -1.74
TSPAN7-208ENST00000494037 ATXN8Q156A1 80 aa4.19□□□□□ -1.74
TSPAN7-208ENST00000494037 C8orf87E5RJ46 101 aa4.18□□□□□ -1.74
TSPAN7-208ENST00000494037 HRES1P13985 223 aa4.18□□□□□ -1.74
TSPAN7-208ENST00000494037 Q6ZQT0 140 aa4.18□□□□□ -1.74
TSPAN7-208ENST00000494037 SSPOA2VEC9 5147 aa4.18□□□□□ -1.74
TSPAN7-208ENST00000494037 MPLKIPQ8TAP9 179 aa4.17□□□□□ -1.74
TSPAN7-208ENST00000494037 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa4.16□□□□□ -1.74
TSPAN7-208ENST00000494037 J3KT08 172 aa4.16□□□□□ -1.74
TSPAN7-208ENST00000494037 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa4.15□□□□□ -1.75
TSPAN7-208ENST00000494037 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa4.15□□□□□ -1.75
TSPAN7-208ENST00000494037 FAM236CP0DP71 79 aa4.15□□□□□ -1.75
TSPAN7-208ENST00000494037 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa4.15□□□□□ -1.75
TSPAN7-208ENST00000494037 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa4.15□□□□□ -1.75
TSPAN7-208ENST00000494037 C14orf132Q9NPU4 83 aa4.15□□□□□ -1.75
TSPAN7-208ENST00000494037 BATFQ16520 125 aa4.14□□□□□ -1.75
TSPAN7-208ENST00000494037 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
TSPAN7-208ENST00000494037 A8MWP4 228 aa4.13□□□□□ -1.75
TSPAN7-208ENST00000494037 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa4.12□□□□□ -1.75
TSPAN7-208ENST00000494037 LYRM7Q5U5X0 104 aa4.12□□□□□ -1.75
TSPAN7-208ENST00000494037 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
TSPAN7-208ENST00000494037 C8orf17Q9NRJ1 99 aa4.12□□□□□ -1.75
TSPAN7-208ENST00000494037 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa4.12□□□□□ -1.75
TSPAN7-208ENST00000494037 A0A1B0GW54 56 aa4.11□□□□□ -1.75
TSPAN7-208ENST00000494037 NDUFB1O75438 58 aa4.11□□□□□ -1.75
TSPAN7-208ENST00000494037 MT2AP02795 61 aa4.11□□□□□ -1.75
TSPAN7-208ENST00000494037 PDE6GP18545 87 aa4.11□□□□□ -1.75
TSPAN7-208ENST00000494037 SPINK7P58062 85 aa4.1□□□□□ -1.75
TSPAN7-208ENST00000494037 MTURNQ8N3F0 131 aa4.1□□□□□ -1.75
TSPAN7-208ENST00000494037 C9orf118A6NHY6 69 aa4.09□□□□□ -1.75
TSPAN7-208ENST00000494037 TAX1BP3O14907 124 aa4.09□□□□□ -1.75
TSPAN7-208ENST00000494037 PCP4P48539 62 aa4.09□□□□□ -1.75
TSPAN7-208ENST00000494037 A0A1W2PPM0 123 aa4.08□□□□□ -1.76
TSPAN7-208ENST00000494037 MT1FP04733 61 aa4.08□□□□□ -1.76
TSPAN7-208ENST00000494037 NREPQ16612 68 aa4.08□□□□□ -1.76
TSPAN7-208ENST00000494037 Q6ZVQ6 151 aa4.08□□□□□ -1.76
TSPAN7-208ENST00000494037 PRR15Q8IV56 129 aa4.08□□□□□ -1.76
TSPAN7-208ENST00000494037 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa4.07□□□□□ -1.76
TSPAN7-208ENST00000494037 H3BT86 120 aa4.07□□□□□ -1.76
TSPAN7-208ENST00000494037 K7EQZ3 153 aa4.06□□□□□ -1.76
TSPAN7-208ENST00000494037 K7ERU9 68 aa4.06□□□□□ -1.76
TSPAN7-208ENST00000494037 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa4.06□□□□□ -1.76
TSPAN7-208ENST00000494037 WFDC13Q8IUB5 93 aa4.06□□□□□ -1.76
TSPAN7-208ENST00000494037 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
TSPAN7-208ENST00000494037 TMEM254Q8TBM7 123 aa4.05□□□□□ -1.76
TSPAN7-208ENST00000494037 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
TSPAN7-208ENST00000494037 hDV103S1A0JD37 113 aa4.02□□□□□ -1.77
TSPAN7-208ENST00000494037 KRTAP10-10P60014 251 aa4.02□□□□□ -1.77
TSPAN7-208ENST00000494037 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa4.02□□□□□ -1.77
TSPAN7-208ENST00000494037 SPCS1Q9Y6A9 102 aa4.02□□□□□ -1.77
TSPAN7-208ENST00000494037 BPY2O14599 106 aa4.01□□□□□ -1.77
TSPAN7-208ENST00000494037 Q8N9L7 120 aa4.01□□□□□ -1.77
TSPAN7-208ENST00000494037 K7EP34 96 aa4□□□□□ -1.77
TSPAN7-208ENST00000494037 NDUFS5O43920 106 aa4□□□□□ -1.77
TSPAN7-208ENST00000494037 J3QR89 54 aa3.99□□□□□ -1.77
TSPAN7-208ENST00000494037 SCGB1A1P11684 91 aa3.98□□□□□ -1.77
TSPAN7-208ENST00000494037 PRO0461Q9UI25 63 aa3.98□□□□□ -1.77
TSPAN7-208ENST00000494037 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa3.97□□□□□ -1.77
TSPAN7-208ENST00000494037 IGKV2-30P06310 120 aa3.97□□□□□ -1.77
TSPAN7-208ENST00000494037 Q5W150 140 aa3.97□□□□□ -1.77
TSPAN7-208ENST00000494037 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
TSPAN7-208ENST00000494037 F8W1H4 67 aa3.96□□□□□ -1.78
TSPAN7-208ENST00000494037 CASC2Q6XLA1 102 aa3.96□□□□□ -1.78
TSPAN7-208ENST00000494037 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
TSPAN7-208ENST00000494037 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
TSPAN7-208ENST00000494037 HCG22E2RYF7 251 aa3.95□□□□□ -1.78
TSPAN7-208ENST00000494037 C7orf65Q6ZTY9 151 aa3.95□□□□□ -1.78
TSPAN7-208ENST00000494037 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa3.95□□□□□ -1.78
TSPAN7-208ENST00000494037 LINC00846Q9NV44 126 aa3.95□□□□□ -1.78
TSPAN7-208ENST00000494037 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa3.94□□□□□ -1.78
TSPAN7-208ENST00000494037 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.93□□□□□ -1.78
TSPAN7-208ENST00000494037 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.93□□□□□ -1.78
TSPAN7-208ENST00000494037 H3BS24 57 aa3.92□□□□□ -1.78
TSPAN7-208ENST00000494037 UBL5Q9BZL1 73 aa3.92□□□□□ -1.78
TSPAN7-208ENST00000494037 CXCL6P80162 114 aa3.91□□□□□ -1.78
TSPAN7-208ENST00000494037 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.9□□□□□ -1.79
TSPAN7-208ENST00000494037 C4orf26Q17RF5 130 aa3.9□□□□□ -1.79
TSPAN7-208ENST00000494037 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa3.87□□□□□ -1.79
TSPAN7-208ENST00000494037 ETDBQ3ZM63 59 aa3.86□□□□□ -1.79
TSPAN7-208ENST00000494037 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa3.86□□□□□ -1.79
TSPAN7-208ENST00000494037 C5orf47Q569G3 176 aa3.83□□□□□ -1.8
TSPAN7-208ENST00000494037 C1orf64Q8NEQ6 169 aa3.81□□□□□ -1.8
TSPAN7-208ENST00000494037 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa3.81□□□□□ -1.8
TSPAN7-208ENST00000494037 S4R3F8 94 aa3.81□□□□□ -1.8
TSPAN7-208ENST00000494037 LCA10Q71F78 164 aa3.8□□□□□ -1.8
TSPAN7-208ENST00000494037 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa3.77□□□□□ -1.81
TSPAN7-208ENST00000494037 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa3.77□□□□□ -1.81
TSPAN7-208ENST00000494037 SVIPQ8NHG7 77 aa3.77□□□□□ -1.81
TSPAN7-208ENST00000494037 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa3.76□□□□□ -1.81
TSPAN7-208ENST00000494037 MT-ATP8P03928 68 aa3.76□□□□□ -1.81
TSPAN7-208ENST00000494037 ACYP1P07311 99 aa3.76□□□□□ -1.81
TSPAN7-208ENST00000494037 CSAG1Q6PB30 78 aa3.76□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.4 ms