RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488774.1

PTPRD-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRD, Length 420 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-212ENST00000488774 DSCR10P59022 87 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRD-212ENST00000488774 ANKRD29Q8N6D5 301 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRD-212ENST00000488774 A0A1W2PPM0 123 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRD-212ENST00000488774 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRD-212ENST00000488774 C9JAW5 83 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRD-212ENST00000488774 CCKP06307 115 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRD-212ENST00000488774 Q6ZQT0 140 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRD-212ENST00000488774 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
PTPRD-212ENST00000488774 ATXN8Q156A1 80 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRD-212ENST00000488774 VPS25Q9BRG1 176 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRD-212ENST00000488774 C14orf132Q9NPU4 83 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRD-212ENST00000488774 MT1HP80294 61 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRD-212ENST00000488774 RBM3P98179 157 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
PTPRD-212ENST00000488774 PRO0461Q9UI25 63 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRD-212ENST00000488774 A0A1B0GV90 55 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRD-212ENST00000488774 A8MUU9 505 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRD-212ENST00000488774 SNCGO76070 127 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRD-212ENST00000488774 IGKV4-1P06312 121 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRD-212ENST00000488774 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRD-212ENST00000488774 Q75L30 129 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRD-212ENST00000488774 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRD-212ENST00000488774 SIGMAR1Q99720 223 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRD-212ENST00000488774 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRD-212ENST00000488774 SS18L2Q9UHA2 77 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRD-212ENST00000488774 H3BQ85 93 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRD-212ENST00000488774 DSCR8Q96T75 97 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRD-212ENST00000488774 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRD-212ENST00000488774 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRD-212ENST00000488774 SPCS1Q9Y6A9 102 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRD-212ENST00000488774 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRD-212ENST00000488774 A0A1B0GVX0 72 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRD-212ENST00000488774 LINC00313P59037 77 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRD-212ENST00000488774 H3BT86 120 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRD-212ENST00000488774 K7EP34 96 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRD-212ENST00000488774 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRD-212ENST00000488774 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRD-212ENST00000488774 HRES1P13985 223 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRD-212ENST00000488774 Q8N9L7 120 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRD-212ENST00000488774 A0A0U1RQV1 116 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRD-212ENST00000488774 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRD-212ENST00000488774 K7EQZ3 153 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRD-212ENST00000488774 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
PTPRD-212ENST00000488774 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRD-212ENST00000488774 LYRM7Q5U5X0 104 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRD-212ENST00000488774 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRD-212ENST00000488774 MPLKIPQ8TAP9 179 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRD-212ENST00000488774 C8orf17Q9NRJ1 99 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRD-212ENST00000488774 A8MWP4 228 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRD-212ENST00000488774 BPY2O14599 106 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRD-212ENST00000488774 LINC00846Q9NV44 126 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRD-212ENST00000488774 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRD-212ENST00000488774 Q6ZVQ6 151 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRD-212ENST00000488774 PRR15Q8IV56 129 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRD-212ENST00000488774 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
PTPRD-212ENST00000488774 PDE6GP18545 87 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRD-212ENST00000488774 NREPQ16612 68 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRD-212ENST00000488774 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa3.27□□□□□ -1.89
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PTPRD-212ENST00000488774 Q5W150 140 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRD-212ENST00000488774 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRD-212ENST00000488774 J3KT08 172 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRD-212ENST00000488774 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRD-212ENST00000488774 A0A1B0GW54 56 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRD-212ENST00000488774 COX6B2Q6YFQ2 88 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRD-212ENST00000488774 SPINK7P58062 85 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRD-212ENST00000488774 WFDC13Q8IUB5 93 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRD-212ENST00000488774 TMEM254Q8TBM7 123 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRD-212ENST00000488774 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
PTPRD-212ENST00000488774 hDV103S1A0JD37 113 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRD-212ENST00000488774 KRTAP23-1A1A580 65 aa3.21□□□□□ -1.9
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PTPRD-212ENST00000488774 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRD-212ENST00000488774 K7ERU9 68 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRD-212ENST00000488774 M0R2T5 61 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRD-212ENST00000488774 MT2AP02795 61 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRD-212ENST00000488774 MT1FP04733 61 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRD-212ENST00000488774 PCP4P48539 62 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRD-212ENST00000488774 FSIP2Q5CZC0 6907 aa3.19□□□□□ -1.9
PTPRD-212ENST00000488774 USH2AO75445 5202 aa3.18□□□□□ -1.9
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PTPRD-212ENST00000488774 CASC2Q6XLA1 102 aa3.17□□□□□ -1.9
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PTPRD-212ENST00000488774 SSPOA2VEC9 5147 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRD-212ENST00000488774 A0A087WVE0 104 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRD-212ENST00000488774 SCGB1A1P11684 91 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRD-212ENST00000488774 CXCL6P80162 114 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRD-212ENST00000488774 C4orf26Q17RF5 130 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRD-212ENST00000488774 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRD-212ENST00000488774 CRCT1Q9UGL9 99 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRD-212ENST00000488774 J3QR89 54 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRD-212ENST00000488774 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRD-212ENST00000488774 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa3.09□□□□□ -1.91
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