RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487538.1

GTPBP1-211, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 358 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-211ENST00000487538 HCG22E2RYF7 251 aa6.04□□□□□ -1.44
GTPBP1-211ENST00000487538 NDUFB1O75438 58 aa6.04□□□□□ -1.44
GTPBP1-211ENST00000487538 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.04□□□□□ -1.44
GTPBP1-211ENST00000487538 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.03□□□□□ -1.44
GTPBP1-211ENST00000487538 Q5XG85 94 aa6.02□□□□□ -1.45
GTPBP1-211ENST00000487538 TNXBP22105 4242 aa6.01□□□□□ -1.45
GTPBP1-211ENST00000487538 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.01□□□□□ -1.45
GTPBP1-211ENST00000487538 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.01□□□□□ -1.45
GTPBP1-211ENST00000487538 LIMD2Q9BT23 127 aa6.01□□□□□ -1.45
GTPBP1-211ENST00000487538 WFDC13Q8IUB5 93 aa6□□□□□ -1.45
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A1B0GVX0 72 aa5.99□□□□□ -1.45
GTPBP1-211ENST00000487538 CASC2Q6XLA1 102 aa5.99□□□□□ -1.45
GTPBP1-211ENST00000487538 OCR1Q9BZK8 76 aa5.99□□□□□ -1.45
GTPBP1-211ENST00000487538 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa5.98□□□□□ -1.45
GTPBP1-211ENST00000487538 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
GTPBP1-211ENST00000487538 SPINK1P00995 79 aa5.98□□□□□ -1.45
GTPBP1-211ENST00000487538 LINC00304Q8N9R0 145 aa5.98□□□□□ -1.45
GTPBP1-211ENST00000487538 SPAG11AQ6PDA7 123 aa5.97□□□□□ -1.45
GTPBP1-211ENST00000487538 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa5.96□□□□□ -1.46
GTPBP1-211ENST00000487538 RPS29P62273 56 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
GTPBP1-211ENST00000487538 C8orf17Q9NRJ1 99 aa5.96□□□□□ -1.46
GTPBP1-211ENST00000487538 C1orf195Q5TG92 126 aa5.95□□□□□ -1.46
GTPBP1-211ENST00000487538 UBR4Q5T4S7 5183 aa5.94□□□□□ -1.46
GTPBP1-211ENST00000487538 hDV103S1A0JD37 113 aa5.94□□□□□ -1.46
GTPBP1-211ENST00000487538 C20orf197Q8N268 126 aa5.93□□□□□ -1.46
GTPBP1-211ENST00000487538 C8orf87E5RJ46 101 aa5.92□□□□□ -1.46
GTPBP1-211ENST00000487538 J3QL48 77 aa5.92□□□□□ -1.46
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM254Q8TBM7 123 aa5.91□□□□□ -1.46
GTPBP1-211ENST00000487538 KLKP1Q107X0 134 aa5.9□□□□□ -1.46
GTPBP1-211ENST00000487538 OXTP01178 125 aa5.89□□□□□ -1.47
GTPBP1-211ENST00000487538 C5orf47Q569G3 176 aa5.89□□□□□ -1.47
GTPBP1-211ENST00000487538 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa5.89□□□□□ -1.47
GTPBP1-211ENST00000487538 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
GTPBP1-211ENST00000487538 CYSTM1Q9H1C7 97 aa5.89□□□□□ -1.47
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A0U1RQV1 116 aa5.88□□□□□ -1.47
GTPBP1-211ENST00000487538 MT1HL1P0DM35 61 aa5.88□□□□□ -1.47
GTPBP1-211ENST00000487538 SNURFQ9Y675 71 aa5.88□□□□□ -1.47
GTPBP1-211ENST00000487538 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa5.87□□□□□ -1.47
GTPBP1-211ENST00000487538 MP68P56378 58 aa5.86□□□□□ -1.47
GTPBP1-211ENST00000487538 LINC00313P59037 77 aa5.86□□□□□ -1.47
GTPBP1-211ENST00000487538 NDUFC1O43677 76 aa5.85□□□□□ -1.47
GTPBP1-211ENST00000487538 NDUFS5O43920 106 aa5.85□□□□□ -1.47
GTPBP1-211ENST00000487538 H0Y9P7 68 aa5.84□□□□□ -1.47
GTPBP1-211ENST00000487538 KRTAP10-8P60410 259 aa5.84□□□□□ -1.47
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM258P61165 79 aa5.84□□□□□ -1.47
GTPBP1-211ENST00000487538 TRAV22A0A0B4J277 110 aa5.83□□□□□ -1.48
GTPBP1-211ENST00000487538 H3BPC8 53 aa5.83□□□□□ -1.48
GTPBP1-211ENST00000487538 H7BZZ5 65 aa5.83□□□□□ -1.48
GTPBP1-211ENST00000487538 LRP2P98164 4655 aa5.83□□□□□ -1.48
GTPBP1-211ENST00000487538 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
GTPBP1-211ENST00000487538 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa5.8□□□□□ -1.48
GTPBP1-211ENST00000487538 LINC00208Q96KT6 92 aa5.8□□□□□ -1.48
GTPBP1-211ENST00000487538 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa5.77□□□□□ -1.49
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM236CP0DP71 79 aa5.77□□□□□ -1.49
GTPBP1-211ENST00000487538 C1orf64Q8NEQ6 169 aa5.77□□□□□ -1.49
GTPBP1-211ENST00000487538 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
GTPBP1-211ENST00000487538 RETNLBQ9BQ08 111 aa5.76□□□□□ -1.49
GTPBP1-211ENST00000487538 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa5.74□□□□□ -1.49
GTPBP1-211ENST00000487538 RNF213Q63HN8 5207 aa5.74□□□□□ -1.49
GTPBP1-211ENST00000487538 LPAP08519 4548 aa5.74□□□□□ -1.49
GTPBP1-211ENST00000487538 Q5W150 140 aa5.73□□□□□ -1.49
GTPBP1-211ENST00000487538 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa5.72□□□□□ -1.49
GTPBP1-211ENST00000487538 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
GTPBP1-211ENST00000487538 C9orf92A6NGG3 77 aa5.71□□□□□ -1.5
GTPBP1-211ENST00000487538 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa5.68□□□□□ -1.5
GTPBP1-211ENST00000487538 A8MUU9 505 aa5.67□□□□□ -1.5
GTPBP1-211ENST00000487538 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
GTPBP1-211ENST00000487538 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa5.67□□□□□ -1.5
GTPBP1-211ENST00000487538 PCOTHQ58A44 107 aa5.66□□□□□ -1.5
GTPBP1-211ENST00000487538 SERP1Q9Y6X1 66 aa5.66□□□□□ -1.5
GTPBP1-211ENST00000487538 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa5.65□□□□□ -1.5
GTPBP1-211ENST00000487538 IGKV2-30P06310 120 aa5.65□□□□□ -1.5
GTPBP1-211ENST00000487538 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa5.65□□□□□ -1.5
GTPBP1-211ENST00000487538 PRR4Q16378 134 aa5.63□□□□□ -1.51
GTPBP1-211ENST00000487538 Q75L30 129 aa5.62□□□□□ -1.51
GTPBP1-211ENST00000487538 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa5.61□□□□□ -1.51
GTPBP1-211ENST00000487538 MUC2Q02817 5179 aa5.58□□□□□ -1.52
GTPBP1-211ENST00000487538 C7orf65Q6ZTY9 151 aa5.58□□□□□ -1.52
GTPBP1-211ENST00000487538 HRES1P13985 223 aa5.57□□□□□ -1.52
GTPBP1-211ENST00000487538 XP32Q5T750 250 aa5.56□□□□□ -1.52
GTPBP1-211ENST00000487538 RPL37P61927 97 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
GTPBP1-211ENST00000487538 MUC17Q685J3 4493 aa5.53□□□□□ -1.52
GTPBP1-211ENST00000487538 TPRXLQ17RH7 258 aa5.53□□□□□ -1.52
GTPBP1-211ENST00000487538 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa5.53□□□□□ -1.52
GTPBP1-211ENST00000487538 SMIM26A0A096LP01 95 aa5.52□□□□□ -1.53
GTPBP1-211ENST00000487538 COA5Q86WW8 74 aa5.51□□□□□ -1.53
GTPBP1-211ENST00000487538 DMAC1Q96GE9 116 aa5.51□□□□□ -1.53
GTPBP1-211ENST00000487538 SPINK7P58062 85 aa5.5□□□□□ -1.53
GTPBP1-211ENST00000487538 ACYP2P14621 99 aa5.48□□□□□ -1.53
GTPBP1-211ENST00000487538 A8MUN3 132 aa5.44□□□□□ -1.54
GTPBP1-211ENST00000487538 C4orf26Q17RF5 130 aa5.44□□□□□ -1.54
GTPBP1-211ENST00000487538 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa5.41□□□□□ -1.54
GTPBP1-211ENST00000487538 FAT4Q6V0I7 4981 aa5.4□□□□□ -1.54
GTPBP1-211ENST00000487538 MPLKIPQ8TAP9 179 aa5.4□□□□□ -1.54
GTPBP1-211ENST00000487538 Q1T7F1 81 aa5.39□□□□□ -1.55
GTPBP1-211ENST00000487538 COX6B2Q6YFQ2 88 aa5.38□□□□□ -1.55
GTPBP1-211ENST00000487538 V9GYY9 64 aa5.38□□□□□ -1.55
GTPBP1-211ENST00000487538 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
GTPBP1-211ENST00000487538 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.35□□□□□ -1.55
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