RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481848.6

SOGA3-207, Transcript of SOGA family member 3, humanhuman

APPRIS P5 TSL 5 BASIC

Gene SOGA3, Length 11,464 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3-207ENST00000481848 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SOGA3-207ENST00000481848 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa6.51□□□□□ -1.37
SOGA3-207ENST00000481848 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.51□□□□□ -1.37
SOGA3-207ENST00000481848 TACC2O95359 2948 aa6.49□□□□□ -1.37
SOGA3-207ENST00000481848 TRIOO75962 3097 aa6.48□□□□□ -1.37
SOGA3-207ENST00000481848 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa6.43□□□□□ -1.38
SOGA3-207ENST00000481848 COL12A1Q99715 3063 aa6.41□□□□□ -1.38
SOGA3-207ENST00000481848 XP32Q5T750 250 aa6.36□□□□□ -1.39
SOGA3-207ENST00000481848 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.36□□□□□ -1.39
SOGA3-207ENST00000481848 TPRXLQ17RH7 258 aa6.36□□□□□ -1.39
SOGA3-207ENST00000481848 KRTAP12-2P59991 146 aa6.35□□□□□ -1.39
SOGA3-207ENST00000481848 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.34□□□□□ -1.39
SOGA3-207ENST00000481848 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SOGA3-207ENST00000481848 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa6.33□□□□□ -1.4
SOGA3-207ENST00000481848 ZANQ9Y493 2812 aa6.32□□□□□ -1.4
SOGA3-207ENST00000481848 DCHS2Q6V1P9 2916 aa6.31□□□□□ -1.4
SOGA3-207ENST00000481848 TENM2Q9NT68 2774 aa6.29□□□□□ -1.4
SOGA3-207ENST00000481848 FREM2Q5SZK8 3169 aa6.29□□□□□ -1.4
SOGA3-207ENST00000481848 VPS13AQ96RL7 3174 aa6.28□□□□□ -1.4
SOGA3-207ENST00000481848 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
SOGA3-207ENST00000481848 KRTAP12-1P59990 96 aa6.25□□□□□ -1.41
SOGA3-207ENST00000481848 ZFHX3Q15911 3703 aa6.25□□□□□ -1.41
SOGA3-207ENST00000481848 ZZEF1O43149 2961 aa6.23□□□□□ -1.41
SOGA3-207ENST00000481848 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.21□□□□□ -1.41
SOGA3-207ENST00000481848 WDFY4Q6ZS81 3184 aa6.2□□□□□ -1.42
SOGA3-207ENST00000481848 TENM4Q6N022 2769 aa6.2□□□□□ -1.42
SOGA3-207ENST00000481848 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.19□□□□□ -1.42
SOGA3-207ENST00000481848 MXRA5Q9NR99 2828 aa6.18□□□□□ -1.42
SOGA3-207ENST00000481848 FBN2P35556 2912 aa6.16□□□□□ -1.42
SOGA3-207ENST00000481848 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa6.15□□□□□ -1.42
SOGA3-207ENST00000481848 UTRNP46939 3433 aa6.13□□□□□ -1.43
SOGA3-207ENST00000481848 VWFP04275 2813 aa6.12□□□□□ -1.43
SOGA3-207ENST00000481848 KRTAP10-10P60014 251 aa6.09□□□□□ -1.43
SOGA3-207ENST00000481848 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
SOGA3-207ENST00000481848 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa6.06□□□□□ -1.44
SOGA3-207ENST00000481848 HTTP42858 3142 aa6.04□□□□□ -1.44
SOGA3-207ENST00000481848 LAMA1P25391 3075 aa6.03□□□□□ -1.44
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SOGA3-207ENST00000481848 COL7A1Q02388 2944 aa6.01□□□□□ -1.45
SOGA3-207ENST00000481848 DMXL1Q9Y485 3027 aa6□□□□□ -1.45
SOGA3-207ENST00000481848 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa5.97□□□□□ -1.45
SOGA3-207ENST00000481848 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa5.96□□□□□ -1.45
SOGA3-207ENST00000481848 A0A1B0GVY2 172 aa5.96□□□□□ -1.46
SOGA3-207ENST00000481848 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
SOGA3-207ENST00000481848 ATMQ13315 3056 aa5.9□□□□□ -1.46
SOGA3-207ENST00000481848 XIRP2A4UGR9 3374 aa5.9□□□□□ -1.46
SOGA3-207ENST00000481848 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa5.9□□□□□ -1.46
SOGA3-207ENST00000481848 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
SOGA3-207ENST00000481848 OTOGQ6ZRI0 2925 aa5.84□□□□□ -1.48
SOGA3-207ENST00000481848 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
SOGA3-207ENST00000481848 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.77□□□□□ -1.49
SOGA3-207ENST00000481848 FBN3Q75N90 2809 aa5.75□□□□□ -1.49
SOGA3-207ENST00000481848 UNC80Q8N2C7 3258 aa5.7□□□□□ -1.5
SOGA3-207ENST00000481848 COL6A3P12111 3177 aa5.68□□□□□ -1.5
SOGA3-207ENST00000481848 KRTAP10-12P60413 245 aa5.68□□□□□ -1.5
SOGA3-207ENST00000481848 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa5.67□□□□□ -1.5
SOGA3-207ENST00000481848 USP34Q70CQ2 3546 aa5.66□□□□□ -1.5
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SOGA3-207ENST00000481848 KRTAP12-3P60328 96 aa5.56□□□□□ -1.52
SOGA3-207ENST00000481848 BRCA2P51587 3418 aa5.53□□□□□ -1.52
SOGA3-207ENST00000481848 ALMS1Q8TCU4 4167 aa5.51□□□□□ -1.53
SOGA3-207ENST00000481848 VCANP13611 3396 aa5.49□□□□□ -1.53
SOGA3-207ENST00000481848 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
SOGA3-207ENST00000481848 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa5.44□□□□□ -1.54
SOGA3-207ENST00000481848 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa5.44□□□□□ -1.54
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SOGA3-207ENST00000481848 DNAH14Q0VDD8 3507 aa5.37□□□□□ -1.55
SOGA3-207ENST00000481848 SPEGQ15772 3267 aa5.34□□□□□ -1.55
SOGA3-207ENST00000481848 EYSQ5T1H1 3165 aa5.33□□□□□ -1.56
SOGA3-207ENST00000481848 ZFHX4Q86UP3 3567 aa5.33□□□□□ -1.56
SOGA3-207ENST00000481848 MYO15AQ9UKN7 3530 aa5.29□□□□□ -1.56
SOGA3-207ENST00000481848 LCE3AQ5TA76 89 aa5.28□□□□□ -1.56
SOGA3-207ENST00000481848 KRTAP10-5P60370 271 aa5.27□□□□□ -1.57
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SOGA3-207ENST00000481848 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.21□□□□□ -1.58
SOGA3-207ENST00000481848 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.19□□□□□ -1.58
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SOGA3-207ENST00000481848 CDH23Q9H251 3354 aa5.11□□□□□ -1.59
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SOGA3-207ENST00000481848 DMDP11532 3685 aa5□□□□□ -1.61
SOGA3-207ENST00000481848 DNAH3Q8TD57 4116 aa4.97□□□□□ -1.61
SOGA3-207ENST00000481848 BSNQ9UPA5 3926 aa4.97□□□□□ -1.61
SOGA3-207ENST00000481848 LOC400499M0QZD8 3231 aa4.96□□□□□ -1.62
SOGA3-207ENST00000481848 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa4.93□□□□□ -1.62
SOGA3-207ENST00000481848 VPS13CQ709C8 3753 aa4.92□□□□□ -1.62
SOGA3-207ENST00000481848 CMYA5Q8N3K9 4069 aa4.88□□□□□ -1.63
SOGA3-207ENST00000481848 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.87□□□□□ -1.63
SOGA3-207ENST00000481848 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa4.87□□□□□ -1.63
SOGA3-207ENST00000481848 MT3P25713 68 aa4.87□□□□□ -1.63
SOGA3-207ENST00000481848 LAMA5O15230 3695 aa4.86□□□□□ -1.63
SOGA3-207ENST00000481848 RELNP78509 3460 aa4.83□□□□□ -1.64
SOGA3-207ENST00000481848 MT1HL1P0DM35 61 aa4.83□□□□□ -1.64
SOGA3-207ENST00000481848 CSMD1Q96PZ7 3565 aa4.78□□□□□ -1.64
SOGA3-207ENST00000481848 ASPMQ8IZT6 3477 aa4.77□□□□□ -1.65
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