RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4-208ENST00000462602 C8orf87E5RJ46 101 aa5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4-208ENST00000462602 DSCR10P59022 87 aa5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa5.2□□□□□ -1.58
SH3BP4-208ENST00000462602 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa5.19□□□□□ -1.58
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC00313P59037 77 aa5.19□□□□□ -1.58
SH3BP4-208ENST00000462602 PRR15Q8IV56 129 aa5.19□□□□□ -1.58
SH3BP4-208ENST00000462602 HERC1Q15751 4861 aa5.19□□□□□ -1.58
SH3BP4-208ENST00000462602 C9orf92A6NGG3 77 aa5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4-208ENST00000462602 K7EQZ3 153 aa5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4-208ENST00000462602 CDIP1Q9H305 208 aa5.17□□□□□ -1.58
SH3BP4-208ENST00000462602 C8orf17Q9NRJ1 99 aa5.16□□□□□ -1.58
SH3BP4-208ENST00000462602 Q8N9L7 120 aa5.14□□□□□ -1.59
SH3BP4-208ENST00000462602 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa5.13□□□□□ -1.59
SH3BP4-208ENST00000462602 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa5.12□□□□□ -1.59
SH3BP4-208ENST00000462602 hDV103S1A0JD37 113 aa5.12□□□□□ -1.59
SH3BP4-208ENST00000462602 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
SH3BP4-208ENST00000462602 XP32Q5T750 250 aa5.12□□□□□ -1.59
SH3BP4-208ENST00000462602 HCG22E2RYF7 251 aa5.11□□□□□ -1.59
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SH3BP4-208ENST00000462602 CASC2Q6XLA1 102 aa5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4-208ENST00000462602 Q75L30 129 aa5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4-208ENST00000462602 HMCN2Q8NDA2 5059 aa5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM254Q8TBM7 123 aa5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4-208ENST00000462602 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa5.1□□□□□ -1.59
SH3BP4-208ENST00000462602 WFDC13Q8IUB5 93 aa5.09□□□□□ -1.59
SH3BP4-208ENST00000462602 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
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SH3BP4-208ENST00000462602 A8MUU9 505 aa5.08□□□□□ -1.6
SH3BP4-208ENST00000462602 MT-ATP8P03928 68 aa5.07□□□□□ -1.6
SH3BP4-208ENST00000462602 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
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SH3BP4-208ENST00000462602 NDUFS5O43920 106 aa5.05□□□□□ -1.6
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SH3BP4-208ENST00000462602 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
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SH3BP4-208ENST00000462602 SMIM20Q8N5G0 67 aa4.94□□□□□ -1.62
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SH3BP4-208ENST00000462602 TRAV7A0A075B6U4 112 aa4.89□□□□□ -1.63
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SH3BP4-208ENST00000462602 MPLKIPQ8TAP9 179 aa4.79□□□□□ -1.64
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SH3BP4-208ENST00000462602 DMAC1Q96GE9 116 aa4.64□□□□□ -1.67
SH3BP4-208ENST00000462602 MT1HP80294 61 aa4.63□□□□□ -1.67
SH3BP4-208ENST00000462602 H7BZZ5 65 aa4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4-208ENST00000462602 M0R2T5 61 aa4.62□□□□□ -1.67
SH3BP4-208ENST00000462602 ACYP2P14621 99 aa4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4-208ENST00000462602 S4R3F8 94 aa4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4-208ENST00000462602 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4-208ENST00000462602 CYSTM1Q9H1C7 97 aa4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4-208ENST00000462602 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
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