RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458278.6

ANKRD54-208, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD54, Length 623 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-208ENST00000458278 A0A1B0GW54 56 aa8.86□□□□□ -0.99
ANKRD54-208ENST00000458278 LORP23490 312 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
ANKRD54-208ENST00000458278 Q6ZQT0 140 aa8.86□□□□□ -0.99
ANKRD54-208ENST00000458278 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa8.85□□□□□ -0.99
ANKRD54-208ENST00000458278 A0A1B0GVX0 72 aa8.85□□□□□ -0.99
ANKRD54-208ENST00000458278 C8orf87E5RJ46 101 aa8.85□□□□□ -0.99
ANKRD54-208ENST00000458278 PDE6GP18545 87 aa8.85□□□□□ -0.99
ANKRD54-208ENST00000458278 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa8.81□□□□□ -1
ANKRD54-208ENST00000458278 BATFQ16520 125 aa8.81□□□□□ -1
ANKRD54-208ENST00000458278 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa8.8□□□□□ -1
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ANKRD54-208ENST00000458278 C14orf132Q9NPU4 83 aa8.77□□□□□ -1.01
ANKRD54-208ENST00000458278 C9orf118A6NHY6 69 aa8.76□□□□□ -1.01
ANKRD54-208ENST00000458278 A8MWP4 228 aa8.73□□□□□ -1.01
ANKRD54-208ENST00000458278 H3BT86 120 aa8.72□□□□□ -1.01
ANKRD54-208ENST00000458278 TAX1BP3O14907 124 aa8.72□□□□□ -1.01
ANKRD54-208ENST00000458278 A0A1W2PPM0 123 aa8.71□□□□□ -1.02
ANKRD54-208ENST00000458278 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
ANKRD54-208ENST00000458278 MPLKIPQ8TAP9 179 aa8.69□□□□□ -1.02
ANKRD54-208ENST00000458278 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
ANKRD54-208ENST00000458278 HRES1P13985 223 aa8.68□□□□□ -1.02
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ANKRD54-208ENST00000458278 C8orf17Q9NRJ1 99 aa8.68□□□□□ -1.02
ANKRD54-208ENST00000458278 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa8.68□□□□□ -1.02
ANKRD54-208ENST00000458278 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa8.67□□□□□ -1.02
ANKRD54-208ENST00000458278 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa8.66□□□□□ -1.02
ANKRD54-208ENST00000458278 FAM236CP0DP71 79 aa8.66□□□□□ -1.02
ANKRD54-208ENST00000458278 PRR15Q8IV56 129 aa8.65□□□□□ -1.02
ANKRD54-208ENST00000458278 CRCT1Q9UGL9 99 aa8.65□□□□□ -1.02
ANKRD54-208ENST00000458278 MTURNQ8N3F0 131 aa8.63□□□□□ -1.03
ANKRD54-208ENST00000458278 FSIP2Q5CZC0 6907 aa8.62□□□□□ -1.03
ANKRD54-208ENST00000458278 Q6ZVQ6 151 aa8.62□□□□□ -1.03
ANKRD54-208ENST00000458278 SPINK7P58062 85 aa8.6□□□□□ -1.03
ANKRD54-208ENST00000458278 SPCS1Q9Y6A9 102 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD54-208ENST00000458278 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa8.56□□□□□ -1.04
ANKRD54-208ENST00000458278 TMEM254Q8TBM7 123 aa8.56□□□□□ -1.04
ANKRD54-208ENST00000458278 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa8.56□□□□□ -1.04
ANKRD54-208ENST00000458278 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa8.55□□□□□ -1.04
ANKRD54-208ENST00000458278 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
ANKRD54-208ENST00000458278 K7EQZ3 153 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD54-208ENST00000458278 BPY2O14599 106 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD54-208ENST00000458278 hDV103S1A0JD37 113 aa8.52□□□□□ -1.05
ANKRD54-208ENST00000458278 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
ANKRD54-208ENST00000458278 WFDC13Q8IUB5 93 aa8.47□□□□□ -1.05
ANKRD54-208ENST00000458278 PRO0461Q9UI25 63 aa8.46□□□□□ -1.06
ANKRD54-208ENST00000458278 K7EP34 96 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD54-208ENST00000458278 NDUFS5O43920 106 aa8.45□□□□□ -1.06
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ANKRD54-208ENST00000458278 Q8N9L7 120 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD54-208ENST00000458278 CASC2Q6XLA1 102 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD54-208ENST00000458278 UBL5Q9BZL1 73 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD54-208ENST00000458278 LINC00846Q9NV44 126 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD54-208ENST00000458278 MT1FP04733 61 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD54-208ENST00000458278 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa8.37□□□□□ -1.07
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ANKRD54-208ENST00000458278 Q5W150 140 aa8.34□□□□□ -1.07
ANKRD54-208ENST00000458278 C7orf65Q6ZTY9 151 aa8.34□□□□□ -1.07
ANKRD54-208ENST00000458278 HCG22E2RYF7 251 aa8.33□□□□□ -1.08
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ANKRD54-208ENST00000458278 F8W1H4 67 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD54-208ENST00000458278 IGKV2-30P06310 120 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD54-208ENST00000458278 CXCL6P80162 114 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD54-208ENST00000458278 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD54-208ENST00000458278 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD54-208ENST00000458278 PCP4L1A6NKN8 68 aa8.29□□□□□ -1.08
ANKRD54-208ENST00000458278 USH2AO75445 5202 aa8.27□□□□□ -1.09
ANKRD54-208ENST00000458278 ETDBQ3ZM63 59 aa8.25□□□□□ -1.09
ANKRD54-208ENST00000458278 LCE2BO14633 110 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD54-208ENST00000458278 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa8.18□□□□□ -1.1
ANKRD54-208ENST00000458278 C4orf26Q17RF5 130 aa8.17□□□□□ -1.1
ANKRD54-208ENST00000458278 SSPOA2VEC9 5147 aa8.16□□□□□ -1.1
ANKRD54-208ENST00000458278 ACYP1P07311 99 aa8.12□□□□□ -1.11
ANKRD54-208ENST00000458278 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD54-208ENST00000458278 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa8.08□□□□□ -1.12
ANKRD54-208ENST00000458278 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa8.06□□□□□ -1.12
ANKRD54-208ENST00000458278 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa8.06□□□□□ -1.12
ANKRD54-208ENST00000458278 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
ANKRD54-208ENST00000458278 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
ANKRD54-208ENST00000458278 C1orf64Q8NEQ6 169 aa8.04□□□□□ -1.12
ANKRD54-208ENST00000458278 S4R3F8 94 aa8.01□□□□□ -1.13
ANKRD54-208ENST00000458278 C5orf47Q569G3 176 aa8□□□□□ -1.13
ANKRD54-208ENST00000458278 TRAV22A0A0B4J277 110 aa7.99□□□□□ -1.13
ANKRD54-208ENST00000458278 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa7.99□□□□□ -1.13
ANKRD54-208ENST00000458278 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa7.97□□□□□ -1.13
ANKRD54-208ENST00000458278 CSAG1Q6PB30 78 aa7.96□□□□□ -1.14
ANKRD54-208ENST00000458278 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa7.95□□□□□ -1.14
ANKRD54-208ENST00000458278 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
ANKRD54-208ENST00000458278 LCA10Q71F78 164 aa7.94□□□□□ -1.14
ANKRD54-208ENST00000458278 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa7.93□□□□□ -1.14
ANKRD54-208ENST00000458278 UQCRQO14949 82 aa7.91□□□□□ -1.14
ANKRD54-208ENST00000458278 LINC00643Q86TS7 51 aa7.91□□□□□ -1.14
ANKRD54-208ENST00000458278 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD54-208ENST00000458278 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD54-208ENST00000458278 ATOX1O00244 68 aa7.89□□□□□ -1.15
ANKRD54-208ENST00000458278 H0Y9P7 68 aa7.85□□□□□ -1.15
ANKRD54-208ENST00000458278 A0A1B0GV90 55 aa7.84□□□□□ -1.15
ANKRD54-208ENST00000458278 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
ANKRD54-208ENST00000458278 A0A087WVE0 104 aa7.83□□□□□ -1.16
ANKRD54-208ENST00000458278 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.83□□□□□ -1.16
ANKRD54-208ENST00000458278 SPRR2GQ9BYE4 73 aa7.78□□□□□ -1.16
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