RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431413.5

HERC3-206, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 761 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-206ENST00000431413 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa7.65□□□□□ -1.18
HERC3-206ENST00000431413 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa7.65□□□□□ -1.18
HERC3-206ENST00000431413 DSCR8Q96T75 97 aa7.65□□□□□ -1.18
HERC3-206ENST00000431413 C8orf87E5RJ46 101 aa7.64□□□□□ -1.19
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa7.63□□□□□ -1.19
HERC3-206ENST00000431413 A0A1B0GVX0 72 aa7.61□□□□□ -1.19
HERC3-206ENST00000431413 J3KT08 172 aa7.6□□□□□ -1.19
HERC3-206ENST00000431413 C9JAW5 83 aa7.59□□□□□ -1.19
HERC3-206ENST00000431413 HRES1P13985 223 aa7.59□□□□□ -1.19
HERC3-206ENST00000431413 MTURNQ8N3F0 131 aa7.59□□□□□ -1.19
HERC3-206ENST00000431413 MPLKIPQ8TAP9 179 aa7.59□□□□□ -1.19
HERC3-206ENST00000431413 BAALC-AS2P0C853 105 aa7.58□□□□□ -1.2
HERC3-206ENST00000431413 NDUFB1O75438 58 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC3-206ENST00000431413 Q6ZQT0 140 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-206ENST00000431413 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
HERC3-206ENST00000431413 USH2AO75445 5202 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-206ENST00000431413 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa7.52□□□□□ -1.21
HERC3-206ENST00000431413 MT2AP02795 61 aa7.52□□□□□ -1.21
HERC3-206ENST00000431413 A0A1B0GW54 56 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-206ENST00000431413 SPINK7P58062 85 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC3-206ENST00000431413 ATXN8Q156A1 80 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC3-206ENST00000431413 M0R143 59 aa7.49□□□□□ -1.21
HERC3-206ENST00000431413 PDE6GP18545 87 aa7.49□□□□□ -1.21
HERC3-206ENST00000431413 LYRM7Q5U5X0 104 aa7.49□□□□□ -1.21
HERC3-206ENST00000431413 SSPOA2VEC9 5147 aa7.48□□□□□ -1.21
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP10-10P60014 251 aa7.48□□□□□ -1.21
HERC3-206ENST00000431413 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
HERC3-206ENST00000431413 A8MWP4 228 aa7.47□□□□□ -1.21
HERC3-206ENST00000431413 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC3-206ENST00000431413 MT1FP04733 61 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC3-206ENST00000431413 C8orf17Q9NRJ1 99 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
HERC3-206ENST00000431413 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
HERC3-206ENST00000431413 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa7.41□□□□□ -1.22
HERC3-206ENST00000431413 Q6ZVQ6 151 aa7.41□□□□□ -1.22
HERC3-206ENST00000431413 C14orf132Q9NPU4 83 aa7.41□□□□□ -1.22
HERC3-206ENST00000431413 NREPQ16612 68 aa7.4□□□□□ -1.22
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7.4□□□□□ -1.22
HERC3-206ENST00000431413 WFDC13Q8IUB5 93 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa7.39□□□□□ -1.23
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC3-206ENST00000431413 PRR15Q8IV56 129 aa7.38□□□□□ -1.23
HERC3-206ENST00000431413 SMIM6P0DI80 62 aa7.35□□□□□ -1.23
HERC3-206ENST00000431413 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
HERC3-206ENST00000431413 TMEM254Q8TBM7 123 aa7.34□□□□□ -1.23
HERC3-206ENST00000431413 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa7.33□□□□□ -1.24
HERC3-206ENST00000431413 LINC00846Q9NV44 126 aa7.32□□□□□ -1.24
HERC3-206ENST00000431413 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC3-206ENST00000431413 NDUFS5O43920 106 aa7.3□□□□□ -1.24
HERC3-206ENST00000431413 hDV103S1A0JD37 113 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC3-206ENST00000431413 TSTD3H0UI37 97 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC3-206ENST00000431413 BATFQ16520 125 aa7.29□□□□□ -1.24
HERC3-206ENST00000431413 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa7.28□□□□□ -1.24
HERC3-206ENST00000431413 H3BT86 120 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC3-206ENST00000431413 K7EQZ3 153 aa7.27□□□□□ -1.25
HERC3-206ENST00000431413 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa7.25□□□□□ -1.25
HERC3-206ENST00000431413 BPY2O14599 106 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC3-206ENST00000431413 C9orf118A6NHY6 69 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC3-206ENST00000431413 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC3-206ENST00000431413 IGKV2-30P06310 120 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC3-206ENST00000431413 A0A1W2PPM0 123 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC3-206ENST00000431413 C7orf65Q6ZTY9 151 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa7.18□□□□□ -1.26
HERC3-206ENST00000431413 CASC2Q6XLA1 102 aa7.16□□□□□ -1.26
HERC3-206ENST00000431413 TAX1BP3O14907 124 aa7.15□□□□□ -1.26
HERC3-206ENST00000431413 Q5W150 140 aa7.15□□□□□ -1.26
HERC3-206ENST00000431413 HCG22E2RYF7 251 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC3-206ENST00000431413 CXCL6P80162 114 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC3-206ENST00000431413 Q8N9L7 120 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC3-206ENST00000431413 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
HERC3-206ENST00000431413 SPCS1Q9Y6A9 102 aa7.1□□□□□ -1.27
HERC3-206ENST00000431413 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
HERC3-206ENST00000431413 C4orf26Q17RF5 130 aa7.08□□□□□ -1.28
HERC3-206ENST00000431413 UBL5Q9BZL1 73 aa7.07□□□□□ -1.28
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa7.04□□□□□ -1.28
HERC3-206ENST00000431413 LCE3BQ5TA77 95 aa7.02□□□□□ -1.29
HERC3-206ENST00000431413 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC3-206ENST00000431413 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC3-206ENST00000431413 PCP4L1A6NKN8 68 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC3-206ENST00000431413 C5orf47Q569G3 176 aa6.99□□□□□ -1.29
HERC3-206ENST00000431413 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.97□□□□□ -1.29
HERC3-206ENST00000431413 S4R3F8 94 aa6.97□□□□□ -1.29
HERC3-206ENST00000431413 CSAG1Q6PB30 78 aa6.96□□□□□ -1.3
HERC3-206ENST00000431413 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.96□□□□□ -1.3
HERC3-206ENST00000431413 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC3-206ENST00000431413 PRO0461Q9UI25 63 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC3-206ENST00000431413 K7EP34 96 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.92□□□□□ -1.3
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.92□□□□□ -1.3
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.91□□□□□ -1.3
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.91□□□□□ -1.3
HERC3-206ENST00000431413 LCA10Q71F78 164 aa6.89□□□□□ -1.31
HERC3-206ENST00000431413 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.87□□□□□ -1.31
HERC3-206ENST00000431413 Q5VV11 94 aa6.86□□□□□ -1.31
HERC3-206ENST00000431413 A6NN06 94 aa6.85□□□□□ -1.31
HERC3-206ENST00000431413 F8W1H4 67 aa6.84□□□□□ -1.31
HERC3-206ENST00000431413 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.83□□□□□ -1.32
HERC3-206ENST00000431413 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.81□□□□□ -1.32
HERC3-206ENST00000431413 MT1BP07438 61 aa6.8□□□□□ -1.32
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