RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399262.6

JMJD1C-202, Transcript of jumonji domain containing 1C, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene JMJD1C, Length 8,666 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1C-202ENST00000399262 USP34Q70CQ2 3546 aa8.94□□□□□ -0.98
JMJD1C-202ENST00000399262 CELSR2Q9HCU4 2923 aa8.91□□□□□ -0.98
JMJD1C-202ENST00000399262 HIVEP1P15822 2718 aa8.9□□□□□ -0.98
JMJD1C-202ENST00000399262 DNAH14Q0VDD8 3507 aa8.88□□□□□ -0.99
JMJD1C-202ENST00000399262 HTTP42858 3142 aa8.87□□□□□ -0.99
JMJD1C-202ENST00000399262 ZZEF1O43149 2961 aa8.85□□□□□ -0.99
JMJD1C-202ENST00000399262 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP8.85□□□□□ -0.99
JMJD1C-202ENST00000399262 TGP01266 2768 aa8.85□□□□□ -0.99
JMJD1C-202ENST00000399262 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa8.83□□□□□ -1
JMJD1C-202ENST00000399262 KRTAP10-1P60331 282 aa8.82□□□□□ -1
JMJD1C-202ENST00000399262 LAMA3Q16787 3333 aa8.82□□□□□ -1
JMJD1C-202ENST00000399262 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
JMJD1C-202ENST00000399262 P0C880 135 aa8.81□□□□□ -1
JMJD1C-202ENST00000399262 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa8.81□□□□□ -1
JMJD1C-202ENST00000399262 COL6A3P12111 3177 aa8.8□□□□□ -1
JMJD1C-202ENST00000399262 PDZD2O15018 2839 aa8.79□□□□□ -1
JMJD1C-202ENST00000399262 NBEAQ8NFP9 2946 aa8.79□□□□□ -1
JMJD1C-202ENST00000399262 BRCA2P51587 3418 aa8.76□□□□□ -1.01
JMJD1C-202ENST00000399262 KRTAP10-2P60368 255 aa8.74□□□□□ -1.01
JMJD1C-202ENST00000399262 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
JMJD1C-202ENST00000399262 DMXL1Q9Y485 3027 aa8.72□□□□□ -1.01
JMJD1C-202ENST00000399262 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
JMJD1C-202ENST00000399262 ATMQ13315 3056 aa8.64□□□□□ -1.03
JMJD1C-202ENST00000399262 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa8.63□□□□□ -1.03
JMJD1C-202ENST00000399262 DCHS2Q6V1P9 2916 aa8.61□□□□□ -1.03
JMJD1C-202ENST00000399262 H0YAA0 97 aa8.6□□□□□ -1.03
JMJD1C-202ENST00000399262 CDH23Q9H251 3354 aa8.59□□□□□ -1.04
JMJD1C-202ENST00000399262 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa8.58□□□□□ -1.04
JMJD1C-202ENST00000399262 SPEGQ15772 3267 aa8.57□□□□□ -1.04
JMJD1C-202ENST00000399262 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa8.55□□□□□ -1.04
JMJD1C-202ENST00000399262 VCANP13611 3396 aa8.52□□□□□ -1.05
JMJD1C-202ENST00000399262 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa8.52□□□□□ -1.05
JMJD1C-202ENST00000399262 ZANQ9Y493 2812 aa8.45□□□□□ -1.06
JMJD1C-202ENST00000399262 FBN2P35556 2912 aa8.45□□□□□ -1.06
JMJD1C-202ENST00000399262 PRO2289Q9P1D8 64 aa8.45□□□□□ -1.06
JMJD1C-202ENST00000399262 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa8.38□□□□□ -1.07
JMJD1C-202ENST00000399262 TENM4Q6N022 2769 aa8.35□□□□□ -1.07
JMJD1C-202ENST00000399262 VWFP04275 2813 aa8.35□□□□□ -1.07
JMJD1C-202ENST00000399262 KRTAP10-8P60410 259 aa8.35□□□□□ -1.07
JMJD1C-202ENST00000399262 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa8.31□□□□□ -1.08
JMJD1C-202ENST00000399262 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa8.27□□□□□ -1.09
JMJD1C-202ENST00000399262 MXRA5Q9NR99 2828 aa8.26□□□□□ -1.09
JMJD1C-202ENST00000399262 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa8.24□□□□□ -1.09
JMJD1C-202ENST00000399262 INE1O15225 51 aa8.24□□□□□ -1.09
JMJD1C-202ENST00000399262 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa8.22□□□□□ -1.09
JMJD1C-202ENST00000399262 EYSQ5T1H1 3165 aa8.22□□□□□ -1.09
JMJD1C-202ENST00000399262 TENM2Q9NT68 2774 aa8.2□□□□□ -1.1
JMJD1C-202ENST00000399262 SZT2Q5T011 3432 aa8.17□□□□□ -1.1
JMJD1C-202ENST00000399262 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
JMJD1C-202ENST00000399262 ZFHX3Q15911 3703 aa8.16□□□□□ -1.1
JMJD1C-202ENST00000399262 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
JMJD1C-202ENST00000399262 COL7A1Q02388 2944 aa8.14□□□□□ -1.11
JMJD1C-202ENST00000399262 ZFHX4Q86UP3 3567 aa8.12□□□□□ -1.11
JMJD1C-202ENST00000399262 TPRXLQ17RH7 258 aa8.09□□□□□ -1.12
JMJD1C-202ENST00000399262 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa8.08□□□□□ -1.12
JMJD1C-202ENST00000399262 XP32Q5T750 250 aa8.07□□□□□ -1.12
JMJD1C-202ENST00000399262 MYO15AQ9UKN7 3530 aa8.07□□□□□ -1.12
JMJD1C-202ENST00000399262 LAMA5O15230 3695 aa8.02□□□□□ -1.13
JMJD1C-202ENST00000399262 ASPMQ8IZT6 3477 aa8.02□□□□□ -1.13
JMJD1C-202ENST00000399262 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa8.02□□□□□ -1.13
JMJD1C-202ENST00000399262 LOC400499M0QZD8 3231 aa7.98□□□□□ -1.13
JMJD1C-202ENST00000399262 KRTAP10-10P60014 251 aa7.98□□□□□ -1.13
JMJD1C-202ENST00000399262 KRTAP12-2P59991 146 aa7.89□□□□□ -1.15
JMJD1C-202ENST00000399262 A0A1B0GVY2 172 aa7.87□□□□□ -1.15
JMJD1C-202ENST00000399262 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa7.86□□□□□ -1.15
JMJD1C-202ENST00000399262 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa7.85□□□□□ -1.15
JMJD1C-202ENST00000399262 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
JMJD1C-202ENST00000399262 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa7.84□□□□□ -1.15
JMJD1C-202ENST00000399262 RELNP78509 3460 aa7.8□□□□□ -1.16
JMJD1C-202ENST00000399262 KRTAP12-1P59990 96 aa7.77□□□□□ -1.16
JMJD1C-202ENST00000399262 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
JMJD1C-202ENST00000399262 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.69□□□□□ -1.18
JMJD1C-202ENST00000399262 OTOGQ6ZRI0 2925 aa7.68□□□□□ -1.18
JMJD1C-202ENST00000399262 DCHS1Q96JQ0 3298 aa7.67□□□□□ -1.18
JMJD1C-202ENST00000399262 DMDP11532 3685 aa7.64□□□□□ -1.19
JMJD1C-202ENST00000399262 CSMD1Q96PZ7 3565 aa7.64□□□□□ -1.19
JMJD1C-202ENST00000399262 FBN3Q75N90 2809 aa7.6□□□□□ -1.19
JMJD1C-202ENST00000399262 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
JMJD1C-202ENST00000399262 VPS13CQ709C8 3753 aa7.46□□□□□ -1.21
JMJD1C-202ENST00000399262 KRTAP23-1A1A580 65 aa7.46□□□□□ -1.22
JMJD1C-202ENST00000399262 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa7.4□□□□□ -1.23
JMJD1C-202ENST00000399262 AKAP9Q99996 3911 aa7.37□□□□□ -1.23
JMJD1C-202ENST00000399262 CUBNO60494 3623 aa7.3□□□□□ -1.24
JMJD1C-202ENST00000399262 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
JMJD1C-202ENST00000399262 SVEP1Q4LDE5 3571 aa7.22□□□□□ -1.25
JMJD1C-202ENST00000399262 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa7.2□□□□□ -1.26
JMJD1C-202ENST00000399262 MUC3AQ02505 3323 aa7.16□□□□□ -1.26
JMJD1C-202ENST00000399262 KRTAP10-12P60413 245 aa7.15□□□□□ -1.27
JMJD1C-202ENST00000399262 ALMS1Q8TCU4 4167 aa7.13□□□□□ -1.27
JMJD1C-202ENST00000399262 CSMD3Q7Z407 3707 aa7.12□□□□□ -1.27
JMJD1C-202ENST00000399262 KRTAP12-3P60328 96 aa6.96□□□□□ -1.29
JMJD1C-202ENST00000399262 BSNQ9UPA5 3926 aa6.96□□□□□ -1.3
JMJD1C-202ENST00000399262 CSMD2Q7Z408 3487 aa6.93□□□□□ -1.3
JMJD1C-202ENST00000399262 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.88□□□□□ -1.31
JMJD1C-202ENST00000399262 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.8□□□□□ -1.32
JMJD1C-202ENST00000399262 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.78□□□□□ -1.32
JMJD1C-202ENST00000399262 LYSTQ99698 3801 aa6.74□□□□□ -1.33
JMJD1C-202ENST00000399262 CMYA5Q8N3K9 4069 aa6.68□□□□□ -1.34
JMJD1C-202ENST00000399262 LCE3AQ5TA76 89 aa6.62□□□□□ -1.35
JMJD1C-202ENST00000399262 KRTAP10-5P60370 271 aa6.61□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms