RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398073.6

CTDSP2-201, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-201ENST00000398073 CSAG1Q6PB30 78 aa9.54□□□□□ -0.88
CTDSP2-201ENST00000398073 MXRA5Q9NR99 2828 aa9.51□□□□□ -0.89
CTDSP2-201ENST00000398073 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa9.49□□□□□ -0.89
CTDSP2-201ENST00000398073 COX6B2Q6YFQ2 88 aa9.47□□□□□ -0.89
CTDSP2-201ENST00000398073 J3QL48 77 aa9.47□□□□□ -0.89
CTDSP2-201ENST00000398073 SPATA8Q6RVD6 105 aa9.46□□□□□ -0.89
CTDSP2-201ENST00000398073 A6NN06 94 aa9.46□□□□□ -0.9
CTDSP2-201ENST00000398073 Q6ZSA8 131 aa9.43□□□□□ -0.9
CTDSP2-201ENST00000398073 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa9.43□□□□□ -0.9
CTDSP2-201ENST00000398073 S4R3F8 94 aa9.4□□□□□ -0.91
CTDSP2-201ENST00000398073 A8MU10 97 aa9.39□□□□□ -0.91
CTDSP2-201ENST00000398073 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa9.39□□□□□ -0.91
CTDSP2-201ENST00000398073 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
CTDSP2-201ENST00000398073 DCHS1Q96JQ0 3298 aa9.35□□□□□ -0.91
CTDSP2-201ENST00000398073 RPL37P61927 97 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
CTDSP2-201ENST00000398073 RELNP78509 3460 aa9.34□□□□□ -0.91
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa9.31□□□□□ -0.92
CTDSP2-201ENST00000398073 RPS29P62273 56 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CTDSP2-201ENST00000398073 ROMO1P60602 79 aa9.28□□□□□ -0.92
CTDSP2-201ENST00000398073 H3BS24 57 aa9.26□□□□□ -0.93
CTDSP2-201ENST00000398073 TENM4Q6N022 2769 aa9.24□□□□□ -0.93
CTDSP2-201ENST00000398073 ZFHX4Q86UP3 3567 aa9.24□□□□□ -0.93
CTDSP2-201ENST00000398073 ASPMQ8IZT6 3477 aa9.19□□□□□ -0.94
CTDSP2-201ENST00000398073 LUZP6Q538Z0 58 aa9.19□□□□□ -0.94
CTDSP2-201ENST00000398073 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa9.19□□□□□ -0.94
CTDSP2-201ENST00000398073 TENM3Q9P273 2699 aa9.19□□□□□ -0.94
CTDSP2-201ENST00000398073 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa9.18□□□□□ -0.94
CTDSP2-201ENST00000398073 Q5VSD8 79 aa9.17□□□□□ -0.94
CTDSP2-201ENST00000398073 LAMA5O15230 3695 aa9.17□□□□□ -0.94
CTDSP2-201ENST00000398073 ADM2Q7Z4H4 148 aa9.15□□□□□ -0.94
CTDSP2-201ENST00000398073 R4GN34 69 aa9.15□□□□□ -0.95
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa9.08□□□□□ -0.96
CTDSP2-201ENST00000398073 MUC3AQ02505 3323 aa9.08□□□□□ -0.96
CTDSP2-201ENST00000398073 CSMD1Q96PZ7 3565 aa9.06□□□□□ -0.96
CTDSP2-201ENST00000398073 DMDP11532 3685 aa9.05□□□□□ -0.96
CTDSP2-201ENST00000398073 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
CTDSP2-201ENST00000398073 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
CTDSP2-201ENST00000398073 M0QZ58 72 aa9.01□□□□□ -0.97
CTDSP2-201ENST00000398073 A8MUU9 505 aa9.01□□□□□ -0.97
CTDSP2-201ENST00000398073 TENM1Q9UKZ4 2725 aa9□□□□□ -0.97
CTDSP2-201ENST00000398073 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa8.98□□□□□ -0.97
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa8.96□□□□□ -0.97
CTDSP2-201ENST00000398073 PDZD2O15018 2839 aa8.96□□□□□ -0.98
CTDSP2-201ENST00000398073 VWFP04275 2813 aa8.92□□□□□ -0.98
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa8.88□□□□□ -0.99
CTDSP2-201ENST00000398073 TGP01266 2768 aa8.85□□□□□ -0.99
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa8.82□□□□□ -1
CTDSP2-201ENST00000398073 M0R2T5 61 aa8.81□□□□□ -1
CTDSP2-201ENST00000398073 A0A0A0MQY5 61 aa8.8□□□□□ -1
CTDSP2-201ENST00000398073 SVEP1Q4LDE5 3571 aa8.78□□□□□ -1
CTDSP2-201ENST00000398073 H0YAA0 97 aa8.76□□□□□ -1.01
CTDSP2-201ENST00000398073 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
CTDSP2-201ENST00000398073 OTOGQ6ZRI0 2925 aa8.7□□□□□ -1.02
CTDSP2-201ENST00000398073 TENM2Q9NT68 2774 aa8.66□□□□□ -1.02
CTDSP2-201ENST00000398073 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa8.64□□□□□ -1.03
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa8.63□□□□□ -1.03
CTDSP2-201ENST00000398073 NDUFAF8A1L188 74 aa8.61□□□□□ -1.03
CTDSP2-201ENST00000398073 XP32Q5T750 250 aa8.61□□□□□ -1.03
CTDSP2-201ENST00000398073 CUBNO60494 3623 aa8.59□□□□□ -1.03
CTDSP2-201ENST00000398073 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
CTDSP2-201ENST00000398073 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa8.54□□□□□ -1.04
CTDSP2-201ENST00000398073 PLAC4Q8WY50 150 aa8.54□□□□□ -1.04
CTDSP2-201ENST00000398073 C10orf95Q9H7T3 257 aa8.5□□□□□ -1.05
CTDSP2-201ENST00000398073 BSNQ9UPA5 3926 aa8.46□□□□□ -1.05
CTDSP2-201ENST00000398073 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CTDSP2-201ENST00000398073 CSMD2Q7Z408 3487 aa8.42□□□□□ -1.06
CTDSP2-201ENST00000398073 P0C880 135 aa8.41□□□□□ -1.06
CTDSP2-201ENST00000398073 FBN3Q75N90 2809 aa8.4□□□□□ -1.06
CTDSP2-201ENST00000398073 TNP1P09430 55 aa8.37□□□□□ -1.07
CTDSP2-201ENST00000398073 TPRXLQ17RH7 258 aa8.37□□□□□ -1.07
CTDSP2-201ENST00000398073 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CTDSP2-201ENST00000398073 ZFHX3Q15911 3703 aa8.35□□□□□ -1.07
CTDSP2-201ENST00000398073 PP632Q6XCG6 107 aa8.34□□□□□ -1.07
CTDSP2-201ENST00000398073 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa8.31□□□□□ -1.08
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP10-8P60410 259 aa8.29□□□□□ -1.08
CTDSP2-201ENST00000398073 A0A1B0GVY2 172 aa8.26□□□□□ -1.09
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa8.26□□□□□ -1.09
CTDSP2-201ENST00000398073 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa8.25□□□□□ -1.09
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP12-2P59991 146 aa8.13□□□□□ -1.11
CTDSP2-201ENST00000398073 VPS13CQ709C8 3753 aa8.08□□□□□ -1.12
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP12-1P59990 96 aa8.06□□□□□ -1.12
CTDSP2-201ENST00000398073 COL7A1Q02388 2944 aa8.06□□□□□ -1.12
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.12
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa7.98□□□□□ -1.13
CTDSP2-201ENST00000398073 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP10-10P60014 251 aa7.79□□□□□ -1.16
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.79□□□□□ -1.16
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.79□□□□□ -1.16
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
CTDSP2-201ENST00000398073 AKAP9Q99996 3911 aa7.7□□□□□ -1.18
CTDSP2-201ENST00000398073 MT1HL1P0DM35 61 aa7.66□□□□□ -1.18
CTDSP2-201ENST00000398073 CSMD3Q7Z407 3707 aa7.62□□□□□ -1.19
CTDSP2-201ENST00000398073 PRO2289Q9P1D8 64 aa7.62□□□□□ -1.19
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.59□□□□□ -1.2
CTDSP2-201ENST00000398073 DNAH9Q9NYC9 4486 aa7.56□□□□□ -1.2
CTDSP2-201ENST00000398073 DNAH1Q9P2D7 4330 aa7.44□□□□□ -1.22
CTDSP2-201ENST00000398073 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
CTDSP2-201ENST00000398073 DNAH10Q8IVF4 4471 aa7.37□□□□□ -1.23
CTDSP2-201ENST00000398073 DNAH11Q96DT5 4516 aa7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms