RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395322.3

CTXN3-202, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN3, Length 1,458 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-202ENST00000395322 PRR15Q8IV56 129 aa6.6□□□□□ -1.35
CTXN3-202ENST00000395322 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.59□□□□□ -1.36
CTXN3-202ENST00000395322 OCR1Q9BZK8 76 aa6.59□□□□□ -1.36
CTXN3-202ENST00000395322 CDK2AP2O75956 126 aa6.58□□□□□ -1.36
CTXN3-202ENST00000395322 C20orf197Q8N268 126 aa6.58□□□□□ -1.36
CTXN3-202ENST00000395322 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.57□□□□□ -1.36
CTXN3-202ENST00000395322 Q96NJ1 140 aa6.57□□□□□ -1.36
CTXN3-202ENST00000395322 KLKP1Q107X0 134 aa6.56□□□□□ -1.36
CTXN3-202ENST00000395322 CASC2Q6XLA1 102 aa6.55□□□□□ -1.36
CTXN3-202ENST00000395322 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.55□□□□□ -1.36
CTXN3-202ENST00000395322 A0A087X002 238 aa6.54□□□□□ -1.36
CTXN3-202ENST00000395322 TMEM258P61165 79 aa6.54□□□□□ -1.36
CTXN3-202ENST00000395322 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.54□□□□□ -1.36
CTXN3-202ENST00000395322 NDUFC1O43677 76 aa6.53□□□□□ -1.36
CTXN3-202ENST00000395322 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.53□□□□□ -1.36
CTXN3-202ENST00000395322 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.53□□□□□ -1.36
CTXN3-202ENST00000395322 LRP1BQ9NZR2 4599 aa6.53□□□□□ -1.36
CTXN3-202ENST00000395322 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.53□□□□□ -1.36
CTXN3-202ENST00000395322 RYR2Q92736 4967 aa6.52□□□□□ -1.37
CTXN3-202ENST00000395322 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CTXN3-202ENST00000395322 Q5XG85 94 aa6.52□□□□□ -1.37
CTXN3-202ENST00000395322 LIMD2Q9BT23 127 aa6.52□□□□□ -1.37
CTXN3-202ENST00000395322 A0A1B0GVX0 72 aa6.51□□□□□ -1.37
CTXN3-202ENST00000395322 C5orf47Q569G3 176 aa6.51□□□□□ -1.37
CTXN3-202ENST00000395322 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.5□□□□□ -1.37
CTXN3-202ENST00000395322 hDV103S1A0JD37 113 aa6.5□□□□□ -1.37
CTXN3-202ENST00000395322 PKHD1P08F94 4074 aa6.49□□□□□ -1.37
CTXN3-202ENST00000395322 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.49□□□□□ -1.37
CTXN3-202ENST00000395322 SNURFQ9Y675 71 aa6.49□□□□□ -1.37
CTXN3-202ENST00000395322 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.48□□□□□ -1.37
CTXN3-202ENST00000395322 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.48□□□□□ -1.37
CTXN3-202ENST00000395322 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CTXN3-202ENST00000395322 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa6.48□□□□□ -1.37
CTXN3-202ENST00000395322 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa6.47□□□□□ -1.37
CTXN3-202ENST00000395322 A0A0U1RQV1 116 aa6.47□□□□□ -1.37
CTXN3-202ENST00000395322 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CTXN3-202ENST00000395322 MP68P56378 58 aa6.47□□□□□ -1.37
CTXN3-202ENST00000395322 H7BZZ5 65 aa6.46□□□□□ -1.38
CTXN3-202ENST00000395322 SPINK1P00995 79 aa6.46□□□□□ -1.38
CTXN3-202ENST00000395322 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.46□□□□□ -1.38
CTXN3-202ENST00000395322 C8orf87E5RJ46 101 aa6.45□□□□□ -1.38
CTXN3-202ENST00000395322 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CTXN3-202ENST00000395322 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.45□□□□□ -1.38
CTXN3-202ENST00000395322 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.44□□□□□ -1.38
CTXN3-202ENST00000395322 H3BPC8 53 aa6.44□□□□□ -1.38
CTXN3-202ENST00000395322 FAM236CP0DP71 79 aa6.44□□□□□ -1.38
CTXN3-202ENST00000395322 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CTXN3-202ENST00000395322 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.44□□□□□ -1.38
CTXN3-202ENST00000395322 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CTXN3-202ENST00000395322 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CTXN3-202ENST00000395322 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.42□□□□□ -1.38
CTXN3-202ENST00000395322 APOBP04114 4563 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
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CTXN3-202ENST00000395322 H0Y9P7 68 aa6.41□□□□□ -1.38
CTXN3-202ENST00000395322 C1orf195Q5TG92 126 aa6.41□□□□□ -1.38
CTXN3-202ENST00000395322 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.41□□□□□ -1.38
CTXN3-202ENST00000395322 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.4□□□□□ -1.39
CTXN3-202ENST00000395322 NDUFS5O43920 106 aa6.4□□□□□ -1.39
CTXN3-202ENST00000395322 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
CTXN3-202ENST00000395322 Q8N1X5 172 aa6.39□□□□□ -1.39
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CTXN3-202ENST00000395322 LINC00208Q96KT6 92 aa6.37□□□□□ -1.39
CTXN3-202ENST00000395322 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6.34□□□□□ -1.39
CTXN3-202ENST00000395322 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.34□□□□□ -1.4
CTXN3-202ENST00000395322 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.33□□□□□ -1.4
CTXN3-202ENST00000395322 Q5VSD8 79 aa6.32□□□□□ -1.4
CTXN3-202ENST00000395322 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.31□□□□□ -1.4
CTXN3-202ENST00000395322 FAT1Q14517 4588 aa6.3□□□□□ -1.4
CTXN3-202ENST00000395322 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CTXN3-202ENST00000395322 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.28□□□□□ -1.4
CTXN3-202ENST00000395322 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.28□□□□□ -1.4
CTXN3-202ENST00000395322 RYR3Q15413 4870 aa6.27□□□□□ -1.41
CTXN3-202ENST00000395322 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.27□□□□□ -1.41
CTXN3-202ENST00000395322 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.26□□□□□ -1.41
CTXN3-202ENST00000395322 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.25□□□□□ -1.41
CTXN3-202ENST00000395322 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.22□□□□□ -1.41
CTXN3-202ENST00000395322 Q5W150 140 aa6.21□□□□□ -1.42
CTXN3-202ENST00000395322 OXTP01178 125 aa6.2□□□□□ -1.42
CTXN3-202ENST00000395322 HSPG2P98160 4391 aa6.2□□□□□ -1.42
CTXN3-202ENST00000395322 RYR1P21817 5038 aa6.19□□□□□ -1.42
CTXN3-202ENST00000395322 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.19□□□□□ -1.42
CTXN3-202ENST00000395322 SMIM26A0A096LP01 95 aa6.19□□□□□ -1.42
CTXN3-202ENST00000395322 KRTAP10-8P60410 259 aa6.19□□□□□ -1.42
CTXN3-202ENST00000395322 PCOTHQ58A44 107 aa6.19□□□□□ -1.42
CTXN3-202ENST00000395322 PRR4Q16378 134 aa6.18□□□□□ -1.42
CTXN3-202ENST00000395322 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
CTXN3-202ENST00000395322 IGKV2-30P06310 120 aa6.15□□□□□ -1.43
CTXN3-202ENST00000395322 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.43
CTXN3-202ENST00000395322 RETNLBQ9BQ08 111 aa6.14□□□□□ -1.43
CTXN3-202ENST00000395322 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.13□□□□□ -1.43
CTXN3-202ENST00000395322 C9orf92A6NGG3 77 aa6.12□□□□□ -1.43
CTXN3-202ENST00000395322 A8MUU9 505 aa6.12□□□□□ -1.43
CTXN3-202ENST00000395322 A0A0A0MQY5 61 aa6.11□□□□□ -1.43
CTXN3-202ENST00000395322 TNXBP22105 4242 aa6.09□□□□□ -1.43
CTXN3-202ENST00000395322 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.09□□□□□ -1.44
CTXN3-202ENST00000395322 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.09□□□□□ -1.44
CTXN3-202ENST00000395322 HRES1P13985 223 aa6.08□□□□□ -1.44
CTXN3-202ENST00000395322 KIAA1109Q2LD37 5005 aa6.08□□□□□ -1.44
CTXN3-202ENST00000395322 COA5Q86WW8 74 aa6.07□□□□□ -1.44
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