RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376392.10

NME1-NME2-201, Transcript of NME1-NME2 readthrough, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NME1-NME2, Length 894 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1-NME2-201ENST00000376392 SPINK1P00995 79 aa7.56□□□□□ -1.2
NME1-NME2-201ENST00000376392 C5orf47Q569G3 176 aa7.56□□□□□ -1.2
NME1-NME2-201ENST00000376392 HERC2O95714 4834 aa7.56□□□□□ -1.2
NME1-NME2-201ENST00000376392 SPAG11AQ6PDA7 123 aa7.55□□□□□ -1.2
NME1-NME2-201ENST00000376392 C8orf87E5RJ46 101 aa7.54□□□□□ -1.2
NME1-NME2-201ENST00000376392 SNURFQ9Y675 71 aa7.54□□□□□ -1.2
NME1-NME2-201ENST00000376392 MP68P56378 58 aa7.53□□□□□ -1.2
NME1-NME2-201ENST00000376392 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
NME1-NME2-201ENST00000376392 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
NME1-NME2-201ENST00000376392 PRR26Q8N8Z3 221 aa7.53□□□□□ -1.2
NME1-NME2-201ENST00000376392 LINC00304Q8N9R0 145 aa7.53□□□□□ -1.2
NME1-NME2-201ENST00000376392 A0A0U1RQV1 116 aa7.52□□□□□ -1.21
NME1-NME2-201ENST00000376392 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa7.52□□□□□ -1.21
NME1-NME2-201ENST00000376392 CYSTM1Q9H1C7 97 aa7.51□□□□□ -1.21
NME1-NME2-201ENST00000376392 C1orf195Q5TG92 126 aa7.5□□□□□ -1.21
NME1-NME2-201ENST00000376392 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
NME1-NME2-201ENST00000376392 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
NME1-NME2-201ENST00000376392 H3BPC8 53 aa7.49□□□□□ -1.21
NME1-NME2-201ENST00000376392 LRP1BQ9NZR2 4599 aa7.49□□□□□ -1.21
NME1-NME2-201ENST00000376392 H0Y9P7 68 aa7.47□□□□□ -1.21
NME1-NME2-201ENST00000376392 H7BZZ5 65 aa7.47□□□□□ -1.21
NME1-NME2-201ENST00000376392 NDUFS5O43920 106 aa7.47□□□□□ -1.21
NME1-NME2-201ENST00000376392 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa7.46□□□□□ -1.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 FAM236CP0DP71 79 aa7.46□□□□□ -1.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 LINC00313P59037 77 aa7.45□□□□□ -1.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 Q5VSD8 79 aa7.45□□□□□ -1.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 PKHD1P08F94 4074 aa7.44□□□□□ -1.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 TRAV22A0A0B4J277 110 aa7.44□□□□□ -1.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 KIAA1109Q2LD37 5005 aa7.43□□□□□ -1.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa7.43□□□□□ -1.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 RYR1P21817 5038 aa7.42□□□□□ -1.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 LINC00208Q96KT6 92 aa7.42□□□□□ -1.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa7.41□□□□□ -1.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 APOBP04114 4563 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 C1orf64Q8NEQ6 169 aa7.38□□□□□ -1.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 RPS28P62857 69 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
NME1-NME2-201ENST00000376392 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa7.33□□□□□ -1.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 SERP1Q9Y6X1 66 aa7.33□□□□□ -1.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa7.32□□□□□ -1.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 Q8N1X5 172 aa7.32□□□□□ -1.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa7.31□□□□□ -1.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 ABCA13Q86UQ4 5058 aa7.29□□□□□ -1.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 KRTAP10-8P60410 259 aa7.29□□□□□ -1.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa7.29□□□□□ -1.24
NME1-NME2-201ENST00000376392 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa7.25□□□□□ -1.25
NME1-NME2-201ENST00000376392 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa7.25□□□□□ -1.25
NME1-NME2-201ENST00000376392 Q5W150 140 aa7.24□□□□□ -1.25
NME1-NME2-201ENST00000376392 PCOTHQ58A44 107 aa7.23□□□□□ -1.25
NME1-NME2-201ENST00000376392 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 RETNLBQ9BQ08 111 aa7.21□□□□□ -1.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 FAT1Q14517 4588 aa7.2□□□□□ -1.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.19□□□□□ -1.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 C9orf92A6NGG3 77 aa7.19□□□□□ -1.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 PRR4Q16378 134 aa7.19□□□□□ -1.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa7.19□□□□□ -1.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 IGKV2-30P06310 120 aa7.18□□□□□ -1.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 OXTP01178 125 aa7.17□□□□□ -1.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 HSPG2P98160 4391 aa7.16□□□□□ -1.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 SMIM26A0A096LP01 95 aa7.16□□□□□ -1.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 A8MUU9 505 aa7.16□□□□□ -1.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa7.16□□□□□ -1.26
NME1-NME2-201ENST00000376392 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
NME1-NME2-201ENST00000376392 UBR4Q5T4S7 5183 aa7.12□□□□□ -1.27
NME1-NME2-201ENST00000376392 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa7.12□□□□□ -1.27
NME1-NME2-201ENST00000376392 MT1HL1P0DM35 61 aa7.11□□□□□ -1.27
NME1-NME2-201ENST00000376392 C7orf65Q6ZTY9 151 aa7.11□□□□□ -1.27
NME1-NME2-201ENST00000376392 Q75L30 129 aa7.1□□□□□ -1.27
NME1-NME2-201ENST00000376392 HRES1P13985 223 aa7.08□□□□□ -1.28
NME1-NME2-201ENST00000376392 LCE2BO14633 110 aa7.06□□□□□ -1.28
NME1-NME2-201ENST00000376392 COA5Q86WW8 74 aa7.06□□□□□ -1.28
NME1-NME2-201ENST00000376392 J3QL48 77 aa7.05□□□□□ -1.28
NME1-NME2-201ENST00000376392 HERC1Q15751 4861 aa7.05□□□□□ -1.28
NME1-NME2-201ENST00000376392 ACYP2P14621 99 aa7.04□□□□□ -1.28
NME1-NME2-201ENST00000376392 DMAC1Q96GE9 116 aa7.03□□□□□ -1.28
NME1-NME2-201ENST00000376392 TNXBP22105 4242 aa7.01□□□□□ -1.29
NME1-NME2-201ENST00000376392 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa7.01□□□□□ -1.29
NME1-NME2-201ENST00000376392 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
NME1-NME2-201ENST00000376392 V9GYY9 64 aa7□□□□□ -1.29
NME1-NME2-201ENST00000376392 FAT3Q8TDW7 4589 aa6.99□□□□□ -1.29
NME1-NME2-201ENST00000376392 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
NME1-NME2-201ENST00000376392 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.98□□□□□ -1.29
NME1-NME2-201ENST00000376392 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.97□□□□□ -1.29
NME1-NME2-201ENST00000376392 XP32Q5T750 250 aa6.97□□□□□ -1.29
NME1-NME2-201ENST00000376392 A8MUN3 132 aa6.96□□□□□ -1.3
NME1-NME2-201ENST00000376392 Q1T7F1 81 aa6.96□□□□□ -1.3
NME1-NME2-201ENST00000376392 SPINK7P58062 85 aa6.95□□□□□ -1.3
NME1-NME2-201ENST00000376392 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
NME1-NME2-201ENST00000376392 TPRXLQ17RH7 258 aa6.94□□□□□ -1.3
NME1-NME2-201ENST00000376392 C4orf26Q17RF5 130 aa6.92□□□□□ -1.3
NME1-NME2-201ENST00000376392 MYCBP2O75592 4640 aa6.85□□□□□ -1.31
NME1-NME2-201ENST00000376392 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.83□□□□□ -1.32
NME1-NME2-201ENST00000376392 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.83□□□□□ -1.32
NME1-NME2-201ENST00000376392 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.82□□□□□ -1.32
NME1-NME2-201ENST00000376392 PRR15LQ9BU68 103 aa6.82□□□□□ -1.32
NME1-NME2-201ENST00000376392 PSPHP1O15172 72 aa6.81□□□□□ -1.32
NME1-NME2-201ENST00000376392 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
NME1-NME2-201ENST00000376392 Q5VV11 94 aa6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.2 ms