RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 NDUFS5O43920 106 aa11.54□□□□□ -0.56
SPNS1-201ENST00000311008 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa11.53□□□□□ -0.56
SPNS1-201ENST00000311008 KRTAP10-2P60368 255 aa11.52□□□□□ -0.56
SPNS1-201ENST00000311008 DNAH6Q9C0G6 4158 aa11.5□□□□□ -0.57
SPNS1-201ENST00000311008 FBN3Q75N90 2809 aa11.5□□□□□ -0.57
SPNS1-201ENST00000311008 FRAS1Q86XX4 4008 aa11.49□□□□□ -0.57
SPNS1-201ENST00000311008 Q6ZSA8 131 aa11.48□□□□□ -0.57
SPNS1-201ENST00000311008 TGP01266 2768 aa11.47□□□□□ -0.57
SPNS1-201ENST00000311008 SPINK6Q6UWN8 80 aa11.47□□□□□ -0.57
SPNS1-201ENST00000311008 A0A087X002 238 aa11.45□□□□□ -0.58
SPNS1-201ENST00000311008 C8orf87E5RJ46 101 aa11.45□□□□□ -0.58
SPNS1-201ENST00000311008 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa11.45□□□□□ -0.58
SPNS1-201ENST00000311008 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa11.45□□□□□ -0.58
SPNS1-201ENST00000311008 PCOTHQ58A44 107 aa11.43□□□□□ -0.58
SPNS1-201ENST00000311008 C4orf48Q5BLP8 95 aa11.42□□□□□ -0.58
SPNS1-201ENST00000311008 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa11.41□□□□□ -0.58
SPNS1-201ENST00000311008 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa11.4□□□□□ -0.58
SPNS1-201ENST00000311008 KRTAP10-1P60331 282 aa11.4□□□□□ -0.58
SPNS1-201ENST00000311008 COA5Q86WW8 74 aa11.38□□□□□ -0.59
SPNS1-201ENST00000311008 LIMD2Q9BT23 127 aa11.37□□□□□ -0.59
SPNS1-201ENST00000311008 DNAH5Q8TE73 4624 aa11.36□□□□□ -0.59
SPNS1-201ENST00000311008 DNAH11Q96DT5 4516 aa11.36□□□□□ -0.59
SPNS1-201ENST00000311008 PSPHP1O15172 72 aa11.35□□□□□ -0.59
SPNS1-201ENST00000311008 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa11.35□□□□□ -0.59
SPNS1-201ENST00000311008 ALMS1Q8TCU4 4167 aa11.34□□□□□ -0.59
SPNS1-201ENST00000311008 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
SPNS1-201ENST00000311008 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa11.32□□□□□ -0.6
SPNS1-201ENST00000311008 LINC00313P59037 77 aa11.32□□□□□ -0.6
SPNS1-201ENST00000311008 Q5W150 140 aa11.29□□□□□ -0.6
SPNS1-201ENST00000311008 A8MUN3 132 aa11.29□□□□□ -0.6
SPNS1-201ENST00000311008 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa11.26□□□□□ -0.61
SPNS1-201ENST00000311008 FAM229AH3BQW9 127 aa11.25□□□□□ -0.61
SPNS1-201ENST00000311008 Q5VV11 94 aa11.24□□□□□ -0.61
SPNS1-201ENST00000311008 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa11.24□□□□□ -0.61
SPNS1-201ENST00000311008 PKD1P98161 4303 aa11.21□□□□□ -0.61
SPNS1-201ENST00000311008 HRES1P13985 223 aa11.21□□□□□ -0.62
SPNS1-201ENST00000311008 PRR15LQ9BU68 103 aa11.2□□□□□ -0.62
SPNS1-201ENST00000311008 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
SPNS1-201ENST00000311008 LRP1BQ9NZR2 4599 aa11.17□□□□□ -0.62
SPNS1-201ENST00000311008 FAT2Q9NYQ8 4349 aa11.17□□□□□ -0.62
SPNS1-201ENST00000311008 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa11.15□□□□□ -0.62
SPNS1-201ENST00000311008 SPINK1P00995 79 aa11.15□□□□□ -0.62
SPNS1-201ENST00000311008 Q75L30 129 aa11.15□□□□□ -0.62
SPNS1-201ENST00000311008 TYMSOSQ8TAI1 123 aa11.15□□□□□ -0.62
SPNS1-201ENST00000311008 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa11.15□□□□□ -0.62
SPNS1-201ENST00000311008 A6NN06 94 aa11.14□□□□□ -0.63
SPNS1-201ENST00000311008 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa11.13□□□□□ -0.63
SPNS1-201ENST00000311008 ACYP2P14621 99 aa11.13□□□□□ -0.63
SPNS1-201ENST00000311008 IGKV2-30P06310 120 aa11.11□□□□□ -0.63
SPNS1-201ENST00000311008 SPAG11AQ6PDA7 123 aa11.11□□□□□ -0.63
SPNS1-201ENST00000311008 C7orf65Q6ZTY9 151 aa11.11□□□□□ -0.63
SPNS1-201ENST00000311008 HYDINQ4G0P3 5121 aa11.1□□□□□ -0.63
SPNS1-201ENST00000311008 LCA10Q71F78 164 aa11.08□□□□□ -0.64
SPNS1-201ENST00000311008 DMAC1Q96GE9 116 aa11.08□□□□□ -0.64
SPNS1-201ENST00000311008 A8MU10 97 aa11.07□□□□□ -0.64
SPNS1-201ENST00000311008 RPS29P62273 56 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
SPNS1-201ENST00000311008 SPTSSBQ8NFR3 76 aa11.05□□□□□ -0.64
SPNS1-201ENST00000311008 RETNLBQ9BQ08 111 aa11.04□□□□□ -0.64
SPNS1-201ENST00000311008 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa11.03□□□□□ -0.64
SPNS1-201ENST00000311008 A6NED7 52 aa11.01□□□□□ -0.65
SPNS1-201ENST00000311008 LINC00304Q8N9R0 145 aa11□□□□□ -0.65
SPNS1-201ENST00000311008 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa11□□□□□ -0.65
SPNS1-201ENST00000311008 PRR26Q8N8Z3 221 aa10.98□□□□□ -0.65
SPNS1-201ENST00000311008 H3BS24 57 aa10.96□□□□□ -0.66
SPNS1-201ENST00000311008 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa10.92□□□□□ -0.66
SPNS1-201ENST00000311008 A0A1B0GVY2 172 aa10.88□□□□□ -0.67
SPNS1-201ENST00000311008 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
SPNS1-201ENST00000311008 SACSQ9NZJ4 4579 aa10.84□□□□□ -0.67
SPNS1-201ENST00000311008 SPINK7P58062 85 aa10.81□□□□□ -0.68
SPNS1-201ENST00000311008 PKHD1P08F94 4074 aa10.8□□□□□ -0.68
SPNS1-201ENST00000311008 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
SPNS1-201ENST00000311008 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
SPNS1-201ENST00000311008 A0A1B0GU69 56 aa10.76□□□□□ -0.69
SPNS1-201ENST00000311008 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa10.73□□□□□ -0.69
SPNS1-201ENST00000311008 LINC01554Q52M75 96 aa10.73□□□□□ -0.69
SPNS1-201ENST00000311008 A8MUU9 505 aa10.72□□□□□ -0.69
SPNS1-201ENST00000311008 C9orf92A6NGG3 77 aa10.66□□□□□ -0.7
SPNS1-201ENST00000311008 APOBP04114 4563 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
SPNS1-201ENST00000311008 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa10.63□□□□□ -0.71
SPNS1-201ENST00000311008 RYR2Q92736 4967 aa10.61□□□□□ -0.71
SPNS1-201ENST00000311008 Q8N1X5 172 aa10.61□□□□□ -0.71
SPNS1-201ENST00000311008 UQCR11O14957 56 aa10.58□□□□□ -0.72
SPNS1-201ENST00000311008 SPATA8Q6RVD6 105 aa10.57□□□□□ -0.72
SPNS1-201ENST00000311008 FAT1Q14517 4588 aa10.57□□□□□ -0.72
SPNS1-201ENST00000311008 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
SPNS1-201ENST00000311008 PRAC1Q96KF2 57 aa10.53□□□□□ -0.72
SPNS1-201ENST00000311008 MIR22HGQ0VDD5 57 aa10.51□□□□□ -0.73
SPNS1-201ENST00000311008 KRTAP10-8P60410 259 aa10.42□□□□□ -0.74
SPNS1-201ENST00000311008 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa10.42□□□□□ -0.74
SPNS1-201ENST00000311008 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
SPNS1-201ENST00000311008 Q5VSD8 79 aa10.37□□□□□ -0.75
SPNS1-201ENST00000311008 ADM2Q7Z4H4 148 aa10.37□□□□□ -0.75
SPNS1-201ENST00000311008 COX6B2Q6YFQ2 88 aa10.36□□□□□ -0.75
SPNS1-201ENST00000311008 RYR3Q15413 4870 aa10.26□□□□□ -0.77
SPNS1-201ENST00000311008 FAT3Q8TDW7 4589 aa10.26□□□□□ -0.77
SPNS1-201ENST00000311008 RPL37P61927 97 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
SPNS1-201ENST00000311008 TNXBP22105 4242 aa10.25□□□□□ -0.77
SPNS1-201ENST00000311008 A0A1B0GU33 70 aa10.21□□□□□ -0.77
SPNS1-201ENST00000311008 XP32Q5T750 250 aa10.18□□□□□ -0.78
SPNS1-201ENST00000311008 CSAG1Q6PB30 78 aa10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms