RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000237696.9

RARRES1-201, Transcript of retinoic acid receptor responder 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RARRES1, Length 1,952 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1-201ENST00000237696 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa11.12□□□□□ -0.63
RARRES1-201ENST00000237696 H0Y9P7 68 aa11.12□□□□□ -0.63
RARRES1-201ENST00000237696 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
RARRES1-201ENST00000237696 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa11.12□□□□□ -0.63
RARRES1-201ENST00000237696 PRR4Q16378 134 aa11.11□□□□□ -0.63
RARRES1-201ENST00000237696 LINC00483Q53H64 154 aa11.1□□□□□ -0.63
RARRES1-201ENST00000237696 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
RARRES1-201ENST00000237696 V9GYY9 64 aa11.08□□□□□ -0.64
RARRES1-201ENST00000237696 APOBP04114 4563 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
RARRES1-201ENST00000237696 MOBPQ13875 183 aa11.03□□□□□ -0.64
RARRES1-201ENST00000237696 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa11.02□□□□□ -0.65
RARRES1-201ENST00000237696 C1orf195Q5TG92 126 aa11.01□□□□□ -0.65
RARRES1-201ENST00000237696 PSPHP1O15172 72 aa11□□□□□ -0.65
RARRES1-201ENST00000237696 FAT1Q14517 4588 aa11□□□□□ -0.65
RARRES1-201ENST00000237696 A0A087X002 238 aa10.96□□□□□ -0.66
RARRES1-201ENST00000237696 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa10.94□□□□□ -0.66
RARRES1-201ENST00000237696 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa10.94□□□□□ -0.66
RARRES1-201ENST00000237696 Q96NJ1 140 aa10.94□□□□□ -0.66
RARRES1-201ENST00000237696 A8MUN3 132 aa10.92□□□□□ -0.66
RARRES1-201ENST00000237696 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa10.92□□□□□ -0.66
RARRES1-201ENST00000237696 LIMD2Q9BT23 127 aa10.92□□□□□ -0.66
RARRES1-201ENST00000237696 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa10.91□□□□□ -0.66
RARRES1-201ENST00000237696 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa10.91□□□□□ -0.66
RARRES1-201ENST00000237696 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.66
RARRES1-201ENST00000237696 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.66
RARRES1-201ENST00000237696 Q5VV11 94 aa10.88□□□□□ -0.67
RARRES1-201ENST00000237696 C8orf17Q9NRJ1 99 aa10.87□□□□□ -0.67
RARRES1-201ENST00000237696 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
RARRES1-201ENST00000237696 SPINK6Q6UWN8 80 aa10.86□□□□□ -0.67
RARRES1-201ENST00000237696 COA5Q86WW8 74 aa10.85□□□□□ -0.67
RARRES1-201ENST00000237696 A0A1B0GVX0 72 aa10.83□□□□□ -0.68
RARRES1-201ENST00000237696 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
RARRES1-201ENST00000237696 HSPG2P98160 4391 aa10.81□□□□□ -0.68
RARRES1-201ENST00000237696 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa10.81□□□□□ -0.68
RARRES1-201ENST00000237696 CDK2AP2O75956 126 aa10.79□□□□□ -0.68
RARRES1-201ENST00000237696 PCOTHQ58A44 107 aa10.79□□□□□ -0.68
RARRES1-201ENST00000237696 PRR15LQ9BU68 103 aa10.79□□□□□ -0.68
RARRES1-201ENST00000237696 CD164Q04900 197 aa10.79□□□□□ -0.68
RARRES1-201ENST00000237696 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa10.79□□□□□ -0.68
RARRES1-201ENST00000237696 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa10.78□□□□□ -0.68
RARRES1-201ENST00000237696 PRR26Q8N8Z3 221 aa10.78□□□□□ -0.68
RARRES1-201ENST00000237696 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa10.77□□□□□ -0.68
RARRES1-201ENST00000237696 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.68
RARRES1-201ENST00000237696 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa10.77□□□□□ -0.69
RARRES1-201ENST00000237696 NDUFS5O43920 106 aa10.76□□□□□ -0.69
RARRES1-201ENST00000237696 PMAIP1Q13794 54 aa10.76□□□□□ -0.69
RARRES1-201ENST00000237696 Q75L30 129 aa10.76□□□□□ -0.69
RARRES1-201ENST00000237696 RYR1P21817 5038 aa10.75□□□□□ -0.69
RARRES1-201ENST00000237696 FAM229AH3BQW9 127 aa10.74□□□□□ -0.69
RARRES1-201ENST00000237696 TYMSOSQ8TAI1 123 aa10.74□□□□□ -0.69
RARRES1-201ENST00000237696 KIAA1109Q2LD37 5005 aa10.74□□□□□ -0.69
RARRES1-201ENST00000237696 Q5VSD8 79 aa10.73□□□□□ -0.69
RARRES1-201ENST00000237696 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa10.68□□□□□ -0.7
RARRES1-201ENST00000237696 A8MU10 97 aa10.66□□□□□ -0.7
RARRES1-201ENST00000237696 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa10.65□□□□□ -0.71
RARRES1-201ENST00000237696 A6NED7 52 aa10.64□□□□□ -0.71
RARRES1-201ENST00000237696 HRES1P13985 223 aa10.63□□□□□ -0.71
RARRES1-201ENST00000237696 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa10.63□□□□□ -0.71
RARRES1-201ENST00000237696 C4orf48Q5BLP8 95 aa10.62□□□□□ -0.71
RARRES1-201ENST00000237696 SPAG11AQ6PDA7 123 aa10.61□□□□□ -0.71
RARRES1-201ENST00000237696 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa10.61□□□□□ -0.71
RARRES1-201ENST00000237696 LCA10Q71F78 164 aa10.61□□□□□ -0.71
RARRES1-201ENST00000237696 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
RARRES1-201ENST00000237696 LINC00304Q8N9R0 145 aa10.59□□□□□ -0.71
RARRES1-201ENST00000237696 SEC61GP60059 68 aa10.58□□□□□ -0.72
RARRES1-201ENST00000237696 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa10.58□□□□□ -0.72
RARRES1-201ENST00000237696 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa10.58□□□□□ -0.72
RARRES1-201ENST00000237696 C8orf87E5RJ46 101 aa10.56□□□□□ -0.72
RARRES1-201ENST00000237696 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
RARRES1-201ENST00000237696 SPINK1P00995 79 aa10.54□□□□□ -0.72
RARRES1-201ENST00000237696 Q5W150 140 aa10.54□□□□□ -0.72
RARRES1-201ENST00000237696 Q8N1X5 172 aa10.54□□□□□ -0.72
RARRES1-201ENST00000237696 SPTSSBQ8NFR3 76 aa10.54□□□□□ -0.72
RARRES1-201ENST00000237696 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa10.48□□□□□ -0.73
RARRES1-201ENST00000237696 ACYP2P14621 99 aa10.48□□□□□ -0.73
RARRES1-201ENST00000237696 MYCBP2O75592 4640 aa10.45□□□□□ -0.74
RARRES1-201ENST00000237696 TNXBP22105 4242 aa10.45□□□□□ -0.74
RARRES1-201ENST00000237696 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa10.45□□□□□ -0.74
RARRES1-201ENST00000237696 A6NN06 94 aa10.45□□□□□ -0.74
RARRES1-201ENST00000237696 KRTAP10-8P60410 259 aa10.44□□□□□ -0.74
RARRES1-201ENST00000237696 FAT3Q8TDW7 4589 aa10.44□□□□□ -0.74
RARRES1-201ENST00000237696 SPINK7P58062 85 aa10.43□□□□□ -0.74
RARRES1-201ENST00000237696 LINC00313P59037 77 aa10.42□□□□□ -0.74
RARRES1-201ENST00000237696 DMAC1Q96GE9 116 aa10.41□□□□□ -0.74
RARRES1-201ENST00000237696 RETNLBQ9BQ08 111 aa10.41□□□□□ -0.74
RARRES1-201ENST00000237696 RPS29P62273 56 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
RARRES1-201ENST00000237696 IGKV2-30P06310 120 aa10.34□□□□□ -0.75
RARRES1-201ENST00000237696 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
RARRES1-201ENST00000237696 MT1HL1P0DM35 61 aa10.33□□□□□ -0.76
RARRES1-201ENST00000237696 C7orf65Q6ZTY9 151 aa10.29□□□□□ -0.76
RARRES1-201ENST00000237696 BIRC6Q9NR09 4857 aa10.28□□□□□ -0.76
RARRES1-201ENST00000237696 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa10.28□□□□□ -0.76
RARRES1-201ENST00000237696 C9orf92A6NGG3 77 aa10.25□□□□□ -0.77
RARRES1-201ENST00000237696 A0A1B0GU69 56 aa10.23□□□□□ -0.77
RARRES1-201ENST00000237696 ABCA13Q86UQ4 5058 aa10.23□□□□□ -0.77
RARRES1-201ENST00000237696 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa10.23□□□□□ -0.77
RARRES1-201ENST00000237696 HERC2O95714 4834 aa10.18□□□□□ -0.78
RARRES1-201ENST00000237696 SPATA8Q6RVD6 105 aa10.14□□□□□ -0.79
RARRES1-201ENST00000237696 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa10.14□□□□□ -0.79
RARRES1-201ENST00000237696 UQCR11O14957 56 aa10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.2 ms