RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000223423.8

PTGS1-201, Transcript of prostaglandin-endoperoxide synthase 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTGS1, Length 2,328 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1-201ENST00000223423 SPINK6Q6UWN8 80 aa7.29□□□□□ -1.24
PTGS1-201ENST00000223423 LINC00336Q6ZUF6 198 aa7.29□□□□□ -1.24
PTGS1-201ENST00000223423 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa7.29□□□□□ -1.24
PTGS1-201ENST00000223423 SERP1Q9Y6X1 66 aa7.29□□□□□ -1.24
PTGS1-201ENST00000223423 FAM229BQ4G0N7 80 aa7.28□□□□□ -1.24
PTGS1-201ENST00000223423 MP68P56378 58 aa7.28□□□□□ -1.24
PTGS1-201ENST00000223423 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PTGS1-201ENST00000223423 H0Y9P7 68 aa7.27□□□□□ -1.25
PTGS1-201ENST00000223423 LINC00208Q96KT6 92 aa7.27□□□□□ -1.25
PTGS1-201ENST00000223423 TRAV22A0A0B4J277 110 aa7.23□□□□□ -1.25
PTGS1-201ENST00000223423 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PTGS1-201ENST00000223423 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PTGS1-201ENST00000223423 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PTGS1-201ENST00000223423 H3BPC8 53 aa7.21□□□□□ -1.26
PTGS1-201ENST00000223423 C1orf64Q8NEQ6 169 aa7.21□□□□□ -1.26
PTGS1-201ENST00000223423 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa7.21□□□□□ -1.26
PTGS1-201ENST00000223423 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa7.21□□□□□ -1.26
PTGS1-201ENST00000223423 APOBP04114 4563 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PTGS1-201ENST00000223423 NDUFS5O43920 106 aa7.2□□□□□ -1.26
PTGS1-201ENST00000223423 Q5XG85 94 aa7.2□□□□□ -1.26
PTGS1-201ENST00000223423 KIAA1109Q2LD37 5005 aa7.2□□□□□ -1.26
PTGS1-201ENST00000223423 C1orf195Q5TG92 126 aa7.19□□□□□ -1.26
PTGS1-201ENST00000223423 PRR4Q16378 134 aa7.18□□□□□ -1.26
PTGS1-201ENST00000223423 FAT1Q14517 4588 aa7.17□□□□□ -1.26
PTGS1-201ENST00000223423 TYMSOSQ8TAI1 123 aa7.17□□□□□ -1.26
PTGS1-201ENST00000223423 C8orf87E5RJ46 101 aa7.15□□□□□ -1.27
PTGS1-201ENST00000223423 PRR26Q8N8Z3 221 aa7.14□□□□□ -1.27
PTGS1-201ENST00000223423 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa7.14□□□□□ -1.27
PTGS1-201ENST00000223423 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PTGS1-201ENST00000223423 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PTGS1-201ENST00000223423 LIMD2Q9BT23 127 aa7.13□□□□□ -1.27
PTGS1-201ENST00000223423 SMIM26A0A096LP01 95 aa7.13□□□□□ -1.27
PTGS1-201ENST00000223423 LINC00313P59037 77 aa7.12□□□□□ -1.27
PTGS1-201ENST00000223423 C4orf26Q17RF5 130 aa7.12□□□□□ -1.27
PTGS1-201ENST00000223423 Q5W150 140 aa7.11□□□□□ -1.27
PTGS1-201ENST00000223423 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa7.11□□□□□ -1.27
PTGS1-201ENST00000223423 HSPG2P98160 4391 aa7.11□□□□□ -1.27
PTGS1-201ENST00000223423 SPINK1P00995 79 aa7.1□□□□□ -1.27
PTGS1-201ENST00000223423 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa7.1□□□□□ -1.27
PTGS1-201ENST00000223423 PCOTHQ58A44 107 aa7.1□□□□□ -1.27
PTGS1-201ENST00000223423 LINC00304Q8N9R0 145 aa7.07□□□□□ -1.28
PTGS1-201ENST00000223423 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa7.07□□□□□ -1.28
PTGS1-201ENST00000223423 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PTGS1-201ENST00000223423 RYR1P21817 5038 aa7.06□□□□□ -1.28
PTGS1-201ENST00000223423 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa7.06□□□□□ -1.28
PTGS1-201ENST00000223423 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.05□□□□□ -1.28
PTGS1-201ENST00000223423 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa7.05□□□□□ -1.28
PTGS1-201ENST00000223423 MPLKIPQ8TAP9 179 aa7.03□□□□□ -1.28
PTGS1-201ENST00000223423 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa7.02□□□□□ -1.28
PTGS1-201ENST00000223423 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.28
PTGS1-201ENST00000223423 SPAG11AQ6PDA7 123 aa7.02□□□□□ -1.29
PTGS1-201ENST00000223423 RETNLBQ9BQ08 111 aa7.01□□□□□ -1.29
PTGS1-201ENST00000223423 BIRC6Q9NR09 4857 aa7.01□□□□□ -1.29
PTGS1-201ENST00000223423 FAM229AH3BQW9 127 aa7□□□□□ -1.29
PTGS1-201ENST00000223423 Q5VSD8 79 aa6.98□□□□□ -1.29
PTGS1-201ENST00000223423 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PTGS1-201ENST00000223423 COA5Q86WW8 74 aa6.95□□□□□ -1.3
PTGS1-201ENST00000223423 Q1T7F1 81 aa6.94□□□□□ -1.3
PTGS1-201ENST00000223423 IGKV2-30P06310 120 aa6.93□□□□□ -1.3
PTGS1-201ENST00000223423 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PTGS1-201ENST00000223423 Q8N1X5 172 aa6.91□□□□□ -1.3
PTGS1-201ENST00000223423 MYCBP2O75592 4640 aa6.9□□□□□ -1.3
PTGS1-201ENST00000223423 HRES1P13985 223 aa6.9□□□□□ -1.3
PTGS1-201ENST00000223423 ABCA13Q86UQ4 5058 aa6.9□□□□□ -1.3
PTGS1-201ENST00000223423 C9orf92A6NGG3 77 aa6.88□□□□□ -1.31
PTGS1-201ENST00000223423 HERC2O95714 4834 aa6.87□□□□□ -1.31
PTGS1-201ENST00000223423 TNXBP22105 4242 aa6.87□□□□□ -1.31
PTGS1-201ENST00000223423 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.87□□□□□ -1.31
PTGS1-201ENST00000223423 PSPHP1O15172 72 aa6.85□□□□□ -1.31
PTGS1-201ENST00000223423 PCLOQ9Y6V0 5065 aa6.84□□□□□ -1.31
PTGS1-201ENST00000223423 KRTAP10-8P60410 259 aa6.84□□□□□ -1.31
PTGS1-201ENST00000223423 DMAC1Q96GE9 116 aa6.83□□□□□ -1.32
PTGS1-201ENST00000223423 V9GYY9 64 aa6.83□□□□□ -1.32
PTGS1-201ENST00000223423 A8MUN3 132 aa6.82□□□□□ -1.32
PTGS1-201ENST00000223423 J3QL48 77 aa6.82□□□□□ -1.32
PTGS1-201ENST00000223423 FAT3Q8TDW7 4589 aa6.82□□□□□ -1.32
PTGS1-201ENST00000223423 A8MUU9 505 aa6.82□□□□□ -1.32
PTGS1-201ENST00000223423 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.82□□□□□ -1.32
PTGS1-201ENST00000223423 ACYP2P14621 99 aa6.81□□□□□ -1.32
PTGS1-201ENST00000223423 Q5VV11 94 aa6.78□□□□□ -1.32
PTGS1-201ENST00000223423 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.77□□□□□ -1.33
PTGS1-201ENST00000223423 BRK1Q8WUW1 75 aa6.77□□□□□ -1.33
PTGS1-201ENST00000223423 PRR15LQ9BU68 103 aa6.77□□□□□ -1.33
PTGS1-201ENST00000223423 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.74□□□□□ -1.33
PTGS1-201ENST00000223423 PRO0628Q9UI54 55 aa6.73□□□□□ -1.33
PTGS1-201ENST00000223423 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.72□□□□□ -1.33
PTGS1-201ENST00000223423 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PTGS1-201ENST00000223423 Q75L30 129 aa6.7□□□□□ -1.34
PTGS1-201ENST00000223423 MT1HL1P0DM35 61 aa6.7□□□□□ -1.34
PTGS1-201ENST00000223423 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.68□□□□□ -1.34
PTGS1-201ENST00000223423 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.68□□□□□ -1.34
PTGS1-201ENST00000223423 SPINK7P58062 85 aa6.66□□□□□ -1.34
PTGS1-201ENST00000223423 A8MU10 97 aa6.64□□□□□ -1.35
PTGS1-201ENST00000223423 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTGS1-201ENST00000223423 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.61□□□□□ -1.35
PTGS1-201ENST00000223423 A6NED7 52 aa6.6□□□□□ -1.35
PTGS1-201ENST00000223423 XP32Q5T750 250 aa6.6□□□□□ -1.35
PTGS1-201ENST00000223423 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.36
PTGS1-201ENST00000223423 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.59□□□□□ -1.36
PTGS1-201ENST00000223423 HERC1Q15751 4861 aa6.59□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms