RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627212.2

RAPGEF6-215, Transcript of Rap guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAPGEF6, Length 4,694 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF6-215ENST00000627212 IGSF10Q6WRI0 2623 aa6.42□□□□□ -1.38
RAPGEF6-215ENST00000627212 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.42□□□□□ -1.38
RAPGEF6-215ENST00000627212 A0A1B0GVX0 72 aa6.41□□□□□ -1.38
RAPGEF6-215ENST00000627212 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.4□□□□□ -1.38
RAPGEF6-215ENST00000627212 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.4□□□□□ -1.38
RAPGEF6-215ENST00000627212 EYSQ5T1H1 3165 aa6.4□□□□□ -1.39
RAPGEF6-215ENST00000627212 UQCR11O14957 56 aa6.4□□□□□ -1.39
RAPGEF6-215ENST00000627212 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa6.39□□□□□ -1.39
RAPGEF6-215ENST00000627212 Q8NDZ9 215 aa6.39□□□□□ -1.39
RAPGEF6-215ENST00000627212 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.39□□□□□ -1.39
RAPGEF6-215ENST00000627212 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
RAPGEF6-215ENST00000627212 ZNF861PO60384 105 aa6.39□□□□□ -1.39
RAPGEF6-215ENST00000627212 CELSR2Q9HCU4 2923 aa6.39□□□□□ -1.39
RAPGEF6-215ENST00000627212 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RAPGEF6-215ENST00000627212 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.39□□□□□ -1.39
RAPGEF6-215ENST00000627212 C9orf92A6NGG3 77 aa6.38□□□□□ -1.39
RAPGEF6-215ENST00000627212 LRBAP50851 2863 aa6.38□□□□□ -1.39
RAPGEF6-215ENST00000627212 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.37□□□□□ -1.39
RAPGEF6-215ENST00000627212 OCR1Q9BZK8 76 aa6.37□□□□□ -1.39
RAPGEF6-215ENST00000627212 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.37□□□□□ -1.39
RAPGEF6-215ENST00000627212 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.36□□□□□ -1.39
RAPGEF6-215ENST00000627212 A0A087WTM6 91 aa6.36□□□□□ -1.39
RAPGEF6-215ENST00000627212 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.36□□□□□ -1.39
RAPGEF6-215ENST00000627212 HIVEP1P15822 2718 aa6.36□□□□□ -1.39
RAPGEF6-215ENST00000627212 KRTAP1-1Q07627 177 aa6.36□□□□□ -1.39
RAPGEF6-215ENST00000627212 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.35□□□□□ -1.39
RAPGEF6-215ENST00000627212 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
RAPGEF6-215ENST00000627212 Q8N1X5 172 aa6.34□□□□□ -1.39
RAPGEF6-215ENST00000627212 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.33□□□□□ -1.4
RAPGEF6-215ENST00000627212 SPRR4Q96PI1 79 aa6.32□□□□□ -1.4
RAPGEF6-215ENST00000627212 APLNQ9ULZ1 77 aa6.31□□□□□ -1.4
RAPGEF6-215ENST00000627212 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.3□□□□□ -1.4
RAPGEF6-215ENST00000627212 IGLV7-43P04211 117 aa6.29□□□□□ -1.4
RAPGEF6-215ENST00000627212 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.29□□□□□ -1.4
RAPGEF6-215ENST00000627212 ITPR2Q14571 2701 aa6.29□□□□□ -1.4
RAPGEF6-215ENST00000627212 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.28□□□□□ -1.4
RAPGEF6-215ENST00000627212 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6.28□□□□□ -1.4
RAPGEF6-215ENST00000627212 ZANQ9Y493 2812 aa6.28□□□□□ -1.4
RAPGEF6-215ENST00000627212 A0A0D9SG42 100 aa6.27□□□□□ -1.41
RAPGEF6-215ENST00000627212 CD164Q04900 197 aa6.27□□□□□ -1.41
RAPGEF6-215ENST00000627212 MYO15AQ9UKN7 3530 aa6.27□□□□□ -1.41
RAPGEF6-215ENST00000627212 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RAPGEF6-215ENST00000627212 APCP25054 2843 aa6.27□□□□□ -1.41
RAPGEF6-215ENST00000627212 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RAPGEF6-215ENST00000627212 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
RAPGEF6-215ENST00000627212 Q5XG85 94 aa6.25□□□□□ -1.41
RAPGEF6-215ENST00000627212 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.25□□□□□ -1.41
RAPGEF6-215ENST00000627212 DCHS2Q6V1P9 2916 aa6.24□□□□□ -1.41
RAPGEF6-215ENST00000627212 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa6.24□□□□□ -1.41
RAPGEF6-215ENST00000627212 LINC01554Q52M75 96 aa6.23□□□□□ -1.41
RAPGEF6-215ENST00000627212 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.22□□□□□ -1.41
RAPGEF6-215ENST00000627212 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.22□□□□□ -1.41
RAPGEF6-215ENST00000627212 OXTP01178 125 aa6.22□□□□□ -1.41
RAPGEF6-215ENST00000627212 LCA10Q71F78 164 aa6.21□□□□□ -1.41
RAPGEF6-215ENST00000627212 TNP2Q05952 138 aa6.21□□□□□ -1.42
RAPGEF6-215ENST00000627212 DMXL1Q9Y485 3027 aa6.2□□□□□ -1.42
RAPGEF6-215ENST00000627212 Q1T7F1 81 aa6.2□□□□□ -1.42
RAPGEF6-215ENST00000627212 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
RAPGEF6-215ENST00000627212 CRIPTQ9P021 101 aa6.19□□□□□ -1.42
RAPGEF6-215ENST00000627212 HRES1P13985 223 aa6.18□□□□□ -1.42
RAPGEF6-215ENST00000627212 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP6.18□□□□□ -1.42
RAPGEF6-215ENST00000627212 NF1P21359 2839 aa6.18□□□□□ -1.42
RAPGEF6-215ENST00000627212 LOC400499M0QZD8 3231 aa6.17□□□□□ -1.42
RAPGEF6-215ENST00000627212 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.17□□□□□ -1.42
RAPGEF6-215ENST00000627212 PRAC1Q96KF2 57 aa6.17□□□□□ -1.42
RAPGEF6-215ENST00000627212 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.16□□□□□ -1.42
RAPGEF6-215ENST00000627212 USP34Q70CQ2 3546 aa6.15□□□□□ -1.42
RAPGEF6-215ENST00000627212 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.15□□□□□ -1.42
RAPGEF6-215ENST00000627212 TENM4Q6N022 2769 aa6.15□□□□□ -1.43
RAPGEF6-215ENST00000627212 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
RAPGEF6-215ENST00000627212 FBN2P35556 2912 aa6.14□□□□□ -1.43
RAPGEF6-215ENST00000627212 WIPF1O43516 503 aa6.14□□□□□ -1.43
RAPGEF6-215ENST00000627212 SPRR1AP35321 89 aa6.14□□□□□ -1.43
RAPGEF6-215ENST00000627212 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.13□□□□□ -1.43
RAPGEF6-215ENST00000627212 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.13□□□□□ -1.43
RAPGEF6-215ENST00000627212 J3QL48 77 aa6.11□□□□□ -1.43
RAPGEF6-215ENST00000627212 Q5VV11 94 aa6.1□□□□□ -1.43
RAPGEF6-215ENST00000627212 SPINK7P58062 85 aa6.1□□□□□ -1.43
RAPGEF6-215ENST00000627212 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.1□□□□□ -1.43
RAPGEF6-215ENST00000627212 Q75L30 129 aa6.09□□□□□ -1.43
RAPGEF6-215ENST00000627212 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.08□□□□□ -1.44
RAPGEF6-215ENST00000627212 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
RAPGEF6-215ENST00000627212 TENM3Q9P273 2699 aa6.07□□□□□ -1.44
RAPGEF6-215ENST00000627212 A0A1B0GU33 70 aa6.07□□□□□ -1.44
RAPGEF6-215ENST00000627212 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.06□□□□□ -1.44
RAPGEF6-215ENST00000627212 Q5W150 140 aa6.04□□□□□ -1.44
RAPGEF6-215ENST00000627212 PANO1I0J062 215 aa6.02□□□□□ -1.45
RAPGEF6-215ENST00000627212 SPRR1BP22528 89 aa6□□□□□ -1.45
RAPGEF6-215ENST00000627212 DCHS1Q96JQ0 3298 aa6□□□□□ -1.45
RAPGEF6-215ENST00000627212 CSAG1Q6PB30 78 aa5.99□□□□□ -1.45
RAPGEF6-215ENST00000627212 PLAC8Q9NZF1 115 aa5.99□□□□□ -1.45
RAPGEF6-215ENST00000627212 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
RAPGEF6-215ENST00000627212 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa5.97□□□□□ -1.45
RAPGEF6-215ENST00000627212 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
RAPGEF6-215ENST00000627212 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
RAPGEF6-215ENST00000627212 Q6ZSA8 131 aa5.95□□□□□ -1.46
RAPGEF6-215ENST00000627212 A0A087X002 238 aa5.94□□□□□ -1.46
RAPGEF6-215ENST00000627212 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa5.94□□□□□ -1.46
RAPGEF6-215ENST00000627212 KRTAP10-2P60368 255 aa5.92□□□□□ -1.46
RAPGEF6-215ENST00000627212 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.6 ms