RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 SNCGO76070 127 aa5.1□□□□□ -1.59
SGMS1-211ENST00000626236 GAGE2AQ6NT46 116 aa5.1□□□□□ -1.59
SGMS1-211ENST00000626236 FAT3Q8TDW7 4589 aa5.1□□□□□ -1.59
SGMS1-211ENST00000626236 ANAPC11Q9NYG5 84 aa5.1□□□□□ -1.59
SGMS1-211ENST00000626236 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa5.09□□□□□ -1.59
SGMS1-211ENST00000626236 Q6ZQY7 126 aa5.09□□□□□ -1.59
SGMS1-211ENST00000626236 DEFB105AQ8NG35 78 aa5.09□□□□□ -1.59
SGMS1-211ENST00000626236 MYCBP2O75592 4640 aa5.08□□□□□ -1.6
SGMS1-211ENST00000626236 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
SGMS1-211ENST00000626236 A0A1B0GX51 115 aa5.08□□□□□ -1.6
SGMS1-211ENST00000626236 LYRM7Q5U5X0 104 aa5.08□□□□□ -1.6
SGMS1-211ENST00000626236 A0A1W2PPM0 123 aa5.07□□□□□ -1.6
SGMS1-211ENST00000626236 LST1O00453 97 aa5.07□□□□□ -1.6
SGMS1-211ENST00000626236 DNAL4O96015 105 aa5.07□□□□□ -1.6
SGMS1-211ENST00000626236 LINC00483Q53H64 154 aa5.07□□□□□ -1.6
SGMS1-211ENST00000626236 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
SGMS1-211ENST00000626236 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa5.06□□□□□ -1.6
SGMS1-211ENST00000626236 A0A087X002 238 aa5.06□□□□□ -1.6
SGMS1-211ENST00000626236 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa5.06□□□□□ -1.6
SGMS1-211ENST00000626236 TCL1BO95988 128 aa5.06□□□□□ -1.6
SGMS1-211ENST00000626236 CRYGAP11844 174 aa5.06□□□□□ -1.6
SGMS1-211ENST00000626236 FABP2P12104 132 aa5.06□□□□□ -1.6
SGMS1-211ENST00000626236 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
SGMS1-211ENST00000626236 ATXN8Q156A1 80 aa5.06□□□□□ -1.6
SGMS1-211ENST00000626236 FAM229BQ4G0N7 80 aa5.06□□□□□ -1.6
SGMS1-211ENST00000626236 LINC01600Q96MT4 127 aa5.06□□□□□ -1.6
SGMS1-211ENST00000626236 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa5.05□□□□□ -1.6
SGMS1-211ENST00000626236 OXTP01178 125 aa5.05□□□□□ -1.6
SGMS1-211ENST00000626236 SPRR1BP22528 89 aa5.05□□□□□ -1.6
SGMS1-211ENST00000626236 Q8N377 158 aa5.05□□□□□ -1.6
SGMS1-211ENST00000626236 PRR26Q8N8Z3 221 aa5.05□□□□□ -1.6
SGMS1-211ENST00000626236 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
SGMS1-211ENST00000626236 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa5.04□□□□□ -1.6
SGMS1-211ENST00000626236 TRACP01848 142 aa5.04□□□□□ -1.6
SGMS1-211ENST00000626236 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa5.04□□□□□ -1.6
SGMS1-211ENST00000626236 OCIAD2Q56VL3 154 aa5.04□□□□□ -1.6
SGMS1-211ENST00000626236 C3orf22Q8N5N4 141 aa5.04□□□□□ -1.6
SGMS1-211ENST00000626236 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.04□□□□□ -1.6
SGMS1-211ENST00000626236 ORMDL1Q9P0S3 153 aa5.04□□□□□ -1.6
SGMS1-211ENST00000626236 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
SGMS1-211ENST00000626236 C9orf153Q5TBE3 101 aa5.03□□□□□ -1.6
SGMS1-211ENST00000626236 SMIM29Q86T20 159 aa5.03□□□□□ -1.6
SGMS1-211ENST00000626236 PPDPFLQ8WWR9 84 aa5.03□□□□□ -1.6
SGMS1-211ENST00000626236 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa5.03□□□□□ -1.6
SGMS1-211ENST00000626236 SPCS1Q9Y6A9 102 aa5.03□□□□□ -1.6
SGMS1-211ENST00000626236 MOBPQ13875 183 aa5.02□□□□□ -1.61
SGMS1-211ENST00000626236 TYMSOSQ8TAI1 123 aa5.02□□□□□ -1.61
SGMS1-211ENST00000626236 TNXBP22105 4242 aa5.02□□□□□ -1.61
SGMS1-211ENST00000626236 F8WEM9 126 aa5.01□□□□□ -1.61
SGMS1-211ENST00000626236 KRTAP10-8P60410 259 aa5.01□□□□□ -1.61
SGMS1-211ENST00000626236 C9JAW5 83 aa5□□□□□ -1.61
SGMS1-211ENST00000626236 H3BMG7 143 aa5□□□□□ -1.61
SGMS1-211ENST00000626236 H3BQ85 93 aa5□□□□□ -1.61
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa5□□□□□ -1.61
SGMS1-211ENST00000626236 MT1HL1P0DM35 61 aa5□□□□□ -1.61
SGMS1-211ENST00000626236 Q8NBF4 154 aa5□□□□□ -1.61
SGMS1-211ENST00000626236 K7EP34 96 aa4.99□□□□□ -1.61
SGMS1-211ENST00000626236 BAALC-AS2P0C853 105 aa4.99□□□□□ -1.61
SGMS1-211ENST00000626236 A0A1B0GV72 72 aa4.98□□□□□ -1.61
SGMS1-211ENST00000626236 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
SGMS1-211ENST00000626236 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa4.98□□□□□ -1.61
SGMS1-211ENST00000626236 MTURNQ8N3F0 131 aa4.98□□□□□ -1.61
SGMS1-211ENST00000626236 UBE2V1Q13404 147 aa4.97□□□□□ -1.61
SGMS1-211ENST00000626236 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa4.97□□□□□ -1.61
SGMS1-211ENST00000626236 ANKRD29Q8N6D5 301 aa4.97□□□□□ -1.61
SGMS1-211ENST00000626236 A0A0G2JQZ4 141 aa4.96□□□□□ -1.62
SGMS1-211ENST00000626236 LINC00304Q8N9R0 145 aa4.96□□□□□ -1.62
SGMS1-211ENST00000626236 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa4.95□□□□□ -1.62
SGMS1-211ENST00000626236 H3BT86 120 aa4.95□□□□□ -1.62
SGMS1-211ENST00000626236 HRCT1Q6UXD1 115 aa4.95□□□□□ -1.62
SGMS1-211ENST00000626236 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.95□□□□□ -1.62
SGMS1-211ENST00000626236 A0A1B0GV90 55 aa4.94□□□□□ -1.62
SGMS1-211ENST00000626236 Q6JHZ5 121 aa4.94□□□□□ -1.62
SGMS1-211ENST00000626236 IGFL1Q6UW32 110 aa4.94□□□□□ -1.62
SGMS1-211ENST00000626236 RBM3P98179 157 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
SGMS1-211ENST00000626236 SPAG11AQ6PDA7 123 aa4.92□□□□□ -1.62
SGMS1-211ENST00000626236 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa4.92□□□□□ -1.62
SGMS1-211ENST00000626236 PRO0461Q9UI25 63 aa4.92□□□□□ -1.62
SGMS1-211ENST00000626236 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa4.91□□□□□ -1.62
SGMS1-211ENST00000626236 SPINK1P00995 79 aa4.91□□□□□ -1.62
SGMS1-211ENST00000626236 DSCR8Q96T75 97 aa4.91□□□□□ -1.62
SGMS1-211ENST00000626236 CD164Q04900 197 aa4.9□□□□□ -1.63
SGMS1-211ENST00000626236 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
SGMS1-211ENST00000626236 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa4.89□□□□□ -1.63
SGMS1-211ENST00000626236 F8W1H4 67 aa4.89□□□□□ -1.63
SGMS1-211ENST00000626236 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa4.89□□□□□ -1.63
SGMS1-211ENST00000626236 C14orf132Q9NPU4 83 aa4.89□□□□□ -1.63
SGMS1-211ENST00000626236 HERC1Q15751 4861 aa4.89□□□□□ -1.63
SGMS1-211ENST00000626236 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa4.88□□□□□ -1.63
SGMS1-211ENST00000626236 A0A1W2PNM2 257 aa4.88□□□□□ -1.63
SGMS1-211ENST00000626236 CCKP06307 115 aa4.88□□□□□ -1.63
SGMS1-211ENST00000626236 TEN1Q86WV5 123 aa4.88□□□□□ -1.63
SGMS1-211ENST00000626236 VPS25Q9BRG1 176 aa4.88□□□□□ -1.63
SGMS1-211ENST00000626236 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa4.87□□□□□ -1.63
SGMS1-211ENST00000626236 RPS29P62273 56 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
SGMS1-211ENST00000626236 Q6Q795 121 aa4.87□□□□□ -1.63
SGMS1-211ENST00000626236 LIMD2Q9BT23 127 aa4.87□□□□□ -1.63
SGMS1-211ENST00000626236 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa4.87□□□□□ -1.63
SGMS1-211ENST00000626236 Q6ZQT0 140 aa4.86□□□□□ -1.63
SGMS1-211ENST00000626236 RETNLBQ9BQ08 111 aa4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms