RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615025.4

TNS1-221, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TNS1, Length 6,488 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-221ENST00000615025 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
TNS1-221ENST00000615025 LCE6AA0A183 80 aa6.7□□□□□ -1.34
TNS1-221ENST00000615025 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
TNS1-221ENST00000615025 ITPR3Q14573 2671 aa6.7□□□□□ -1.34
TNS1-221ENST00000615025 CDH23Q9H251 3354 aa6.69□□□□□ -1.34
TNS1-221ENST00000615025 SPINK7P58062 85 aa6.68□□□□□ -1.34
TNS1-221ENST00000615025 SPRR1AP35321 89 aa6.68□□□□□ -1.34
TNS1-221ENST00000615025 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TNS1-221ENST00000615025 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
TNS1-221ENST00000615025 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.67□□□□□ -1.34
TNS1-221ENST00000615025 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa6.67□□□□□ -1.34
TNS1-221ENST00000615025 BPTFQ12830 3046 aa6.67□□□□□ -1.34
TNS1-221ENST00000615025 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.67□□□□□ -1.34
TNS1-221ENST00000615025 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
TNS1-221ENST00000615025 Q8NDZ9 215 aa6.66□□□□□ -1.34
TNS1-221ENST00000615025 Q5VV11 94 aa6.66□□□□□ -1.34
TNS1-221ENST00000615025 R4GN34 69 aa6.65□□□□□ -1.34
TNS1-221ENST00000615025 KRTAP10-1P60331 282 aa6.64□□□□□ -1.35
TNS1-221ENST00000615025 KRTAP10-2P60368 255 aa6.63□□□□□ -1.35
TNS1-221ENST00000615025 SPRR1BP22528 89 aa6.62□□□□□ -1.35
TNS1-221ENST00000615025 UNC80Q8N2C7 3258 aa6.62□□□□□ -1.35
TNS1-221ENST00000615025 Q5W150 140 aa6.62□□□□□ -1.35
TNS1-221ENST00000615025 CHD9Q3L8U1 2897 aa6.6□□□□□ -1.35
TNS1-221ENST00000615025 OXTP01178 125 aa6.59□□□□□ -1.35
TNS1-221ENST00000615025 XIRP2A4UGR9 3374 aa6.59□□□□□ -1.35
TNS1-221ENST00000615025 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.58□□□□□ -1.36
TNS1-221ENST00000615025 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.57□□□□□ -1.36
TNS1-221ENST00000615025 ROMO1P60602 79 aa6.57□□□□□ -1.36
TNS1-221ENST00000615025 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
TNS1-221ENST00000615025 CFAP46Q8IYW2 2715 aa6.57□□□□□ -1.36
TNS1-221ENST00000615025 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.56□□□□□ -1.36
TNS1-221ENST00000615025 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.56□□□□□ -1.36
TNS1-221ENST00000615025 PLAC4Q8WY50 150 aa6.54□□□□□ -1.36
TNS1-221ENST00000615025 SZT2Q5T011 3432 aa6.52□□□□□ -1.37
TNS1-221ENST00000615025 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
TNS1-221ENST00000615025 M0QZ58 72 aa6.51□□□□□ -1.37
TNS1-221ENST00000615025 BAHCC1Q9P281 2608 aa6.51□□□□□ -1.37
TNS1-221ENST00000615025 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.49□□□□□ -1.37
TNS1-221ENST00000615025 Q6ZR54 194 aa6.49□□□□□ -1.37
TNS1-221ENST00000615025 STAB1Q9NY15 2570 aa6.48□□□□□ -1.37
TNS1-221ENST00000615025 PANO1I0J062 215 aa6.47□□□□□ -1.37
TNS1-221ENST00000615025 A0A0C4DFX4 3053 aa6.47□□□□□ -1.37
TNS1-221ENST00000615025 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.45□□□□□ -1.38
TNS1-221ENST00000615025 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
TNS1-221ENST00000615025 DNAH14Q0VDD8 3507 aa6.42□□□□□ -1.38
TNS1-221ENST00000615025 TRANK1O15050 2925 aa6.42□□□□□ -1.38
TNS1-221ENST00000615025 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.42□□□□□ -1.38
TNS1-221ENST00000615025 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.41□□□□□ -1.38
TNS1-221ENST00000615025 A0A087X002 238 aa6.4□□□□□ -1.38
TNS1-221ENST00000615025 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
TNS1-221ENST00000615025 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
TNS1-221ENST00000615025 TEX15Q9BXT5 2789 aa6.35□□□□□ -1.39
TNS1-221ENST00000615025 WDFY4Q6ZS81 3184 aa6.35□□□□□ -1.39
TNS1-221ENST00000615025 CENPEQ02224 2701 aa6.35□□□□□ -1.39
TNS1-221ENST00000615025 COL6A3P12111 3177 aa6.34□□□□□ -1.39
TNS1-221ENST00000615025 MGAQ8IWI9 3026 aa6.34□□□□□ -1.4
TNS1-221ENST00000615025 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa6.34□□□□□ -1.4
TNS1-221ENST00000615025 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
TNS1-221ENST00000615025 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
TNS1-221ENST00000615025 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.31□□□□□ -1.4
TNS1-221ENST00000615025 VCANP13611 3396 aa6.31□□□□□ -1.4
TNS1-221ENST00000615025 CFAP54Q96N23 3096 aa6.31□□□□□ -1.4
TNS1-221ENST00000615025 TRIOO75962 3097 aa6.3□□□□□ -1.4
TNS1-221ENST00000615025 EYSQ5T1H1 3165 aa6.3□□□□□ -1.4
TNS1-221ENST00000615025 ZNF292O60281 2723 aa6.3□□□□□ -1.4
TNS1-221ENST00000615025 CHD6Q8TD26 2715 aa6.29□□□□□ -1.4
TNS1-221ENST00000615025 NOTCH1P46531 2555 aa6.29□□□□□ -1.4
TNS1-221ENST00000615025 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.28□□□□□ -1.4
TNS1-221ENST00000615025 A6NN06 94 aa6.27□□□□□ -1.41
TNS1-221ENST00000615025 NDUFAF8A1L188 74 aa6.27□□□□□ -1.41
TNS1-221ENST00000615025 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
TNS1-221ENST00000615025 AKAP13Q12802 2813 aa6.26□□□□□ -1.41
TNS1-221ENST00000615025 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
TNS1-221ENST00000615025 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa6.26□□□□□ -1.41
TNS1-221ENST00000615025 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.25□□□□□ -1.41
TNS1-221ENST00000615025 COL6A5A8TX70 2615 aa6.25□□□□□ -1.41
TNS1-221ENST00000615025 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6.25□□□□□ -1.41
TNS1-221ENST00000615025 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa6.24□□□□□ -1.41
TNS1-221ENST00000615025 LAMA1P25391 3075 aa6.22□□□□□ -1.41
TNS1-221ENST00000615025 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
TNS1-221ENST00000615025 A8MUU9 505 aa6.22□□□□□ -1.41
TNS1-221ENST00000615025 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
TNS1-221ENST00000615025 UNC79Q9P2D8 2635 aa6.2□□□□□ -1.42
TNS1-221ENST00000615025 IGSF10Q6WRI0 2623 aa6.19□□□□□ -1.42
TNS1-221ENST00000615025 A8MU10 97 aa6.19□□□□□ -1.42
TNS1-221ENST00000615025 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.19□□□□□ -1.42
TNS1-221ENST00000615025 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.19□□□□□ -1.42
TNS1-221ENST00000615025 VPS13AQ96RL7 3174 aa6.19□□□□□ -1.42
TNS1-221ENST00000615025 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
TNS1-221ENST00000615025 USP34Q70CQ2 3546 aa6.15□□□□□ -1.42
TNS1-221ENST00000615025 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.14□□□□□ -1.43
TNS1-221ENST00000615025 DSPP15924 2871 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
TNS1-221ENST00000615025 SPEGQ15772 3267 aa6.13□□□□□ -1.43
TNS1-221ENST00000615025 MYO15AQ9UKN7 3530 aa6.1□□□□□ -1.43
TNS1-221ENST00000615025 ITPR2Q14571 2701 aa6.09□□□□□ -1.43
TNS1-221ENST00000615025 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa6.07□□□□□ -1.44
TNS1-221ENST00000615025 TNP1P09430 55 aa6.07□□□□□ -1.44
TNS1-221ENST00000615025 REV3LO60673 3130 aa6.06□□□□□ -1.44
TNS1-221ENST00000615025 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.04□□□□□ -1.44
TNS1-221ENST00000615025 FRYQ5TBA9 3013 aa6.03□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.6 ms