RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612839.1

CCL3L3-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 3 like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCL3L3, Length 1,458 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L3-201ENST00000612839 A0A1W2PPM0 123 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL3L3-201ENST00000612839 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.67□□□□□ -1.34
CCL3L3-201ENST00000612839 C6orf99Q4VX62 202 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CCL3L3-201ENST00000612839 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL3L3-201ENST00000612839 VAMP3Q15836 100 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL3L3-201ENST00000612839 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL3L3-201ENST00000612839 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.65□□□□□ -1.35
CCL3L3-201ENST00000612839 H7C2G1 150 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL3L3-201ENST00000612839 FABP2P12104 132 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL3L3-201ENST00000612839 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CCL3L3-201ENST00000612839 LINC00483Q53H64 154 aa6.64□□□□□ -1.35
CCL3L3-201ENST00000612839 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL3L3-201ENST00000612839 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.63□□□□□ -1.35
CCL3L3-201ENST00000612839 K7EP34 96 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL3L3-201ENST00000612839 COX7BP24311 80 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL3L3-201ENST00000612839 UBE2V1Q13404 147 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL3L3-201ENST00000612839 Q1RN00 199 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL3L3-201ENST00000612839 GAGE2AQ6NT46 116 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL3L3-201ENST00000612839 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.62□□□□□ -1.35
CCL3L3-201ENST00000612839 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL3L3-201ENST00000612839 TRIAP1O43715 76 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL3L3-201ENST00000612839 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL3L3-201ENST00000612839 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.61□□□□□ -1.35
CCL3L3-201ENST00000612839 PSMB2P49721 201 aa6.6□□□□□ -1.35
CCL3L3-201ENST00000612839 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.59□□□□□ -1.36
CCL3L3-201ENST00000612839 TCL1BO95988 128 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL3L3-201ENST00000612839 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL3L3-201ENST00000612839 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL3L3-201ENST00000612839 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.58□□□□□ -1.36
CCL3L3-201ENST00000612839 H3BMG7 143 aa6.56□□□□□ -1.36
CCL3L3-201ENST00000612839 SPRR1BP22528 89 aa6.56□□□□□ -1.36
CCL3L3-201ENST00000612839 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL3L3-201ENST00000612839 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.55□□□□□ -1.36
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CCL3L3-201ENST00000612839 CLEC2BQ92478 149 aa6.55□□□□□ -1.36
CCL3L3-201ENST00000612839 MOBPQ13875 183 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL3L3-201ENST00000612839 Q8NBF4 154 aa6.54□□□□□ -1.36
CCL3L3-201ENST00000612839 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL3L3-201ENST00000612839 LST1O00453 97 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL3L3-201ENST00000612839 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CCL3L3-201ENST00000612839 ATXN8Q156A1 80 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL3L3-201ENST00000612839 LINC00575Q6W349 94 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL3L3-201ENST00000612839 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL3L3-201ENST00000612839 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL3L3-201ENST00000612839 PRO0461Q9UI25 63 aa6.53□□□□□ -1.36
CCL3L3-201ENST00000612839 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL3L3-201ENST00000612839 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL3L3-201ENST00000612839 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL3L3-201ENST00000612839 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.52□□□□□ -1.37
CCL3L3-201ENST00000612839 SLC25A20O43772 301 aa6.51□□□□□ -1.37
CCL3L3-201ENST00000612839 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.51□□□□□ -1.37
CCL3L3-201ENST00000612839 MTURNQ8N3F0 131 aa6.51□□□□□ -1.37
CCL3L3-201ENST00000612839 H0YGX0 51 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL3L3-201ENST00000612839 SMIM29Q86T20 159 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL3L3-201ENST00000612839 LPAP08519 4548 aa6.5□□□□□ -1.37
CCL3L3-201ENST00000612839 LRP2P98164 4655 aa6.49□□□□□ -1.37
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CCL3L3-201ENST00000612839 Q8N377 158 aa6.49□□□□□ -1.37
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CCL3L3-201ENST00000612839 F8W1H4 67 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL3L3-201ENST00000612839 SPINK1P00995 79 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL3L3-201ENST00000612839 PRR4Q16378 134 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL3L3-201ENST00000612839 Q6ZQY7 126 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL3L3-201ENST00000612839 RETNLBQ9BQ08 111 aa6.48□□□□□ -1.37
CCL3L3-201ENST00000612839 C9JAW5 83 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL3L3-201ENST00000612839 TRACP01848 142 aa6.47□□□□□ -1.37
CCL3L3-201ENST00000612839 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.46□□□□□ -1.38
CCL3L3-201ENST00000612839 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CCL3L3-201ENST00000612839 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CCL3L3-201ENST00000612839 A0A1B0GX51 115 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL3L3-201ENST00000612839 ETDBQ3ZM63 59 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL3L3-201ENST00000612839 ANKRD29Q8N6D5 301 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL3L3-201ENST00000612839 H3BT86 120 aa6.42□□□□□ -1.38
CCL3L3-201ENST00000612839 A0A0G2JQZ4 141 aa6.41□□□□□ -1.38
CCL3L3-201ENST00000612839 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.41□□□□□ -1.38
CCL3L3-201ENST00000612839 DNAL4O96015 105 aa6.41□□□□□ -1.38
CCL3L3-201ENST00000612839 BAALC-AS2P0C853 105 aa6.41□□□□□ -1.38
CCL3L3-201ENST00000612839 PPDPFLQ8WWR9 84 aa6.41□□□□□ -1.38
CCL3L3-201ENST00000612839 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.4□□□□□ -1.39
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CCL3L3-201ENST00000612839 TEN1Q86WV5 123 aa6.4□□□□□ -1.39
CCL3L3-201ENST00000612839 F8WEM9 126 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL3L3-201ENST00000612839 CD164Q04900 197 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL3L3-201ENST00000612839 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL3L3-201ENST00000612839 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL3L3-201ENST00000612839 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
CCL3L3-201ENST00000612839 ORMDL1Q9P0S3 153 aa6.38□□□□□ -1.39
CCL3L3-201ENST00000612839 TPRXLQ17RH7 258 aa6.37□□□□□ -1.39
CCL3L3-201ENST00000612839 LIMD2Q9BT23 127 aa6.36□□□□□ -1.39
CCL3L3-201ENST00000612839 Q6JHZ5 121 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL3L3-201ENST00000612839 IGFL1Q6UW32 110 aa6.35□□□□□ -1.39
CCL3L3-201ENST00000612839 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.34□□□□□ -1.4
CCL3L3-201ENST00000612839 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.4
CCL3L3-201ENST00000612839 Q5XG85 94 aa6.34□□□□□ -1.4
CCL3L3-201ENST00000612839 RNF213Q63HN8 5207 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL3L3-201ENST00000612839 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.33□□□□□ -1.4
CCL3L3-201ENST00000612839 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL3L3-201ENST00000612839 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.32□□□□□ -1.4
CCL3L3-201ENST00000612839 K7ERU9 68 aa6.31□□□□□ -1.4
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