RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A1B0GV90 55 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A1W2PPM0 123 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF861PO60384 105 aa3.63□□□□□ -1.83
CAPNS1-208ENST00000589162 HERC2O95714 4834 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A1B0GV72 72 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-208ENST00000589162 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-208ENST00000589162 GAGE2AQ6NT46 116 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-208ENST00000589162 C3orf22Q8N5N4 141 aa3.62□□□□□ -1.83
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A0G2JQZ4 141 aa3.61□□□□□ -1.83
CAPNS1-208ENST00000589162 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa3.61□□□□□ -1.83
CAPNS1-208ENST00000589162 hADV29S1A0JD25 119 aa3.61□□□□□ -1.83
CAPNS1-208ENST00000589162 H0Y9J4 135 aa3.61□□□□□ -1.83
CAPNS1-208ENST00000589162 VAMP3Q15836 100 aa3.61□□□□□ -1.83
CAPNS1-208ENST00000589162 LCE1EQ5T753 118 aa3.61□□□□□ -1.83
CAPNS1-208ENST00000589162 Q6ZQY7 126 aa3.61□□□□□ -1.83
CAPNS1-208ENST00000589162 CBY1Q9Y3M2 126 aa3.61□□□□□ -1.83
CAPNS1-208ENST00000589162 SPCS1Q9Y6A9 102 aa3.61□□□□□ -1.83
CAPNS1-208ENST00000589162 HSPG2P98160 4391 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-208ENST00000589162 H0YGX0 51 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-208ENST00000589162 LST1O00453 97 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-208ENST00000589162 COX6CP09669 75 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-208ENST00000589162 FABP2P12104 132 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-208ENST00000589162 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-208ENST00000589162 SPRR4Q96PI1 79 aa3.6□□□□□ -1.83
CAPNS1-208ENST00000589162 C9JAW5 83 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-208ENST00000589162 H3BMG7 143 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-208ENST00000589162 K7EP34 96 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC25A20O43772 301 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-208ENST00000589162 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-208ENST00000589162 Q8N377 158 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-208ENST00000589162 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa3.59□□□□□ -1.83
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A087X002 238 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-208ENST00000589162 INAFM2P0DMQ5 153 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-208ENST00000589162 ATXN8Q156A1 80 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-208ENST00000589162 SPINK6Q6UWN8 80 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-208ENST00000589162 PRR26Q8N8Z3 221 aa3.58□□□□□ -1.84
CAPNS1-208ENST00000589162 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa3.57□□□□□ -1.84
CAPNS1-208ENST00000589162 DNAL4O96015 105 aa3.57□□□□□ -1.84
CAPNS1-208ENST00000589162 TRACP01848 142 aa3.57□□□□□ -1.84
CAPNS1-208ENST00000589162 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa3.57□□□□□ -1.84
CAPNS1-208ENST00000589162 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
CAPNS1-208ENST00000589162 SMIM29Q86T20 159 aa3.57□□□□□ -1.84
CAPNS1-208ENST00000589162 FAT1Q14517 4588 aa3.57□□□□□ -1.84
CAPNS1-208ENST00000589162 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-208ENST00000589162 BAALC-AS2P0C853 105 aa3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-208ENST00000589162 MOBPQ13875 183 aa3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-208ENST00000589162 LYRM7Q5U5X0 104 aa3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-208ENST00000589162 ORMDL1Q9P0S3 153 aa3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-208ENST00000589162 PRO0461Q9UI25 63 aa3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-208ENST00000589162 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-208ENST00000589162 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-208ENST00000589162 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-208ENST00000589162 SPRR1BP22528 89 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-208ENST00000589162 LINC00483Q53H64 154 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-208ENST00000589162 C9orf153Q5TBE3 101 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A1B0GX51 115 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-208ENST00000589162 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-208ENST00000589162 HRCT1Q6UXD1 115 aa3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
CAPNS1-208ENST00000589162 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa3.53□□□□□ -1.84
CAPNS1-208ENST00000589162 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa3.53□□□□□ -1.84
CAPNS1-208ENST00000589162 SNCGO76070 127 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-208ENST00000589162 MT1HL1P0DM35 61 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-208ENST00000589162 CRYGAP11844 174 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-208ENST00000589162 UBE2V1Q13404 147 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-208ENST00000589162 ANKRD29Q8N6D5 301 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-208ENST00000589162 Q8NBF4 154 aa3.52□□□□□ -1.85
CAPNS1-208ENST00000589162 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa3.51□□□□□ -1.85
CAPNS1-208ENST00000589162 H3BT86 120 aa3.51□□□□□ -1.85
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM229BQ4G0N7 80 aa3.51□□□□□ -1.85
CAPNS1-208ENST00000589162 OCIAD2Q56VL3 154 aa3.51□□□□□ -1.85
CAPNS1-208ENST00000589162 IGFL1Q6UW32 110 aa3.51□□□□□ -1.85
CAPNS1-208ENST00000589162 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
CAPNS1-208ENST00000589162 TYMSOSQ8TAI1 123 aa3.51□□□□□ -1.85
CAPNS1-208ENST00000589162 LINC01600Q96MT4 127 aa3.51□□□□□ -1.85
CAPNS1-208ENST00000589162 C14orf132Q9NPU4 83 aa3.51□□□□□ -1.85
CAPNS1-208ENST00000589162 ABCA13Q86UQ4 5058 aa3.51□□□□□ -1.85
CAPNS1-208ENST00000589162 F8WEM9 126 aa3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-208ENST00000589162 KRTAP10-8P60410 259 aa3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-208ENST00000589162 ETDBQ3ZM63 59 aa3.5□□□□□ -1.85
CAPNS1-208ENST00000589162 VPS25Q9BRG1 176 aa3.49□□□□□ -1.85
CAPNS1-208ENST00000589162 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
CAPNS1-208ENST00000589162 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa3.48□□□□□ -1.85
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A1W2PNM2 257 aa3.48□□□□□ -1.85
CAPNS1-208ENST00000589162 PPDPFLQ8WWR9 84 aa3.48□□□□□ -1.85
CAPNS1-208ENST00000589162 F8W1H4 67 aa3.47□□□□□ -1.85
CAPNS1-208ENST00000589162 RBM3P98179 157 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
CAPNS1-208ENST00000589162 LINC00304Q8N9R0 145 aa3.47□□□□□ -1.85
CAPNS1-208ENST00000589162 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa3.47□□□□□ -1.85
CAPNS1-208ENST00000589162 RETNLBQ9BQ08 111 aa3.47□□□□□ -1.85
CAPNS1-208ENST00000589162 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.85
CAPNS1-208ENST00000589162 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-208ENST00000589162 OXTP01178 125 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-208ENST00000589162 CCKP06307 115 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-208ENST00000589162 Q6ZQT0 140 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-208ENST00000589162 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-208ENST00000589162 TEN1Q86WV5 123 aa3.46□□□□□ -1.86
CAPNS1-208ENST00000589162 FAT3Q8TDW7 4589 aa3.45□□□□□ -1.86
CAPNS1-208ENST00000589162 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa3.45□□□□□ -1.86
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