RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568561.5

NME3-211, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NME3, Length 813 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-211ENST00000568561 HIST1H4GQ99525 98 aa8.35□□□□□ -1.07
NME3-211ENST00000568561 M0R143 59 aa8.34□□□□□ -1.07
NME3-211ENST00000568561 CBY1Q9Y3M2 126 aa8.34□□□□□ -1.07
NME3-211ENST00000568561 COX7BP24311 80 aa8.33□□□□□ -1.08
NME3-211ENST00000568561 MUSTN1Q8IVN3 82 aa8.33□□□□□ -1.08
NME3-211ENST00000568561 COPS9Q8WXC6 57 aa8.33□□□□□ -1.08
NME3-211ENST00000568561 A0A0G2JQZ4 141 aa8.32□□□□□ -1.08
NME3-211ENST00000568561 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
NME3-211ENST00000568561 C6orf99Q4VX62 202 aa8.32□□□□□ -1.08
NME3-211ENST00000568561 CEND1Q8N111 149 aa8.32□□□□□ -1.08
NME3-211ENST00000568561 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
NME3-211ENST00000568561 M0R2T5 61 aa8.3□□□□□ -1.08
NME3-211ENST00000568561 CD164Q04900 197 aa8.29□□□□□ -1.08
NME3-211ENST00000568561 C1orf195Q5TG92 126 aa8.29□□□□□ -1.08
NME3-211ENST00000568561 A4D1N5 150 aa8.28□□□□□ -1.08
NME3-211ENST00000568561 FXYD2P54710 66 aa8.28□□□□□ -1.08
NME3-211ENST00000568561 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa8.28□□□□□ -1.08
NME3-211ENST00000568561 SMIM29Q86T20 159 aa8.28□□□□□ -1.08
NME3-211ENST00000568561 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa8.27□□□□□ -1.09
NME3-211ENST00000568561 RPL37P61927 97 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
NME3-211ENST00000568561 COX6B2Q6YFQ2 88 aa8.26□□□□□ -1.09
NME3-211ENST00000568561 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa8.25□□□□□ -1.09
NME3-211ENST00000568561 A6NJY4 79 aa8.25□□□□□ -1.09
NME3-211ENST00000568561 A6NDN8 102 aa8.24□□□□□ -1.09
NME3-211ENST00000568561 BATFQ16520 125 aa8.24□□□□□ -1.09
NME3-211ENST00000568561 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa8.24□□□□□ -1.09
NME3-211ENST00000568561 Q5XG85 94 aa8.24□□□□□ -1.09
NME3-211ENST00000568561 SNHG12Q9BXW3 62 aa8.24□□□□□ -1.09
NME3-211ENST00000568561 A0A1B0GWB2 263 aa8.23□□□□□ -1.09
NME3-211ENST00000568561 CFC1P0CG37 223 aa8.23□□□□□ -1.09
NME3-211ENST00000568561 A0A0B4J2C4 111 aa8.22□□□□□ -1.09
NME3-211ENST00000568561 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa8.21□□□□□ -1.1
NME3-211ENST00000568561 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
NME3-211ENST00000568561 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa8.19□□□□□ -1.1
NME3-211ENST00000568561 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa8.19□□□□□ -1.1
NME3-211ENST00000568561 PRO1854Q9UHT4 67 aa8.18□□□□□ -1.1
NME3-211ENST00000568561 RAB37Q96AX2 223 aa8.17□□□□□ -1.1
NME3-211ENST00000568561 K7ERJ3 54 aa8.16□□□□□ -1.1
NME3-211ENST00000568561 TCL1BO95988 128 aa8.14□□□□□ -1.11
NME3-211ENST00000568561 Q6Q795 121 aa8.13□□□□□ -1.11
NME3-211ENST00000568561 USH2AO75445 5202 aa8.11□□□□□ -1.11
NME3-211ENST00000568561 SMIM11BQ8TCY0 68 aa8.11□□□□□ -1.11
NME3-211ENST00000568561 SSPOA2VEC9 5147 aa8.11□□□□□ -1.11
NME3-211ENST00000568561 TAX1BP3O14907 124 aa8.1□□□□□ -1.11
NME3-211ENST00000568561 F8WEM9 126 aa8.09□□□□□ -1.11
NME3-211ENST00000568561 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa8.08□□□□□ -1.12
NME3-211ENST00000568561 C9orf118A6NHY6 69 aa8.07□□□□□ -1.12
NME3-211ENST00000568561 LYRM7Q5U5X0 104 aa8.07□□□□□ -1.12
NME3-211ENST00000568561 TRIAP1O43715 76 aa8.06□□□□□ -1.12
NME3-211ENST00000568561 Q6ZQY7 126 aa8.05□□□□□ -1.12
NME3-211ENST00000568561 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa8.04□□□□□ -1.12
NME3-211ENST00000568561 IGFL1Q6UW32 110 aa8.04□□□□□ -1.12
NME3-211ENST00000568561 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa8.04□□□□□ -1.12
NME3-211ENST00000568561 CLEC2BQ92478 149 aa8.04□□□□□ -1.12
NME3-211ENST00000568561 A0A1B0GV90 55 aa8.03□□□□□ -1.12
NME3-211ENST00000568561 H3BUT2 72 aa8.03□□□□□ -1.12
NME3-211ENST00000568561 FABP2P12104 132 aa8.03□□□□□ -1.12
NME3-211ENST00000568561 PSMB2P49721 201 aa8.03□□□□□ -1.12
NME3-211ENST00000568561 LINC00575Q6W349 94 aa8.03□□□□□ -1.12
NME3-211ENST00000568561 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
NME3-211ENST00000568561 H0YGX0 51 aa8.02□□□□□ -1.13
NME3-211ENST00000568561 COX6CP09669 75 aa8.02□□□□□ -1.13
NME3-211ENST00000568561 VAMP3Q15836 100 aa8.02□□□□□ -1.13
NME3-211ENST00000568561 Q6JHZ5 121 aa8.02□□□□□ -1.13
NME3-211ENST00000568561 Q75L30 129 aa8.02□□□□□ -1.13
NME3-211ENST00000568561 A0A1W2PPM0 123 aa8□□□□□ -1.13
NME3-211ENST00000568561 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa8□□□□□ -1.13
NME3-211ENST00000568561 hADV29S1A0JD25 119 aa7.99□□□□□ -1.13
NME3-211ENST00000568561 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
NME3-211ENST00000568561 SCGB1C2P0DMR2 95 aa7.98□□□□□ -1.13
NME3-211ENST00000568561 OCIAD2Q56VL3 154 aa7.98□□□□□ -1.13
NME3-211ENST00000568561 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa7.97□□□□□ -1.13
NME3-211ENST00000568561 FAM218AQ96MZ4 157 aa7.97□□□□□ -1.13
NME3-211ENST00000568561 Q96NJ1 140 aa7.97□□□□□ -1.13
NME3-211ENST00000568561 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.96□□□□□ -1.14
NME3-211ENST00000568561 A0A1B0GX51 115 aa7.96□□□□□ -1.14
NME3-211ENST00000568561 SPCS1Q9Y6A9 102 aa7.96□□□□□ -1.14
NME3-211ENST00000568561 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa7.95□□□□□ -1.14
NME3-211ENST00000568561 K7EP34 96 aa7.94□□□□□ -1.14
NME3-211ENST00000568561 LST1O00453 97 aa7.94□□□□□ -1.14
NME3-211ENST00000568561 TRACP01848 142 aa7.93□□□□□ -1.14
NME3-211ENST00000568561 UBE2V1Q13404 147 aa7.93□□□□□ -1.14
NME3-211ENST00000568561 ATXN8Q156A1 80 aa7.92□□□□□ -1.14
NME3-211ENST00000568561 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
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NME3-211ENST00000568561 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
NME3-211ENST00000568561 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa7.89□□□□□ -1.15
NME3-211ENST00000568561 A8MUU9 505 aa7.88□□□□□ -1.15
NME3-211ENST00000568561 DNAL4O96015 105 aa7.87□□□□□ -1.15
NME3-211ENST00000568561 PPDPFLQ8WWR9 84 aa7.87□□□□□ -1.15
NME3-211ENST00000568561 H3BMG7 143 aa7.86□□□□□ -1.15
NME3-211ENST00000568561 MT2AP02795 61 aa7.85□□□□□ -1.15
NME3-211ENST00000568561 SS18L2Q9UHA2 77 aa7.85□□□□□ -1.15
NME3-211ENST00000568561 F8W1H4 67 aa7.84□□□□□ -1.15
NME3-211ENST00000568561 DSCR10P59022 87 aa7.84□□□□□ -1.15
NME3-211ENST00000568561 ORMDL1Q9P0S3 153 aa7.84□□□□□ -1.15
NME3-211ENST00000568561 A0A087WSZ3 146 aa7.83□□□□□ -1.16
NME3-211ENST00000568561 C9JAW5 83 aa7.83□□□□□ -1.16
NME3-211ENST00000568561 H3BQ85 93 aa7.83□□□□□ -1.16
NME3-211ENST00000568561 GHRHP01286 108 aa7.82□□□□□ -1.16
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