RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		0.6	□□□□□ -2.31
AKAP13-223	ENST00000560957	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		0.6	□□□□□ -2.31
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.31
AKAP13-223	ENST00000560957	PTPRQ	Q9UMZ3	2332 aa		0.59	□□□□□ -2.31
AKAP13-223	ENST00000560957	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.31
AKAP13-223	ENST00000560957	RPS27L	Q71UM5	84 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.31
AKAP13-223	ENST00000560957	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		0.59	□□□□□ -2.31
AKAP13-223	ENST00000560957	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.32
AKAP13-223	ENST00000560957	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.32
AKAP13-223	ENST00000560957	SPTBN2	O15020	2390 aa		0.59	□□□□□ -2.32
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF469	Q96JG9	3925 aa	Predicted RBP	0.58	□□□□□ -2.32
AKAP13-223	ENST00000560957	SPINK1	P00995	79 aa		0.58	□□□□□ -2.32
AKAP13-223	ENST00000560957	USF3	Q68DE3	2245 aa		0.58	□□□□□ -2.32
AKAP13-223	ENST00000560957	WT1-AS	Q06250	92 aa		0.57	□□□□□ -2.32
AKAP13-223	ENST00000560957	VWF	P04275	2813 aa		0.57	□□□□□ -2.32
AKAP13-223	ENST00000560957	ATP7A	Q04656	1500 aa		0.57	□□□□□ -2.32
AKAP13-223	ENST00000560957	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		0.56	□□□□□ -2.32
AKAP13-223	ENST00000560957	AKAP13	Q12802	2813 aa		0.56	□□□□□ -2.32
AKAP13-223	ENST00000560957	IQGAP1	P46940	1657 aa		0.56	□□□□□ -2.32
AKAP13-223	ENST00000560957	DSP	P15924	2871 aa	Known RBP	0.55	□□□□□ -2.32
AKAP13-223	ENST00000560957	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		0.55	□□□□□ -2.32
AKAP13-223	ENST00000560957	FBN2	P35556	2912 aa		0.55	□□□□□ -2.32
AKAP13-223	ENST00000560957	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		0.55	□□□□□ -2.32
AKAP13-223	ENST00000560957		U3KQA8	63 aa		0.55	□□□□□ -2.32
AKAP13-223	ENST00000560957	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	0.55	□□□□□ -2.32
AKAP13-223	ENST00000560957	KIF21B	O75037	1637 aa		0.54	□□□□□ -2.32
AKAP13-223	ENST00000560957		H3BUA1	57 aa		0.54	□□□□□ -2.32
AKAP13-223	ENST00000560957	CHD6	Q8TD26	2715 aa		0.53	□□□□□ -2.32
AKAP13-223	ENST00000560957	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		0.53	□□□□□ -2.33
AKAP13-223	ENST00000560957	PLCE1	Q9P212	2302 aa		0.53	□□□□□ -2.33
AKAP13-223	ENST00000560957	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		0.53	□□□□□ -2.33
AKAP13-223	ENST00000560957	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		0.53	□□□□□ -2.33
AKAP13-223	ENST00000560957	NOTCH1	P46531	2555 aa		0.52	□□□□□ -2.33
AKAP13-223	ENST00000560957	PRLH	P81277	87 aa		0.52	□□□□□ -2.33
AKAP13-223	ENST00000560957		S4R3F8	94 aa		0.52	□□□□□ -2.33
AKAP13-223	ENST00000560957	ATR	Q13535	2644 aa		0.52	□□□□□ -2.33
AKAP13-223	ENST00000560957	SPTBN1	Q01082	2364 aa	Known RBP	0.52	□□□□□ -2.33
AKAP13-223	ENST00000560957	TNXB	P22105	4242 aa		0.51	□□□□□ -2.33
AKAP13-223	ENST00000560957		M0R2T5	61 aa		0.51	□□□□□ -2.33
AKAP13-223	ENST00000560957	TRPM2	O94759	1503 aa		0.5	□□□□□ -2.33
AKAP13-223	ENST00000560957	NFAT5	O94916	1531 aa		0.5	□□□□□ -2.33
AKAP13-223	ENST00000560957	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	0.5	□□□□□ -2.33
AKAP13-223	ENST00000560957	DEFB135	Q30KP9	77 aa		0.5	□□□□□ -2.33
AKAP13-223	ENST00000560957	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
AKAP13-223	ENST00000560957	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		0.49	□□□□□ -2.33
AKAP13-223	ENST00000560957	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		0.49	□□□□□ -2.33
AKAP13-223	ENST00000560957	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
AKAP13-223	ENST00000560957	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
AKAP13-223	ENST00000560957	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		0.48	□□□□□ -2.33
AKAP13-223	ENST00000560957	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		0.48	□□□□□ -2.33
AKAP13-223	ENST00000560957	F8	P00451	2351 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AKAP13-223	ENST00000560957		H0YGG7	62 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AKAP13-223	ENST00000560957	DEFB106A	Q8N104	65 aa		0.47	□□□□□ -2.33
AKAP13-223	ENST00000560957	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	0.47	□□□□□ -2.33
AKAP13-223	ENST00000560957	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A0C4DFX4	3053 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AKAP13-223	ENST00000560957	MUC5AC	P98088	5654 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AKAP13-223	ENST00000560957	PRM1	P04553	51 aa		0.46	□□□□□ -2.34
AKAP13-223	ENST00000560957	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AKAP13-223	ENST00000560957	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AKAP13-223	ENST00000560957	NDUFA1	O15239	70 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AKAP13-223	ENST00000560957	TFF3	Q07654	80 aa		0.45	□□□□□ -2.34
AKAP13-223	ENST00000560957	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
AKAP13-223	ENST00000560957	AKAP6	Q13023	2319 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AKAP13-223	ENST00000560957	IGLV5-48	A0A075B6I7	105 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AKAP13-223	ENST00000560957	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		0.44	□□□□□ -2.34
AKAP13-223	ENST00000560957	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		0.43	□□□□□ -2.34
AKAP13-223	ENST00000560957	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		0.43	□□□□□ -2.34
AKAP13-223	ENST00000560957	SPRR2D	P22532	72 aa		0.43	□□□□□ -2.34
AKAP13-223	ENST00000560957	DEFB131A	P59861	70 aa		0.43	□□□□□ -2.34
AKAP13-223	ENST00000560957	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
AKAP13-223	ENST00000560957	MDN1	Q9NU22	5596 aa		0.43	□□□□□ -2.34
AKAP13-223	ENST00000560957	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		0.42	□□□□□ -2.34
AKAP13-223	ENST00000560957	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	0.42	□□□□□ -2.34
AKAP13-223	ENST00000560957	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	0.42	□□□□□ -2.34
AKAP13-223	ENST00000560957	C9orf92	A6NGG3	77 aa		0.42	□□□□□ -2.34
AKAP13-223	ENST00000560957	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		0.42	□□□□□ -2.34
AKAP13-223	ENST00000560957	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		0.42	□□□□□ -2.34
AKAP13-223	ENST00000560957	CLTCL1	P53675	1640 aa		0.42	□□□□□ -2.34
AKAP13-223	ENST00000560957	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
AKAP13-223	ENST00000560957	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		0.41	□□□□□ -2.34
AKAP13-223	ENST00000560957	PTPN13	Q12923	2485 aa		0.4	□□□□□ -2.35
AKAP13-223	ENST00000560957	MMP24-AS1	A0A0U1RRL7	71 aa		0.4	□□□□□ -2.35
AKAP13-223	ENST00000560957	CACNA1A	O00555	2505 aa		0.4	□□□□□ -2.35
AKAP13-223	ENST00000560957	PDZD2	O15018	2839 aa		0.4	□□□□□ -2.35
AKAP13-223	ENST00000560957	KNL1	Q8NG31	2342 aa		0.39	□□□□□ -2.35
AKAP13-223	ENST00000560957	SPTA1	P02549	2419 aa		0.39	□□□□□ -2.35
AKAP13-223	ENST00000560957	SPRR2B	P35325	72 aa		0.39	□□□□□ -2.35
AKAP13-223	ENST00000560957	BSN	Q9UPA5	3926 aa		0.39	□□□□□ -2.35
AKAP13-223	ENST00000560957	IGF2R	P11717	2491 aa		0.39	□□□□□ -2.35
AKAP13-223	ENST00000560957	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		0.38	□□□□□ -2.35
AKAP13-223	ENST00000560957		A8MTW9	85 aa		0.38	□□□□□ -2.35
AKAP13-223	ENST00000560957	KMT2A	Q03164	3969 aa		0.38	□□□□□ -2.35
AKAP13-223	ENST00000560957	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
AKAP13-223	ENST00000560957	NF1	P21359	2839 aa		0.37	□□□□□ -2.35
AKAP13-223	ENST00000560957	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	0.37	□□□□□ -2.35
AKAP13-223	ENST00000560957	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	0.37	□□□□□ -2.35
AKAP13-223	ENST00000560957	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		0.37	□□□□□ -2.35
AKAP13-223	ENST00000560957	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	0.37	□□□□□ -2.35
AKAP13-223	ENST00000560957	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		0.37	□□□□□ -2.35

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