RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498666.5

ITGB2-212, Transcript of integrin subunit beta 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ITGB2, Length 4,781 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2-212ENST00000498666 ANAPC11Q9NYG5 84 aa8.53□□□□□ -1.04
ITGB2-212ENST00000498666 SPEGQ15772 3267 aa8.53□□□□□ -1.04
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ITGB2-212ENST00000498666 Q5XG85 94 aa8.52□□□□□ -1.05
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ITGB2-212ENST00000498666 COX6B2Q6YFQ2 88 aa8.52□□□□□ -1.05
ITGB2-212ENST00000498666 Q1T7F1 81 aa8.52□□□□□ -1.05
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ITGB2-212ENST00000498666 SPINT4Q6UDR6 99 aa8.42□□□□□ -1.06
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ITGB2-212ENST00000498666 PLAC8Q9NZF1 115 aa8.42□□□□□ -1.06
ITGB2-212ENST00000498666 C9orf92A6NGG3 77 aa8.41□□□□□ -1.06
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ITGB2-212ENST00000498666 DMXL1Q9Y485 3027 aa8.12□□□□□ -1.11
ITGB2-212ENST00000498666 A0A0D9SG42 100 aa8.11□□□□□ -1.11
ITGB2-212ENST00000498666 LINC01554Q52M75 96 aa8.11□□□□□ -1.11
ITGB2-212ENST00000498666 LUZP6Q538Z0 58 aa8.11□□□□□ -1.11
ITGB2-212ENST00000498666 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
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ITGB2-212ENST00000498666 Q6ZR54 194 aa8.08□□□□□ -1.12
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ITGB2-212ENST00000498666 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa8.04□□□□□ -1.12
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ITGB2-212ENST00000498666 STAB2Q8WWQ8 2551 aa8.02□□□□□ -1.13
ITGB2-212ENST00000498666 APCP25054 2843 aa8□□□□□ -1.13
ITGB2-212ENST00000498666 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP7.99□□□□□ -1.13
ITGB2-212ENST00000498666 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa7.99□□□□□ -1.13
ITGB2-212ENST00000498666 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
ITGB2-212ENST00000498666 MUC3AQ02505 3323 aa7.99□□□□□ -1.13
ITGB2-212ENST00000498666 CELSR2Q9HCU4 2923 aa7.99□□□□□ -1.13
ITGB2-212ENST00000498666 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa7.98□□□□□ -1.13
ITGB2-212ENST00000498666 PRAC1Q96KF2 57 aa7.98□□□□□ -1.13
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