RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FYCO1Q9BQS8 1478 aa-1.42□□□□□ -2.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP-1.42□□□□□ -2.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NRXN1Q9ULB1 1477 aa-1.43□□□□□ -2.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LRBAP50851 2863 aa-1.43□□□□□ -2.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IFI6P09912 130 aa-1.43□□□□□ -2.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAUP35544 74 aaKnown RBP-1.43□□□□□ -2.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 WFDC9Q8NEX5 89 aa-1.43□□□□□ -2.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C2orf88Q9BSF0 95 aa-1.43□□□□□ -2.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DNAH8Q96JB1 4490 aa-1.43□□□□□ -2.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FANCAO15360 1455 aa-1.43□□□□□ -2.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP-1.44□□□□□ -2.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PEA15Q15121 130 aa-1.44□□□□□ -2.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ABCC10Q5T3U5 1492 aa-1.44□□□□□ -2.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BPTFQ12830 3046 aa-1.45□□□□□ -2.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LYNX1G3V0Z9 82 aa-1.45□□□□□ -2.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CLPSL2Q6UWE3 100 aa-1.45□□□□□ -2.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DPY30Q9C005 99 aa-1.45□□□□□ -2.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP-1.45□□□□□ -2.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa-1.45□□□□□ -2.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ATP7BP35670 1465 aa-1.45□□□□□ -2.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PLIN4Q96Q06 1357 aa-1.46□□□□□ -2.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CHD7Q9P2D1 2997 aa-1.46□□□□□ -2.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MYH4Q9Y623 1939 aa-1.46□□□□□ -2.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 USP32Q8NFA0 1604 aa-1.46□□□□□ -2.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TEX14Q8IWB6 1497 aa-1.46□□□□□ -2.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 WIZO95785 1651 aa-1.46□□□□□ -2.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DEFB106AQ8N104 65 aa-1.47□□□□□ -2.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP-1.47□□□□□ -2.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa-1.47□□□□□ -2.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP-1.47□□□□□ -2.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NWD1Q149M9 1564 aa-1.47□□□□□ -2.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ATP10BO94823 1461 aa-1.48□□□□□ -2.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MT-ATP8P03928 68 aa-1.48□□□□□ -2.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 S100A10P60903 97 aa-1.48□□□□□ -2.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NESP48681 1621 aa-1.48□□□□□ -2.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CFAP46Q8IYW2 2715 aa-1.49□□□□□ -2.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRAV21A0A0B4J279 112 aa-1.49□□□□□ -2.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IAPPP10997 89 aa-1.49□□□□□ -2.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MT1XP80297 61 aa-1.49□□□□□ -2.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa-1.49□□□□□ -2.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 COL12A1Q99715 3063 aa-1.5□□□□□ -2.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LCE6AA0A183 80 aa-1.5□□□□□ -2.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GYPAP02724 150 aa-1.5□□□□□ -2.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP-1.5□□□□□ -2.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP-1.5□□□□□ -2.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP-1.5□□□□□ -2.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP-1.51□□□□□ -2.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa-1.51□□□□□ -2.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DEFB130BP0DP73 79 aa-1.51□□□□□ -2.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DEFB130AP0DP74 79 aa-1.51□□□□□ -2.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TCEAL7Q9BRU2 100 aa-1.51□□□□□ -2.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CSMD1Q96PZ7 3565 aa-1.51□□□□□ -2.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP-1.51□□□□□ -2.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP-1.52□□□□□ -2.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa-1.52□□□□□ -2.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TNP1P09430 55 aa-1.52□□□□□ -2.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MT1HL1P0DM35 61 aa-1.52□□□□□ -2.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 COL6A5A8TX70 2615 aa-1.53□□□□□ -2.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP-1.53□□□□□ -2.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP-1.53□□□□□ -2.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SCN11AQ9UI33 1791 aa-1.53□□□□□ -2.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP-1.53□□□□□ -2.65
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP-1.54□□□□□ -2.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LTN1O94822 1766 aa-1.54□□□□□ -2.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCDC88BA6NC98 1476 aa-1.54□□□□□ -2.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ACYP1P07311 99 aa-1.54□□□□□ -2.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ACBD7Q8N6N7 88 aa-1.54□□□□□ -2.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RGPD1P0DJD0 1748 aa-1.54□□□□□ -2.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa-1.55□□□□□ -2.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 S100PP25815 95 aa-1.55□□□□□ -2.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP-1.55□□□□□ -2.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP-1.55□□□□□ -2.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCNB3Q8WWL7 1395 aa-1.56□□□□□ -2.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NCMAPQ5T1S8 102 aa-1.56□□□□□ -2.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa-1.56□□□□□ -2.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP-1.56□□□□□ -2.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CEBPZOSA8MTT3 80 aa-1.57□□□□□ -2.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LINC00587B1AMM8 73 aa-1.57□□□□□ -2.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UMAD1C9J7I0 102 aa-1.57□□□□□ -2.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RBP2P50120 134 aa-1.57□□□□□ -2.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MT1EP04732 61 aa-1.58□□□□□ -2.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RABAC1Q9UI14 185 aa-1.58□□□□□ -2.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MYO3AQ8NEV4 1616 aa-1.58□□□□□ -2.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa-1.59□□□□□ -2.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP-1.59□□□□□ -2.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa-1.59□□□□□ -2.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ABCA13Q86UQ4 5058 aa-1.59□□□□□ -2.66
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa-1.6□□□□□ -2.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa-1.6□□□□□ -2.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CNTLNQ9NXG0 1405 aa-1.6□□□□□ -2.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ITPR2Q14571 2701 aa-1.61□□□□□ -2.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NDUFA4O00483 81 aa-1.61□□□□□ -2.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP-1.61□□□□□ -2.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LINC00643Q86TS7 51 aa-1.61□□□□□ -2.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP-1.61□□□□□ -2.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP-1.62□□□□□ -2.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DOT1LQ8TEK3 1739 aa-1.62□□□□□ -2.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa-1.62□□□□□ -2.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa-1.62□□□□□ -2.67
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 H3BUA1 57 aa-1.62□□□□□ -2.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.1 ms