RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484412.1

HDLBP-240, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 669 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-240ENST00000484412 SNCGO76070 127 aa7.96□□□□□ -1.14
HDLBP-240ENST00000484412 Q5XG85 94 aa7.96□□□□□ -1.14
HDLBP-240ENST00000484412 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
HDLBP-240ENST00000484412 PRO1933Q9H354 126 aa7.96□□□□□ -1.14
HDLBP-240ENST00000484412 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.95□□□□□ -1.14
HDLBP-240ENST00000484412 DEFB105AQ8NG35 78 aa7.95□□□□□ -1.14
HDLBP-240ENST00000484412 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa7.94□□□□□ -1.14
HDLBP-240ENST00000484412 GHRHP01286 108 aa7.94□□□□□ -1.14
HDLBP-240ENST00000484412 Q6ZQY7 126 aa7.94□□□□□ -1.14
HDLBP-240ENST00000484412 PRR4Q16378 134 aa7.93□□□□□ -1.14
HDLBP-240ENST00000484412 C9orf153Q5TBE3 101 aa7.93□□□□□ -1.14
HDLBP-240ENST00000484412 LRP2P98164 4655 aa7.92□□□□□ -1.14
HDLBP-240ENST00000484412 TPRXLQ17RH7 258 aa7.92□□□□□ -1.14
HDLBP-240ENST00000484412 H7C2G1 150 aa7.9□□□□□ -1.14
HDLBP-240ENST00000484412 Q1RN00 199 aa7.9□□□□□ -1.14
HDLBP-240ENST00000484412 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.89□□□□□ -1.15
HDLBP-240ENST00000484412 H3BQ85 93 aa7.89□□□□□ -1.15
HDLBP-240ENST00000484412 COX6CP09669 75 aa7.89□□□□□ -1.15
HDLBP-240ENST00000484412 Q6JHZ5 121 aa7.89□□□□□ -1.15
HDLBP-240ENST00000484412 TRIAP1O43715 76 aa7.88□□□□□ -1.15
HDLBP-240ENST00000484412 FAM218AQ96MZ4 157 aa7.88□□□□□ -1.15
HDLBP-240ENST00000484412 LIMD2Q9BT23 127 aa7.87□□□□□ -1.15
HDLBP-240ENST00000484412 LPAP08519 4548 aa7.87□□□□□ -1.15
HDLBP-240ENST00000484412 RETNLBQ9BQ08 111 aa7.86□□□□□ -1.15
HDLBP-240ENST00000484412 SNHG12Q9BXW3 62 aa7.86□□□□□ -1.15
HDLBP-240ENST00000484412 F8WEM9 126 aa7.85□□□□□ -1.15
HDLBP-240ENST00000484412 M0R143 59 aa7.85□□□□□ -1.15
HDLBP-240ENST00000484412 UBR4Q5T4S7 5183 aa7.83□□□□□ -1.16
HDLBP-240ENST00000484412 TSTD3H0UI37 97 aa7.83□□□□□ -1.16
HDLBP-240ENST00000484412 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa7.83□□□□□ -1.16
HDLBP-240ENST00000484412 Q6Q795 121 aa7.82□□□□□ -1.16
HDLBP-240ENST00000484412 K7ERJ3 54 aa7.81□□□□□ -1.16
HDLBP-240ENST00000484412 TRACP01848 142 aa7.81□□□□□ -1.16
HDLBP-240ENST00000484412 PSMB2P49721 201 aa7.81□□□□□ -1.16
HDLBP-240ENST00000484412 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
HDLBP-240ENST00000484412 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa7.81□□□□□ -1.16
HDLBP-240ENST00000484412 CLEC2BQ92478 149 aa7.81□□□□□ -1.16
HDLBP-240ENST00000484412 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa7.8□□□□□ -1.16
HDLBP-240ENST00000484412 IGFL1Q6UW32 110 aa7.8□□□□□ -1.16
HDLBP-240ENST00000484412 LST1O00453 97 aa7.77□□□□□ -1.17
HDLBP-240ENST00000484412 TCL1BO95988 128 aa7.77□□□□□ -1.17
HDLBP-240ENST00000484412 UBE2V1Q13404 147 aa7.77□□□□□ -1.17
HDLBP-240ENST00000484412 HRCT1Q6UXD1 115 aa7.77□□□□□ -1.17
HDLBP-240ENST00000484412 ORMDL1Q9P0S3 153 aa7.77□□□□□ -1.17
HDLBP-240ENST00000484412 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa7.76□□□□□ -1.17
HDLBP-240ENST00000484412 DNAL4O96015 105 aa7.76□□□□□ -1.17
HDLBP-240ENST00000484412 SCGB1C2P0DMR2 95 aa7.76□□□□□ -1.17
HDLBP-240ENST00000484412 C1orf195Q5TG92 126 aa7.76□□□□□ -1.17
HDLBP-240ENST00000484412 CDIP1Q9H305 208 aa7.76□□□□□ -1.17
HDLBP-240ENST00000484412 A0A0G2JQZ4 141 aa7.75□□□□□ -1.17
HDLBP-240ENST00000484412 TEN1Q86WV5 123 aa7.75□□□□□ -1.17
HDLBP-240ENST00000484412 H3BMG7 143 aa7.74□□□□□ -1.17
HDLBP-240ENST00000484412 FABP2P12104 132 aa7.73□□□□□ -1.17
HDLBP-240ENST00000484412 XP32Q5T750 250 aa7.7□□□□□ -1.18
HDLBP-240ENST00000484412 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.69□□□□□ -1.18
HDLBP-240ENST00000484412 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa7.69□□□□□ -1.18
HDLBP-240ENST00000484412 H3BUT2 72 aa7.69□□□□□ -1.18
HDLBP-240ENST00000484412 MUC17Q685J3 4493 aa7.68□□□□□ -1.18
HDLBP-240ENST00000484412 BAALC-AS2P0C853 105 aa7.67□□□□□ -1.18
HDLBP-240ENST00000484412 ATXN8Q156A1 80 aa7.67□□□□□ -1.18
HDLBP-240ENST00000484412 ANKRD29Q8N6D5 301 aa7.67□□□□□ -1.18
HDLBP-240ENST00000484412 SS18L2Q9UHA2 77 aa7.67□□□□□ -1.18
HDLBP-240ENST00000484412 A0A1W2PNM2 257 aa7.66□□□□□ -1.18
HDLBP-240ENST00000484412 LYRM7Q5U5X0 104 aa7.66□□□□□ -1.18
HDLBP-240ENST00000484412 C9orf118A6NHY6 69 aa7.65□□□□□ -1.18
HDLBP-240ENST00000484412 RBM3P98179 157 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
HDLBP-240ENST00000484412 A0A1B0GW54 56 aa7.63□□□□□ -1.19
HDLBP-240ENST00000484412 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
HDLBP-240ENST00000484412 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa7.63□□□□□ -1.19
HDLBP-240ENST00000484412 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa7.62□□□□□ -1.19
HDLBP-240ENST00000484412 TAX1BP3O14907 124 aa7.62□□□□□ -1.19
HDLBP-240ENST00000484412 RNF213Q63HN8 5207 aa7.6□□□□□ -1.19
HDLBP-240ENST00000484412 A0A087WSZ3 146 aa7.6□□□□□ -1.19
HDLBP-240ENST00000484412 PDE6GP18545 87 aa7.59□□□□□ -1.19
HDLBP-240ENST00000484412 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa7.59□□□□□ -1.19
HDLBP-240ENST00000484412 Q96NJ1 140 aa7.59□□□□□ -1.19
HDLBP-240ENST00000484412 DSCR8Q96T75 97 aa7.59□□□□□ -1.19
HDLBP-240ENST00000484412 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
HDLBP-240ENST00000484412 BATFQ16520 125 aa7.58□□□□□ -1.2
HDLBP-240ENST00000484412 A0A1W2PPM0 123 aa7.57□□□□□ -1.2
HDLBP-240ENST00000484412 CCKP06307 115 aa7.57□□□□□ -1.2
HDLBP-240ENST00000484412 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa7.56□□□□□ -1.2
HDLBP-240ENST00000484412 C9JAW5 83 aa7.56□□□□□ -1.2
HDLBP-240ENST00000484412 LINC00472Q9H8W2 130 aa7.56□□□□□ -1.2
HDLBP-240ENST00000484412 C9orf92A6NGG3 77 aa7.54□□□□□ -1.2
HDLBP-240ENST00000484412 MUC2Q02817 5179 aa7.54□□□□□ -1.2
HDLBP-240ENST00000484412 H3BT86 120 aa7.53□□□□□ -1.2
HDLBP-240ENST00000484412 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa7.53□□□□□ -1.2
HDLBP-240ENST00000484412 A0A0U1RQV1 116 aa7.52□□□□□ -1.21
HDLBP-240ENST00000484412 RPL37P61927 97 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
HDLBP-240ENST00000484412 Q6ZQT0 140 aa7.51□□□□□ -1.21
HDLBP-240ENST00000484412 Q75L30 129 aa7.48□□□□□ -1.21
HDLBP-240ENST00000484412 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa7.48□□□□□ -1.21
HDLBP-240ENST00000484412 J3KT08 172 aa7.46□□□□□ -1.22
HDLBP-240ENST00000484412 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa7.46□□□□□ -1.22
HDLBP-240ENST00000484412 SPCS1Q9Y6A9 102 aa7.46□□□□□ -1.22
HDLBP-240ENST00000484412 A0A1B0GV72 72 aa7.45□□□□□ -1.22
HDLBP-240ENST00000484412 IGKV4-1P06312 121 aa7.45□□□□□ -1.22
HDLBP-240ENST00000484412 PCOTHQ58A44 107 aa7.45□□□□□ -1.22
HDLBP-240ENST00000484412 A8MUU9 505 aa7.44□□□□□ -1.22
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