RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468576.1

PTPRG-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRG, Length 854 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-202ENST00000468576 HERC1Q15751 4861 aa0.18□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP0.18□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 ZFHX4Q86UP3 3567 aa0.18□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 MTORP42345 2549 aa0.18□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa0.18□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 FREM2Q5SZK8 3169 aa0.18□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 PDZD2O15018 2839 aa0.18□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa0.18□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 C7orf77A4D0Y5 90 aa0.18□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 LOC730098B7Z3J9 87 aa0.18□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 IFI6P09912 130 aa0.18□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa0.18□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 SPRR2GQ9BYE4 73 aa0.18□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 TTTY10Q9BZA0 68 aa0.18□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 DPY30Q9C005 99 aa0.18□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 ITPR1Q14643 2758 aa0.18□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 CFAP46Q8IYW2 2715 aa0.18□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 DMDP11532 3685 aa0.18□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP0.18□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 VWFP04275 2813 aa0.18□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP0.18□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP0.18□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP0.17□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 TRANK1O15050 2925 aa0.17□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP0.17□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 ABCA13Q86UQ4 5058 aa0.17□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 NBASA2RRP1 2371 aa0.17□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP0.17□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 RNF213Q63HN8 5207 aa0.17□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa0.17□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 A0A0G2JND7 137 aa0.17□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 LCE6AA0A183 80 aa0.17□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa0.17□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 LAMA5O15230 3695 aa0.17□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa0.17□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 ALKAL2Q6UX46 152 aa0.17□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 ZNF720Q7Z2F6 126 aa0.17□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 CFAP54Q96N23 3096 aa0.17□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 TRGV9Q99603 122 aa0.17□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 TEX15Q9BXT5 2789 aa0.17□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 BPTFQ12830 3046 aa0.17□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 FLNCQ14315 2725 aa0.17□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 ACANP16112 2415 aa0.17□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 URB1O60287 2271 aaKnown RBP0.17□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa0.17□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP0.17□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 USF3Q68DE3 2245 aa0.17□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 DNAH12Q6ZR08 3092 aa0.17□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 ANKRD36A6QL64 1941 aa0.17□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa0.17□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 CSMD2Q7Z408 3487 aa0.17□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 APC2O95996 2303 aa0.16□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 HIVEP1P15822 2718 aa0.16□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 ITPR2Q14571 2701 aa0.16□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 STAB2Q8WWQ8 2551 aa0.16□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 CHD7Q9P2D1 2997 aa0.16□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 ZANQ9Y493 2812 aa0.16□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 A0A0C4DFX4 3053 aa0.16□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa0.16□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 TENM4Q6N022 2769 aa0.16□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa0.16□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa0.16□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 A0A1B0GU69 56 aa0.16□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 IQCF6A8MYZ5 107 aa0.16□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 K7EQZ3 153 aa0.16□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 SPRR2DP22532 72 aa0.16□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 HMGN3Q15651 99 aa0.16□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 TDRG1Q3Y452 100 aa0.16□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 DEFB124Q8NES8 71 aa0.16□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 C14orf144Q96I85 54 aa0.16□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 CRIPTQ9P021 101 aa0.16□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa0.16□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 SONP18583 2426 aaKnown RBP0.16□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa0.16□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 COL12A1Q99715 3063 aa0.16□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 FRYLO94915 3013 aa0.16□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 MGAQ8IWI9 3026 aa0.16□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 CUBNO60494 3623 aa0.15□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 DNAJC13O75165 2243 aa0.15□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 ZFHX3Q15911 3703 aa0.15□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 TRIOO75962 3097 aa0.15□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 ATMQ13315 3056 aa0.15□□□□□ -2.38
PTPRG-202ENST00000468576 VPS13CQ709C8 3753 aa0.15□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 FRYQ5TBA9 3013 aa0.15□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 DMXL1Q9Y485 3027 aa0.15□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 RYR3Q15413 4870 aa0.15□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 WNK2Q9Y3S1 2297 aa0.15□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 LINC01549A6NIU2 74 aa0.15□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 H3BUA1 57 aa0.15□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 M0R1W7 72 aa0.15□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 SPRR1BP22528 89 aa0.15□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 SPRR2EP22531 72 aa0.15□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 CD52P31358 61 aa0.15□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 SPRR2BP35325 72 aa0.15□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 SPRR2AP35326 72 aa0.15□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 SMIM11AP58511 58 aa0.15□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 PKIAP61925 76 aa0.15□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 DEFA5Q01523 94 aa0.15□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 KLK9Q2XQG4 91 aa0.15□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 SERP2Q8N6R1 65 aa0.15□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms