RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439875.1

FAM225B-202, Transcript of family with sequence similarity 225 member B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAM225B, Length 7,380 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM225B-202ENST00000439875 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
FAM225B-202ENST00000439875 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
FAM225B-202ENST00000439875 MAST4O15021 2626 aa6.44□□□□□ -1.38
FAM225B-202ENST00000439875 A8MUN3 132 aa6.44□□□□□ -1.38
FAM225B-202ENST00000439875 MGAQ8IWI9 3026 aa6.44□□□□□ -1.38
FAM225B-202ENST00000439875 CDH23Q9H251 3354 aa6.43□□□□□ -1.38
FAM225B-202ENST00000439875 CSAG1Q6PB30 78 aa6.42□□□□□ -1.38
FAM225B-202ENST00000439875 CFAP54Q96N23 3096 aa6.41□□□□□ -1.38
FAM225B-202ENST00000439875 REV3LO60673 3130 aa6.4□□□□□ -1.39
FAM225B-202ENST00000439875 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
FAM225B-202ENST00000439875 Q6ZR54 194 aa6.38□□□□□ -1.39
FAM225B-202ENST00000439875 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
FAM225B-202ENST00000439875 SZT2Q5T011 3432 aa6.36□□□□□ -1.39
FAM225B-202ENST00000439875 SPRR1AP35321 89 aa6.35□□□□□ -1.39
FAM225B-202ENST00000439875 TEX15Q9BXT5 2789 aa6.35□□□□□ -1.39
FAM225B-202ENST00000439875 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.35□□□□□ -1.39
FAM225B-202ENST00000439875 AKAP13Q12802 2813 aa6.34□□□□□ -1.39
FAM225B-202ENST00000439875 SPINK7P58062 85 aa6.33□□□□□ -1.4
FAM225B-202ENST00000439875 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.32□□□□□ -1.4
FAM225B-202ENST00000439875 KLKP1Q107X0 134 aa6.32□□□□□ -1.4
FAM225B-202ENST00000439875 UNC80Q8N2C7 3258 aa6.32□□□□□ -1.4
FAM225B-202ENST00000439875 TRIOO75962 3097 aa6.31□□□□□ -1.4
FAM225B-202ENST00000439875 ZNF292O60281 2723 aa6.31□□□□□ -1.4
FAM225B-202ENST00000439875 WDFY4Q6ZS81 3184 aa6.3□□□□□ -1.4
FAM225B-202ENST00000439875 Q8NDZ9 215 aa6.29□□□□□ -1.4
FAM225B-202ENST00000439875 SPRR1BP22528 89 aa6.29□□□□□ -1.4
FAM225B-202ENST00000439875 R4GN34 69 aa6.29□□□□□ -1.4
FAM225B-202ENST00000439875 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
FAM225B-202ENST00000439875 Q1T7F1 81 aa6.28□□□□□ -1.4
FAM225B-202ENST00000439875 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.27□□□□□ -1.41
FAM225B-202ENST00000439875 A0A1B0GU33 70 aa6.27□□□□□ -1.41
FAM225B-202ENST00000439875 PANO1I0J062 215 aa6.26□□□□□ -1.41
FAM225B-202ENST00000439875 A0A0C4DFX4 3053 aa6.26□□□□□ -1.41
FAM225B-202ENST00000439875 Q5W150 140 aa6.25□□□□□ -1.41
FAM225B-202ENST00000439875 ITPR2Q14571 2701 aa6.25□□□□□ -1.41
FAM225B-202ENST00000439875 LCA10Q71F78 164 aa6.23□□□□□ -1.41
FAM225B-202ENST00000439875 H7BZZ5 65 aa6.23□□□□□ -1.41
FAM225B-202ENST00000439875 PLAC4Q8WY50 150 aa6.23□□□□□ -1.41
FAM225B-202ENST00000439875 CENPEQ02224 2701 aa6.23□□□□□ -1.41
FAM225B-202ENST00000439875 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
FAM225B-202ENST00000439875 OCR1Q9BZK8 76 aa6.22□□□□□ -1.41
FAM225B-202ENST00000439875 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.22□□□□□ -1.41
FAM225B-202ENST00000439875 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6.22□□□□□ -1.41
FAM225B-202ENST00000439875 A0A087X002 238 aa6.21□□□□□ -1.41
FAM225B-202ENST00000439875 COL6A3P12111 3177 aa6.21□□□□□ -1.42
FAM225B-202ENST00000439875 IGSF10Q6WRI0 2623 aa6.2□□□□□ -1.42
FAM225B-202ENST00000439875 DMAC1Q96GE9 116 aa6.2□□□□□ -1.42
FAM225B-202ENST00000439875 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
FAM225B-202ENST00000439875 CHD6Q8TD26 2715 aa6.19□□□□□ -1.42
FAM225B-202ENST00000439875 VPS13AQ96RL7 3174 aa6.19□□□□□ -1.42
FAM225B-202ENST00000439875 USP34Q70CQ2 3546 aa6.18□□□□□ -1.42
FAM225B-202ENST00000439875 DSPP15924 2871 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
FAM225B-202ENST00000439875 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
FAM225B-202ENST00000439875 M0QZ58 72 aa6.15□□□□□ -1.42
FAM225B-202ENST00000439875 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.43
FAM225B-202ENST00000439875 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.43
FAM225B-202ENST00000439875 STAB1Q9NY15 2570 aa6.14□□□□□ -1.43
FAM225B-202ENST00000439875 FREM2Q5SZK8 3169 aa6.13□□□□□ -1.43
FAM225B-202ENST00000439875 COL6A5A8TX70 2615 aa6.13□□□□□ -1.43
FAM225B-202ENST00000439875 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.12□□□□□ -1.43
FAM225B-202ENST00000439875 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
FAM225B-202ENST00000439875 UNC79Q9P2D8 2635 aa6.11□□□□□ -1.43
FAM225B-202ENST00000439875 LAMA1P25391 3075 aa6.1□□□□□ -1.43
FAM225B-202ENST00000439875 A0A0A0MQY5 61 aa6.09□□□□□ -1.43
FAM225B-202ENST00000439875 VCANP13611 3396 aa6.07□□□□□ -1.44
FAM225B-202ENST00000439875 SPEGQ15772 3267 aa6.07□□□□□ -1.44
FAM225B-202ENST00000439875 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
FAM225B-202ENST00000439875 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.07□□□□□ -1.44
FAM225B-202ENST00000439875 FRYQ5TBA9 3013 aa6.07□□□□□ -1.44
FAM225B-202ENST00000439875 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa6.05□□□□□ -1.44
FAM225B-202ENST00000439875 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
FAM225B-202ENST00000439875 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
FAM225B-202ENST00000439875 Q75L30 129 aa6.04□□□□□ -1.44
FAM225B-202ENST00000439875 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.04□□□□□ -1.44
FAM225B-202ENST00000439875 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa6.03□□□□□ -1.44
FAM225B-202ENST00000439875 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.01□□□□□ -1.45
FAM225B-202ENST00000439875 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.01□□□□□ -1.45
FAM225B-202ENST00000439875 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa6□□□□□ -1.45
FAM225B-202ENST00000439875 FRYLO94915 3013 aa6□□□□□ -1.45
FAM225B-202ENST00000439875 MYO15AQ9UKN7 3530 aa6□□□□□ -1.45
FAM225B-202ENST00000439875 RPL37P61927 97 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
FAM225B-202ENST00000439875 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
FAM225B-202ENST00000439875 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.98□□□□□ -1.45
FAM225B-202ENST00000439875 LRBAP50851 2863 aa5.98□□□□□ -1.45
FAM225B-202ENST00000439875 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa5.98□□□□□ -1.45
FAM225B-202ENST00000439875 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa5.95□□□□□ -1.46
FAM225B-202ENST00000439875 ROMO1P60602 79 aa5.95□□□□□ -1.46
FAM225B-202ENST00000439875 A8MUU9 505 aa5.94□□□□□ -1.46
FAM225B-202ENST00000439875 ASPMQ8IZT6 3477 aa5.93□□□□□ -1.46
FAM225B-202ENST00000439875 EYSQ5T1H1 3165 aa5.93□□□□□ -1.46
FAM225B-202ENST00000439875 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa5.93□□□□□ -1.46
FAM225B-202ENST00000439875 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa5.92□□□□□ -1.46
FAM225B-202ENST00000439875 NOTCH1P46531 2555 aa5.91□□□□□ -1.46
FAM225B-202ENST00000439875 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa5.9□□□□□ -1.46
FAM225B-202ENST00000439875 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa5.9□□□□□ -1.46
FAM225B-202ENST00000439875 Q5XG85 94 aa5.89□□□□□ -1.47
FAM225B-202ENST00000439875 KALRNO60229 2985 aa5.89□□□□□ -1.47
FAM225B-202ENST00000439875 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
FAM225B-202ENST00000439875 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa5.89□□□□□ -1.47
FAM225B-202ENST00000439875 DCHS1Q96JQ0 3298 aa5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.2 ms