RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415548.1

CCT3-208, Transcript of chaperonin containing TCP1 subunit 3, human

TSL 3

Gene CCT3, Length 513 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCT3-208	ENST00000415548	IGLV5-48	A0A075B6I7	105 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CCT3-208	ENST00000415548	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CCT3-208	ENST00000415548	SPATA45	Q537H7	98 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CCT3-208	ENST00000415548	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CCT3-208	ENST00000415548	SLC25A20	O43772	301 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CCT3-208	ENST00000415548	VAMP3	Q15836	100 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CCT3-208	ENST00000415548	SMIM29	Q86T20	159 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CCT3-208	ENST00000415548	VAMP8	Q9BV40	100 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CCT3-208	ENST00000415548	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CCT3-208	ENST00000415548	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
CCT3-208	ENST00000415548	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CCT3-208	ENST00000415548	LINC00575	Q6W349	94 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CCT3-208	ENST00000415548	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CCT3-208	ENST00000415548	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCT3-208	ENST00000415548	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCT3-208	ENST00000415548	PRO1933	Q9H354	126 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCT3-208	ENST00000415548	HIGD1B	Q9P298	99 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CCT3-208	ENST00000415548		A0A0G2JQZ4	141 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CCT3-208	ENST00000415548		H7C2G1	150 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CCT3-208	ENST00000415548	LIMD2	Q9BT23	127 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CCT3-208	ENST00000415548	hADV29S1	A0JD25	119 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CCT3-208	ENST00000415548	CFC1B	P0CG36	223 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CCT3-208	ENST00000415548	CFC1	P0CG37	223 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CCT3-208	ENST00000415548	CD164	Q04900	197 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CCT3-208	ENST00000415548		Q6ZQY7	126 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CCT3-208	ENST00000415548	RAB37	Q96AX2	223 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CCT3-208	ENST00000415548	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CCT3-208	ENST00000415548	PYY3	Q5JQD4	70 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CCT3-208	ENST00000415548		A0A0B4J2C4	111 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCT3-208	ENST00000415548	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCT3-208	ENST00000415548	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCT3-208	ENST00000415548	CEND1	Q8N111	149 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CCT3-208	ENST00000415548		F8WEM9	126 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CCT3-208	ENST00000415548	UNQ6493/PRO21345	Q6UXR8	122 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CCT3-208	ENST00000415548	FXYD2	P54710	66 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CCT3-208	ENST00000415548		A0A0U1RQV1	116 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCT3-208	ENST00000415548	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCT3-208	ENST00000415548		Q5XG85	94 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCT3-208	ENST00000415548	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCT3-208	ENST00000415548	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CCT3-208	ENST00000415548	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCT3-208	ENST00000415548	C9orf92	A6NGG3	77 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCT3-208	ENST00000415548		H0YGX0	51 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCT3-208	ENST00000415548	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCT3-208	ENST00000415548	C1orf195	Q5TG92	126 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCT3-208	ENST00000415548	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCT3-208	ENST00000415548	HSD52	Q0P140	79 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCT3-208	ENST00000415548		Q6JHZ5	121 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCT3-208	ENST00000415548	IGFL1	Q6UW32	110 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCT3-208	ENST00000415548	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCT3-208	ENST00000415548	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCT3-208	ENST00000415548	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCT3-208	ENST00000415548		H3BUT2	72 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCT3-208	ENST00000415548		K7ERJ3	54 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCT3-208	ENST00000415548	SNCG	O76070	127 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCT3-208	ENST00000415548	TCL1B	O95988	128 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCT3-208	ENST00000415548	CLEC2B	Q92478	149 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCT3-208	ENST00000415548	KRTAP4-1	Q9BYQ7	146 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CCT3-208	ENST00000415548	TRBV7-7	A0A0K0K1E9	115 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCT3-208	ENST00000415548	TRIAP1	O43715	76 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCT3-208	ENST00000415548	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CCT3-208	ENST00000415548		A0A1B0GX51	115 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CCT3-208	ENST00000415548	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CCT3-208	ENST00000415548	PSMB2	P49721	201 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CCT3-208	ENST00000415548	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCT3-208	ENST00000415548		H3BS24	57 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCT3-208	ENST00000415548	FABP2	P12104	132 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCT3-208	ENST00000415548	PCOTH	Q58A44	107 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CCT3-208	ENST00000415548		H3BMG7	143 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CCT3-208	ENST00000415548	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CCT3-208	ENST00000415548	COX6C	P09669	75 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CCT3-208	ENST00000415548		Q6Q795	121 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CCT3-208	ENST00000415548	LST1	O00453	97 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CCT3-208	ENST00000415548	DNAL4	O96015	105 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CCT3-208	ENST00000415548	TEN1	Q86WV5	123 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CCT3-208	ENST00000415548	ORMDL1	Q9P0S3	153 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CCT3-208	ENST00000415548		A0A1B0GV72	72 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CCT3-208	ENST00000415548	RPL37	P61927	97 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
CCT3-208	ENST00000415548	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CCT3-208	ENST00000415548		A0A087WSZ3	146 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CCT3-208	ENST00000415548		A0A1W2PNM2	257 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CCT3-208	ENST00000415548	SCGB1C2	P0DMR2	95 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CCT3-208	ENST00000415548		H3BQ85	93 aa		4.48	□□□□□ -1.69
CCT3-208	ENST00000415548	SMIM6	P0DI80	62 aa		4.48	□□□□□ -1.69
CCT3-208	ENST00000415548	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		4.48	□□□□□ -1.69
CCT3-208	ENST00000415548	ANKRD29	Q8N6D5	301 aa		4.48	□□□□□ -1.69
CCT3-208	ENST00000415548	OBSCN-AS1	Q96MR7	158 aa		4.48	□□□□□ -1.69
CCT3-208	ENST00000415548	TMEM256-PLSCR3	K7ERE1	68 aa		4.47	□□□□□ -1.69
CCT3-208	ENST00000415548	TRAC	P01848	142 aa		4.47	□□□□□ -1.69
CCT3-208	ENST00000415548		M0R143	59 aa		4.46	□□□□□ -1.7
CCT3-208	ENST00000415548		Q96NJ1	140 aa		4.46	□□□□□ -1.7
CCT3-208	ENST00000415548	TRBV7-4	A0A0J9YYF1	115 aa		4.45	□□□□□ -1.7
CCT3-208	ENST00000415548	UBE2V1	Q13404	147 aa		4.45	□□□□□ -1.7
CCT3-208	ENST00000415548	KRTAP19-2	Q3LHN2	52 aa		4.45	□□□□□ -1.7
CCT3-208	ENST00000415548	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	4.45	□□□□□ -1.7
CCT3-208	ENST00000415548	CCK	P06307	115 aa		4.43	□□□□□ -1.7
CCT3-208	ENST00000415548	BAALC-AS2	P0C853	105 aa		4.43	□□□□□ -1.7
CCT3-208	ENST00000415548		Q75L30	129 aa		4.43	□□□□□ -1.7
CCT3-208	ENST00000415548	SIGMAR1	Q99720	223 aa		4.43	□□□□□ -1.7
CCT3-208	ENST00000415548	VPS25	Q9BRG1	176 aa		4.42	□□□□□ -1.7

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