RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

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Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPINK1P00995 79 aa8.85□□□□□ -0.99
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C9orf153Q5TBE3 101 aa8.85□□□□□ -0.99
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DEFB105AQ8NG35 78 aa8.85□□□□□ -0.99
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RPS29P62273 56 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRO1933Q9H354 126 aa8.84□□□□□ -0.99
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PPDPFLQ8WWR9 84 aa8.83□□□□□ -1
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A1B0GX51 115 aa8.82□□□□□ -1
PGGT1BP2-201ENST00000398621 Q6ZQY7 126 aa8.82□□□□□ -1
PGGT1BP2-201ENST00000398621 Q8N377 158 aa8.82□□□□□ -1
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TSTD3H0UI37 97 aa8.81□□□□□ -1
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SMIM29Q86T20 159 aa8.81□□□□□ -1
PGGT1BP2-201ENST00000398621 M0R143 59 aa8.8□□□□□ -1
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OCIAD2Q56VL3 154 aa8.8□□□□□ -1
PGGT1BP2-201ENST00000398621 K7ERJ3 54 aa8.79□□□□□ -1
PGGT1BP2-201ENST00000398621 COX6CP09669 75 aa8.78□□□□□ -1
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRR4Q16378 134 aa8.78□□□□□ -1
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PSMB2P49721 201 aa8.77□□□□□ -1.01
PGGT1BP2-201ENST00000398621 F8WEM9 126 aa8.76□□□□□ -1.01
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CD164Q04900 197 aa8.76□□□□□ -1.01
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRTAP23-1A1A580 65 aa8.75□□□□□ -1.01
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM218AQ96MZ4 157 aa8.75□□□□□ -1.01
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PCP4P48539 62 aa8.74□□□□□ -1.01
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa8.72□□□□□ -1.01
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LIMD2Q9BT23 127 aa8.72□□□□□ -1.01
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SNHG12Q9BXW3 62 aa8.72□□□□□ -1.01
PGGT1BP2-201ENST00000398621 H3BQ85 93 aa8.71□□□□□ -1.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 Q6JHZ5 121 aa8.71□□□□□ -1.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LRP2P98164 4655 aa8.7□□□□□ -1.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DNAL4O96015 105 aa8.7□□□□□ -1.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RETNLBQ9BQ08 111 aa8.7□□□□□ -1.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CLEC2BQ92478 149 aa8.69□□□□□ -1.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UBR4Q5T4S7 5183 aa8.69□□□□□ -1.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa8.68□□□□□ -1.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 Q5XG85 94 aa8.68□□□□□ -1.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SCGB1C2P0DMR2 95 aa8.67□□□□□ -1.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRACP01848 142 aa8.66□□□□□ -1.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TPRXLQ17RH7 258 aa8.66□□□□□ -1.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HRCT1Q6UXD1 115 aa8.65□□□□□ -1.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ORMDL1Q9P0S3 153 aa8.65□□□□□ -1.02
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LST1O00453 97 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FABP2P12104 132 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGFL1Q6UW32 110 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LYRM7Q5U5X0 104 aa8.61□□□□□ -1.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A0G2JQZ4 141 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 H3BMG7 143 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TCL1BO95988 128 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BATFQ16520 125 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LPAP08519 4548 aa8.6□□□□□ -1.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 H3BUT2 72 aa8.59□□□□□ -1.03
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa8.58□□□□□ -1.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UBE2V1Q13404 147 aa8.58□□□□□ -1.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ATXN8Q156A1 80 aa8.58□□□□□ -1.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 Q6Q795 121 aa8.58□□□□□ -1.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa8.56□□□□□ -1.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa8.55□□□□□ -1.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa8.55□□□□□ -1.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TEN1Q86WV5 123 aa8.55□□□□□ -1.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C1orf195Q5TG92 126 aa8.53□□□□□ -1.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SS18L2Q9UHA2 77 aa8.52□□□□□ -1.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ANKRD29Q8N6D5 301 aa8.51□□□□□ -1.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TAX1BP3O14907 124 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BAALC-AS2P0C853 105 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa8.48□□□□□ -1.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A1W2PPM0 123 aa8.47□□□□□ -1.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RBM3P98179 157 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A1W2PNM2 257 aa8.46□□□□□ -1.06
PGGT1BP2-201ENST00000398621 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa8.46□□□□□ -1.06
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DSCR8Q96T75 97 aa8.46□□□□□ -1.06
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A087WSZ3 146 aa8.45□□□□□ -1.06
PGGT1BP2-201ENST00000398621 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa8.45□□□□□ -1.06
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RNF213Q63HN8 5207 aa8.44□□□□□ -1.06
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A1B0GV72 72 aa8.43□□□□□ -1.06
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCKP06307 115 aa8.43□□□□□ -1.06
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C9JAW5 83 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1BP2-201ENST00000398621 XP32Q5T750 250 aa8.42□□□□□ -1.06
PGGT1BP2-201ENST00000398621 H3BT86 120 aa8.4□□□□□ -1.06
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PDE6GP18545 87 aa8.39□□□□□ -1.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa8.37□□□□□ -1.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A1B0GW54 56 aa8.37□□□□□ -1.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C9orf92A6NGG3 77 aa8.37□□□□□ -1.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPCS1Q9Y6A9 102 aa8.37□□□□□ -1.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PCP4L1A6NKN8 68 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MUC17Q685J3 4493 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 VPS25Q9BRG1 176 aa8.35□□□□□ -1.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 Q6ZQT0 140 aa8.34□□□□□ -1.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 Q96NJ1 140 aa8.34□□□□□ -1.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa8.32□□□□□ -1.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LINC00472Q9H8W2 130 aa8.31□□□□□ -1.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A0A0MQY5 61 aa8.3□□□□□ -1.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa8.3□□□□□ -1.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C14orf132Q9NPU4 83 aa8.3□□□□□ -1.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MUC2Q02817 5179 aa8.3□□□□□ -1.08
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