RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377962.7

CNMD-201, Transcript of chondromodulin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNMD, Length 1,410 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNMD-201ENST00000377962 TAX1BP3O14907 124 aa7.44□□□□□ -1.22
CNMD-201ENST00000377962 GAGE2AQ6NT46 116 aa7.44□□□□□ -1.22
CNMD-201ENST00000377962 CLEC2BQ92478 149 aa7.44□□□□□ -1.22
CNMD-201ENST00000377962 C9orf118A6NHY6 69 aa7.42□□□□□ -1.22
CNMD-201ENST00000377962 H3BUT2 72 aa7.42□□□□□ -1.22
CNMD-201ENST00000377962 SNCGO76070 127 aa7.42□□□□□ -1.22
CNMD-201ENST00000377962 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa7.42□□□□□ -1.22
CNMD-201ENST00000377962 DEFB105AQ8NG35 78 aa7.42□□□□□ -1.22
CNMD-201ENST00000377962 TNXBP22105 4242 aa7.41□□□□□ -1.22
CNMD-201ENST00000377962 A0A1B0GX51 115 aa7.4□□□□□ -1.22
CNMD-201ENST00000377962 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa7.4□□□□□ -1.22
CNMD-201ENST00000377962 LINC00483Q53H64 154 aa7.4□□□□□ -1.22
CNMD-201ENST00000377962 Q6ZQY7 126 aa7.4□□□□□ -1.22
CNMD-201ENST00000377962 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CNMD-201ENST00000377962 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa7.38□□□□□ -1.23
CNMD-201ENST00000377962 CRYGAP11844 174 aa7.38□□□□□ -1.23
CNMD-201ENST00000377962 SPRR1BP22528 89 aa7.38□□□□□ -1.23
CNMD-201ENST00000377962 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CNMD-201ENST00000377962 FAM229BQ4G0N7 80 aa7.38□□□□□ -1.23
CNMD-201ENST00000377962 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa7.37□□□□□ -1.23
CNMD-201ENST00000377962 Q8N377 158 aa7.37□□□□□ -1.23
CNMD-201ENST00000377962 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa7.36□□□□□ -1.23
CNMD-201ENST00000377962 LST1O00453 97 aa7.36□□□□□ -1.23
CNMD-201ENST00000377962 TCL1BO95988 128 aa7.36□□□□□ -1.23
CNMD-201ENST00000377962 A0A1W2PPM0 123 aa7.35□□□□□ -1.23
CNMD-201ENST00000377962 DNAL4O96015 105 aa7.35□□□□□ -1.23
CNMD-201ENST00000377962 LYRM7Q5U5X0 104 aa7.35□□□□□ -1.23
CNMD-201ENST00000377962 C3orf22Q8N5N4 141 aa7.35□□□□□ -1.23
CNMD-201ENST00000377962 TYMSOSQ8TAI1 123 aa7.35□□□□□ -1.23
CNMD-201ENST00000377962 TRACP01848 142 aa7.35□□□□□ -1.23
CNMD-201ENST00000377962 ATXN8Q156A1 80 aa7.35□□□□□ -1.23
CNMD-201ENST00000377962 FABP2P12104 132 aa7.34□□□□□ -1.23
CNMD-201ENST00000377962 OCIAD2Q56VL3 154 aa7.34□□□□□ -1.23
CNMD-201ENST00000377962 SMIM29Q86T20 159 aa7.34□□□□□ -1.23
CNMD-201ENST00000377962 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa7.34□□□□□ -1.23
CNMD-201ENST00000377962 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.33□□□□□ -1.24
CNMD-201ENST00000377962 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa7.33□□□□□ -1.24
CNMD-201ENST00000377962 HMCN2Q8NDA2 5059 aa7.32□□□□□ -1.24
CNMD-201ENST00000377962 PPDPFLQ8WWR9 84 aa7.32□□□□□ -1.24
CNMD-201ENST00000377962 ORMDL1Q9P0S3 153 aa7.31□□□□□ -1.24
CNMD-201ENST00000377962 MOBPQ13875 183 aa7.3□□□□□ -1.24
CNMD-201ENST00000377962 C9orf153Q5TBE3 101 aa7.29□□□□□ -1.24
CNMD-201ENST00000377962 H3BQ85 93 aa7.28□□□□□ -1.24
CNMD-201ENST00000377962 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa7.28□□□□□ -1.24
CNMD-201ENST00000377962 BAALC-AS2P0C853 105 aa7.28□□□□□ -1.24
CNMD-201ENST00000377962 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa7.28□□□□□ -1.24
CNMD-201ENST00000377962 SPCS1Q9Y6A9 102 aa7.28□□□□□ -1.24
CNMD-201ENST00000377962 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.24
CNMD-201ENST00000377962 C9JAW5 83 aa7.27□□□□□ -1.25
CNMD-201ENST00000377962 F8WEM9 126 aa7.27□□□□□ -1.25
CNMD-201ENST00000377962 H3BMG7 143 aa7.27□□□□□ -1.25
CNMD-201ENST00000377962 LINC00304Q8N9R0 145 aa7.27□□□□□ -1.25
CNMD-201ENST00000377962 Q8NBF4 154 aa7.27□□□□□ -1.25
CNMD-201ENST00000377962 UBE2V1Q13404 147 aa7.25□□□□□ -1.25
CNMD-201ENST00000377962 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.23□□□□□ -1.25
CNMD-201ENST00000377962 A0A0G2JQZ4 141 aa7.23□□□□□ -1.25
CNMD-201ENST00000377962 K7EP34 96 aa7.23□□□□□ -1.25
CNMD-201ENST00000377962 MTURNQ8N3F0 131 aa7.22□□□□□ -1.25
CNMD-201ENST00000377962 RETNLBQ9BQ08 111 aa7.22□□□□□ -1.25
CNMD-201ENST00000377962 A0A1B0GV72 72 aa7.21□□□□□ -1.25
CNMD-201ENST00000377962 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa7.21□□□□□ -1.25
CNMD-201ENST00000377962 ANKRD29Q8N6D5 301 aa7.21□□□□□ -1.25
CNMD-201ENST00000377962 PRR4Q16378 134 aa7.2□□□□□ -1.26
CNMD-201ENST00000377962 Q6JHZ5 121 aa7.2□□□□□ -1.26
CNMD-201ENST00000377962 SPAG11AQ6PDA7 123 aa7.19□□□□□ -1.26
CNMD-201ENST00000377962 IGFL1Q6UW32 110 aa7.19□□□□□ -1.26
CNMD-201ENST00000377962 HRCT1Q6UXD1 115 aa7.19□□□□□ -1.26
CNMD-201ENST00000377962 H3BT86 120 aa7.18□□□□□ -1.26
CNMD-201ENST00000377962 SPINK1P00995 79 aa7.18□□□□□ -1.26
CNMD-201ENST00000377962 LCE1DQ5T752 114 aa7.18□□□□□ -1.26
CNMD-201ENST00000377962 RBM3P98179 157 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CNMD-201ENST00000377962 A0A1B0GV90 55 aa7.16□□□□□ -1.26
CNMD-201ENST00000377962 CD164Q04900 197 aa7.16□□□□□ -1.26
CNMD-201ENST00000377962 PRO0461Q9UI25 63 aa7.16□□□□□ -1.26
CNMD-201ENST00000377962 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa7.15□□□□□ -1.27
CNMD-201ENST00000377962 DSCR8Q96T75 97 aa7.14□□□□□ -1.27
CNMD-201ENST00000377962 LRP2P98164 4655 aa7.13□□□□□ -1.27
CNMD-201ENST00000377962 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa7.12□□□□□ -1.27
CNMD-201ENST00000377962 F8W1H4 67 aa7.12□□□□□ -1.27
CNMD-201ENST00000377962 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa7.12□□□□□ -1.27
CNMD-201ENST00000377962 LPAP08519 4548 aa7.11□□□□□ -1.27
CNMD-201ENST00000377962 A0A1W2PNM2 257 aa7.11□□□□□ -1.27
CNMD-201ENST00000377962 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CNMD-201ENST00000377962 TEN1Q86WV5 123 aa7.11□□□□□ -1.27
CNMD-201ENST00000377962 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa7.1□□□□□ -1.27
CNMD-201ENST00000377962 Q6Q795 121 aa7.1□□□□□ -1.27
CNMD-201ENST00000377962 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.1□□□□□ -1.27
CNMD-201ENST00000377962 C14orf132Q9NPU4 83 aa7.1□□□□□ -1.27
CNMD-201ENST00000377962 CCKP06307 115 aa7.1□□□□□ -1.27
CNMD-201ENST00000377962 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.08□□□□□ -1.28
CNMD-201ENST00000377962 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa7.08□□□□□ -1.28
CNMD-201ENST00000377962 Q6ZQT0 140 aa7.08□□□□□ -1.28
CNMD-201ENST00000377962 VPS25Q9BRG1 176 aa7.08□□□□□ -1.28
CNMD-201ENST00000377962 LIMD2Q9BT23 127 aa7.08□□□□□ -1.28
CNMD-201ENST00000377962 PDE6GP18545 87 aa7.07□□□□□ -1.28
CNMD-201ENST00000377962 Q5XG85 94 aa7.07□□□□□ -1.28
CNMD-201ENST00000377962 RNF213Q63HN8 5207 aa7.07□□□□□ -1.28
CNMD-201ENST00000377962 A0A087WSZ3 146 aa7.06□□□□□ -1.28
CNMD-201ENST00000377962 ETDBQ3ZM63 59 aa7.05□□□□□ -1.28
CNMD-201ENST00000377962 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa7.01□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms