RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284273.5

UBASH3B-201, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBASH3B, Length 6,912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-201ENST00000284273 LCA10Q71F78 164 aa7.21□□□□□ -1.25
UBASH3B-201ENST00000284273 CDH23Q9H251 3354 aa7.2□□□□□ -1.26
UBASH3B-201ENST00000284273 M0QZ58 72 aa7.2□□□□□ -1.26
UBASH3B-201ENST00000284273 PLAC4Q8WY50 150 aa7.2□□□□□ -1.26
UBASH3B-201ENST00000284273 MAST4O15021 2626 aa7.2□□□□□ -1.26
UBASH3B-201ENST00000284273 CFAP46Q8IYW2 2715 aa7.2□□□□□ -1.26
UBASH3B-201ENST00000284273 TRIOO75962 3097 aa7.19□□□□□ -1.26
UBASH3B-201ENST00000284273 KLKP1Q107X0 134 aa7.18□□□□□ -1.26
UBASH3B-201ENST00000284273 CHD7Q9P2D1 2997 aa7.18□□□□□ -1.26
UBASH3B-201ENST00000284273 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
UBASH3B-201ENST00000284273 Q8NDZ9 215 aa7.18□□□□□ -1.26
UBASH3B-201ENST00000284273 FREM2Q5SZK8 3169 aa7.17□□□□□ -1.26
UBASH3B-201ENST00000284273 DNAH14Q0VDD8 3507 aa7.17□□□□□ -1.26
UBASH3B-201ENST00000284273 FAM229BQ4G0N7 80 aa7.17□□□□□ -1.26
UBASH3B-201ENST00000284273 SZT2Q5T011 3432 aa7.16□□□□□ -1.26
UBASH3B-201ENST00000284273 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
UBASH3B-201ENST00000284273 Q5W150 140 aa7.15□□□□□ -1.26
UBASH3B-201ENST00000284273 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
UBASH3B-201ENST00000284273 ADM2Q7Z4H4 148 aa7.14□□□□□ -1.27
UBASH3B-201ENST00000284273 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa7.14□□□□□ -1.27
UBASH3B-201ENST00000284273 UNC80Q8N2C7 3258 aa7.13□□□□□ -1.27
UBASH3B-201ENST00000284273 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa7.12□□□□□ -1.27
UBASH3B-201ENST00000284273 PANO1I0J062 215 aa7.11□□□□□ -1.27
UBASH3B-201ENST00000284273 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa7.11□□□□□ -1.27
UBASH3B-201ENST00000284273 PRAC1Q96KF2 57 aa7.11□□□□□ -1.27
UBASH3B-201ENST00000284273 MGAQ8IWI9 3026 aa7.1□□□□□ -1.27
UBASH3B-201ENST00000284273 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa7.1□□□□□ -1.27
UBASH3B-201ENST00000284273 WDFY4Q6ZS81 3184 aa7.09□□□□□ -1.27
UBASH3B-201ENST00000284273 DMAC1Q96GE9 116 aa7.08□□□□□ -1.28
UBASH3B-201ENST00000284273 OCR1Q9BZK8 76 aa7.08□□□□□ -1.28
UBASH3B-201ENST00000284273 TEX15Q9BXT5 2789 aa7.08□□□□□ -1.28
UBASH3B-201ENST00000284273 SPATA8Q6RVD6 105 aa7.07□□□□□ -1.28
UBASH3B-201ENST00000284273 AKAP13Q12802 2813 aa7.06□□□□□ -1.28
UBASH3B-201ENST00000284273 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
UBASH3B-201ENST00000284273 A0A087X002 238 aa7.03□□□□□ -1.28
UBASH3B-201ENST00000284273 OXTP01178 125 aa7.03□□□□□ -1.28
UBASH3B-201ENST00000284273 CHD6Q8TD26 2715 aa7.01□□□□□ -1.29
UBASH3B-201ENST00000284273 COL6A3P12111 3177 aa7.01□□□□□ -1.29
UBASH3B-201ENST00000284273 VPS13AQ96RL7 3174 aa7.01□□□□□ -1.29
UBASH3B-201ENST00000284273 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa6.99□□□□□ -1.29
UBASH3B-201ENST00000284273 FRYQ5TBA9 3013 aa6.98□□□□□ -1.29
UBASH3B-201ENST00000284273 HTTP42858 3142 aa6.97□□□□□ -1.29
UBASH3B-201ENST00000284273 CENPEQ02224 2701 aa6.97□□□□□ -1.29
UBASH3B-201ENST00000284273 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.96□□□□□ -1.3
UBASH3B-201ENST00000284273 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.95□□□□□ -1.3
UBASH3B-201ENST00000284273 REV3LO60673 3130 aa6.94□□□□□ -1.3
UBASH3B-201ENST00000284273 Q6ZR54 194 aa6.94□□□□□ -1.3
UBASH3B-201ENST00000284273 STAB1Q9NY15 2570 aa6.93□□□□□ -1.3
UBASH3B-201ENST00000284273 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa6.93□□□□□ -1.3
UBASH3B-201ENST00000284273 VCANP13611 3396 aa6.93□□□□□ -1.3
UBASH3B-201ENST00000284273 SPRR1AP35321 89 aa6.92□□□□□ -1.3
UBASH3B-201ENST00000284273 SPEGQ15772 3267 aa6.91□□□□□ -1.3
UBASH3B-201ENST00000284273 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
UBASH3B-201ENST00000284273 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
UBASH3B-201ENST00000284273 Q75L30 129 aa6.9□□□□□ -1.31
UBASH3B-201ENST00000284273 BAHCC1Q9P281 2608 aa6.89□□□□□ -1.31
UBASH3B-201ENST00000284273 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.89□□□□□ -1.31
UBASH3B-201ENST00000284273 A0A1B0GVY2 172 aa6.88□□□□□ -1.31
UBASH3B-201ENST00000284273 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.88□□□□□ -1.31
UBASH3B-201ENST00000284273 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa6.88□□□□□ -1.31
UBASH3B-201ENST00000284273 ROMO1P60602 79 aa6.88□□□□□ -1.31
UBASH3B-201ENST00000284273 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6.88□□□□□ -1.31
UBASH3B-201ENST00000284273 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.85□□□□□ -1.31
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.85□□□□□ -1.31
UBASH3B-201ENST00000284273 A8MUU9 505 aa6.83□□□□□ -1.32
UBASH3B-201ENST00000284273 A0A0A0MQY5 61 aa6.82□□□□□ -1.32
UBASH3B-201ENST00000284273 Q5VV11 94 aa6.81□□□□□ -1.32
UBASH3B-201ENST00000284273 A8MU10 97 aa6.8□□□□□ -1.32
UBASH3B-201ENST00000284273 COL6A5A8TX70 2615 aa6.8□□□□□ -1.32
UBASH3B-201ENST00000284273 UNC79Q9P2D8 2635 aa6.8□□□□□ -1.32
UBASH3B-201ENST00000284273 SPRR1BP22528 89 aa6.8□□□□□ -1.32
UBASH3B-201ENST00000284273 CHD9Q3L8U1 2897 aa6.79□□□□□ -1.32
UBASH3B-201ENST00000284273 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
UBASH3B-201ENST00000284273 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
UBASH3B-201ENST00000284273 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
UBASH3B-201ENST00000284273 DSPP15924 2871 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
UBASH3B-201ENST00000284273 LAMA1P25391 3075 aa6.74□□□□□ -1.33
UBASH3B-201ENST00000284273 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa6.74□□□□□ -1.33
UBASH3B-201ENST00000284273 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
UBASH3B-201ENST00000284273 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa6.69□□□□□ -1.34
UBASH3B-201ENST00000284273 KALRNO60229 2985 aa6.69□□□□□ -1.34
UBASH3B-201ENST00000284273 USP34Q70CQ2 3546 aa6.68□□□□□ -1.34
UBASH3B-201ENST00000284273 Q5XG85 94 aa6.67□□□□□ -1.34
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.67□□□□□ -1.34
UBASH3B-201ENST00000284273 STAB2Q8WWQ8 2551 aa6.66□□□□□ -1.34
UBASH3B-201ENST00000284273 LRBAP50851 2863 aa6.65□□□□□ -1.34
UBASH3B-201ENST00000284273 ITPR2Q14571 2701 aa6.65□□□□□ -1.34
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP10-8P60410 259 aa6.65□□□□□ -1.35
UBASH3B-201ENST00000284273 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
UBASH3B-201ENST00000284273 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa6.64□□□□□ -1.35
UBASH3B-201ENST00000284273 EYSQ5T1H1 3165 aa6.63□□□□□ -1.35
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
UBASH3B-201ENST00000284273 MYO15AQ9UKN7 3530 aa6.62□□□□□ -1.35
UBASH3B-201ENST00000284273 TRANK1O15050 2925 aa6.62□□□□□ -1.35
UBASH3B-201ENST00000284273 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.61□□□□□ -1.35
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF292O60281 2723 aa6.61□□□□□ -1.35
UBASH3B-201ENST00000284273 NOTCH1P46531 2555 aa6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-201ENST00000284273 ATMQ13315 3056 aa6.6□□□□□ -1.35
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 91.5 ms