RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263054.10

SORCS1-201, Transcript of sortilin related VPS10 domain containing receptor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SORCS1, Length 7,272 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS1-201ENST00000263054 KLK9Q2XQG4 91 aa9□□□□□ -0.97
SORCS1-201ENST00000263054 S4R3F8 94 aa9□□□□□ -0.97
SORCS1-201ENST00000263054 KLKP1Q107X0 134 aa9□□□□□ -0.97
SORCS1-201ENST00000263054 USP34Q70CQ2 3546 aa8.98□□□□□ -0.97
SORCS1-201ENST00000263054 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa8.97□□□□□ -0.97
SORCS1-201ENST00000263054 LINC00483Q53H64 154 aa8.95□□□□□ -0.98
SORCS1-201ENST00000263054 A0A1B0GU33 70 aa8.94□□□□□ -0.98
SORCS1-201ENST00000263054 HRES1P13985 223 aa8.94□□□□□ -0.98
SORCS1-201ENST00000263054 CHD6Q8TD26 2715 aa8.92□□□□□ -0.98
SORCS1-201ENST00000263054 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
SORCS1-201ENST00000263054 LCA10Q71F78 164 aa8.9□□□□□ -0.98
SORCS1-201ENST00000263054 FRYQ5TBA9 3013 aa8.9□□□□□ -0.98
SORCS1-201ENST00000263054 Q5VSD8 79 aa8.89□□□□□ -0.99
SORCS1-201ENST00000263054 Q1T7F1 81 aa8.89□□□□□ -0.99
SORCS1-201ENST00000263054 ATRQ13535 2644 aa8.89□□□□□ -0.99
SORCS1-201ENST00000263054 TEX15Q9BXT5 2789 aa8.87□□□□□ -0.99
SORCS1-201ENST00000263054 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
SORCS1-201ENST00000263054 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa8.87□□□□□ -0.99
SORCS1-201ENST00000263054 FAM229BQ4G0N7 80 aa8.86□□□□□ -0.99
SORCS1-201ENST00000263054 MYO15AQ9UKN7 3530 aa8.86□□□□□ -0.99
SORCS1-201ENST00000263054 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
SORCS1-201ENST00000263054 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa8.83□□□□□ -1
SORCS1-201ENST00000263054 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
SORCS1-201ENST00000263054 MAST4O15021 2626 aa8.83□□□□□ -1
SORCS1-201ENST00000263054 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
SORCS1-201ENST00000263054 R4GN34 69 aa8.82□□□□□ -1
SORCS1-201ENST00000263054 CSAG1Q6PB30 78 aa8.82□□□□□ -1
SORCS1-201ENST00000263054 OCR1Q9BZK8 76 aa8.82□□□□□ -1
SORCS1-201ENST00000263054 EYSQ5T1H1 3165 aa8.81□□□□□ -1
SORCS1-201ENST00000263054 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa8.81□□□□□ -1
SORCS1-201ENST00000263054 CENPEQ02224 2701 aa8.8□□□□□ -1
SORCS1-201ENST00000263054 Q8NDZ9 215 aa8.79□□□□□ -1
SORCS1-201ENST00000263054 KALRNO60229 2985 aa8.79□□□□□ -1
SORCS1-201ENST00000263054 SPINK7P58062 85 aa8.77□□□□□ -1.01
SORCS1-201ENST00000263054 KRTAP10-2P60368 255 aa8.77□□□□□ -1.01
SORCS1-201ENST00000263054 PRAC1Q96KF2 57 aa8.77□□□□□ -1.01
SORCS1-201ENST00000263054 PLAC8Q9NZF1 115 aa8.75□□□□□ -1.01
SORCS1-201ENST00000263054 KRTAP10-1P60331 282 aa8.74□□□□□ -1.01
SORCS1-201ENST00000263054 Q5W150 140 aa8.73□□□□□ -1.01
SORCS1-201ENST00000263054 ASPMQ8IZT6 3477 aa8.72□□□□□ -1.01
SORCS1-201ENST00000263054 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa8.72□□□□□ -1.01
SORCS1-201ENST00000263054 FRYLO94915 3013 aa8.72□□□□□ -1.01
SORCS1-201ENST00000263054 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa8.71□□□□□ -1.01
SORCS1-201ENST00000263054 LRBAP50851 2863 aa8.7□□□□□ -1.02
SORCS1-201ENST00000263054 DMAC1Q96GE9 116 aa8.7□□□□□ -1.02
SORCS1-201ENST00000263054 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
SORCS1-201ENST00000263054 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
SORCS1-201ENST00000263054 TRANK1O15050 2925 aa8.69□□□□□ -1.02
SORCS1-201ENST00000263054 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
SORCS1-201ENST00000263054 M0QZ58 72 aa8.68□□□□□ -1.02
SORCS1-201ENST00000263054 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa8.68□□□□□ -1.02
SORCS1-201ENST00000263054 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa8.65□□□□□ -1.02
SORCS1-201ENST00000263054 ADM2Q7Z4H4 148 aa8.64□□□□□ -1.03
SORCS1-201ENST00000263054 CHD9Q3L8U1 2897 aa8.63□□□□□ -1.03
SORCS1-201ENST00000263054 Q75L30 129 aa8.63□□□□□ -1.03
SORCS1-201ENST00000263054 CYSTM1Q9H1C7 97 aa8.62□□□□□ -1.03
SORCS1-201ENST00000263054 DCHS1Q96JQ0 3298 aa8.62□□□□□ -1.03
SORCS1-201ENST00000263054 PLAC4Q8WY50 150 aa8.62□□□□□ -1.03
SORCS1-201ENST00000263054 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
SORCS1-201ENST00000263054 SPATA8Q6RVD6 105 aa8.61□□□□□ -1.03
SORCS1-201ENST00000263054 DSPP15924 2871 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
SORCS1-201ENST00000263054 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa8.61□□□□□ -1.03
SORCS1-201ENST00000263054 COL6A5A8TX70 2615 aa8.6□□□□□ -1.03
SORCS1-201ENST00000263054 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa8.6□□□□□ -1.03
SORCS1-201ENST00000263054 ATMQ13315 3056 aa8.59□□□□□ -1.03
SORCS1-201ENST00000263054 LCE6AA0A183 80 aa8.56□□□□□ -1.04
SORCS1-201ENST00000263054 PANO1I0J062 215 aa8.55□□□□□ -1.04
SORCS1-201ENST00000263054 UNC79Q9P2D8 2635 aa8.54□□□□□ -1.04
SORCS1-201ENST00000263054 LINC00472Q9H8W2 130 aa8.54□□□□□ -1.04
SORCS1-201ENST00000263054 H3BS24 57 aa8.54□□□□□ -1.04
SORCS1-201ENST00000263054 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa8.53□□□□□ -1.04
SORCS1-201ENST00000263054 LOC400499M0QZD8 3231 aa8.53□□□□□ -1.04
SORCS1-201ENST00000263054 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
SORCS1-201ENST00000263054 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa8.52□□□□□ -1.05
SORCS1-201ENST00000263054 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa8.52□□□□□ -1.05
SORCS1-201ENST00000263054 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
SORCS1-201ENST00000263054 Q5VV11 94 aa8.51□□□□□ -1.05
SORCS1-201ENST00000263054 STAB1Q9NY15 2570 aa8.51□□□□□ -1.05
SORCS1-201ENST00000263054 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa8.51□□□□□ -1.05
SORCS1-201ENST00000263054 A0A087X002 238 aa8.5□□□□□ -1.05
SORCS1-201ENST00000263054 SPRR1AP35321 89 aa8.5□□□□□ -1.05
SORCS1-201ENST00000263054 ROMO1P60602 79 aa8.48□□□□□ -1.05
SORCS1-201ENST00000263054 RPL37P61927 97 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
SORCS1-201ENST00000263054 ITPR2Q14571 2701 aa8.46□□□□□ -1.05
SORCS1-201ENST00000263054 LAMA5O15230 3695 aa8.46□□□□□ -1.06
SORCS1-201ENST00000263054 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
SORCS1-201ENST00000263054 COL12A1Q99715 3063 aa8.45□□□□□ -1.06
SORCS1-201ENST00000263054 Q6ZR54 194 aa8.45□□□□□ -1.06
SORCS1-201ENST00000263054 Q5XG85 94 aa8.44□□□□□ -1.06
SORCS1-201ENST00000263054 A0A0A0MQY5 61 aa8.43□□□□□ -1.06
SORCS1-201ENST00000263054 APCP25054 2843 aa8.41□□□□□ -1.06
SORCS1-201ENST00000263054 ZZEF1O43149 2961 aa8.4□□□□□ -1.06
SORCS1-201ENST00000263054 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
SORCS1-201ENST00000263054 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa8.38□□□□□ -1.07
SORCS1-201ENST00000263054 OXTP01178 125 aa8.38□□□□□ -1.07
SORCS1-201ENST00000263054 BAHCC1Q9P281 2608 aa8.36□□□□□ -1.07
SORCS1-201ENST00000263054 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa8.35□□□□□ -1.07
SORCS1-201ENST00000263054 SPRR1BP22528 89 aa8.32□□□□□ -1.08
SORCS1-201ENST00000263054 ZNF292O60281 2723 aa8.31□□□□□ -1.08
SORCS1-201ENST00000263054 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa8.31□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.7 ms