RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000252211.6

ZKSCAN3-201, Transcript of zinc finger with KRAB and SCAN domains 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZKSCAN3, Length 4,725 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN3-201ENST00000252211 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa7.73□□□□□ -1.17
ZKSCAN3-201ENST00000252211 C8orf17Q9NRJ1 99 aa7.73□□□□□ -1.17
ZKSCAN3-201ENST00000252211 LAMA1P25391 3075 aa7.72□□□□□ -1.17
ZKSCAN3-201ENST00000252211 A0A1B0GVX0 72 aa7.72□□□□□ -1.17
ZKSCAN3-201ENST00000252211 C9orf92A6NGG3 77 aa7.71□□□□□ -1.17
ZKSCAN3-201ENST00000252211 LCE6AA0A183 80 aa7.71□□□□□ -1.17
ZKSCAN3-201ENST00000252211 FAM104AQ969W3 186 aa7.71□□□□□ -1.18
ZKSCAN3-201ENST00000252211 PLAC8Q9NZF1 115 aa7.68□□□□□ -1.18
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TENM4Q6N022 2769 aa7.68□□□□□ -1.18
ZKSCAN3-201ENST00000252211 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa7.67□□□□□ -1.18
ZKSCAN3-201ENST00000252211 A0A1W2PNM2 257 aa7.66□□□□□ -1.18
ZKSCAN3-201ENST00000252211 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
ZKSCAN3-201ENST00000252211 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa7.66□□□□□ -1.18
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ZKSCAN3-201ENST00000252211 VCANP13611 3396 aa7.65□□□□□ -1.19
ZKSCAN3-201ENST00000252211 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa7.65□□□□□ -1.19
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa7.64□□□□□ -1.19
ZKSCAN3-201ENST00000252211 PRR26Q8N8Z3 221 aa7.64□□□□□ -1.19
ZKSCAN3-201ENST00000252211 APCP25054 2843 aa7.64□□□□□ -1.19
ZKSCAN3-201ENST00000252211 A0A1B0GU69 56 aa7.63□□□□□ -1.19
ZKSCAN3-201ENST00000252211 FAM229BQ4G0N7 80 aa7.63□□□□□ -1.19
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ZKSCAN3-201ENST00000252211 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa7.6□□□□□ -1.19
ZKSCAN3-201ENST00000252211 NBEAQ8NFP9 2946 aa7.6□□□□□ -1.19
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ZKSCAN3-201ENST00000252211 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.58□□□□□ -1.2
ZKSCAN3-201ENST00000252211 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP7.57□□□□□ -1.2
ZKSCAN3-201ENST00000252211 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa7.56□□□□□ -1.2
ZKSCAN3-201ENST00000252211 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa7.56□□□□□ -1.2
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SPRR1AP35321 89 aa7.56□□□□□ -1.2
ZKSCAN3-201ENST00000252211 KLKP1Q107X0 134 aa7.54□□□□□ -1.2
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ZKSCAN3-201ENST00000252211 FREM2Q5SZK8 3169 aa7.54□□□□□ -1.2
ZKSCAN3-201ENST00000252211 KRTAP10-1P60331 282 aa7.53□□□□□ -1.2
ZKSCAN3-201ENST00000252211 KRTAP10-2P60368 255 aa7.53□□□□□ -1.2
ZKSCAN3-201ENST00000252211 Q6ZR54 194 aa7.53□□□□□ -1.2
ZKSCAN3-201ENST00000252211 LINC01600Q96MT4 127 aa7.52□□□□□ -1.21
ZKSCAN3-201ENST00000252211 DMXL1Q9Y485 3027 aa7.52□□□□□ -1.21
ZKSCAN3-201ENST00000252211 Q8NDZ9 215 aa7.51□□□□□ -1.21
ZKSCAN3-201ENST00000252211 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
ZKSCAN3-201ENST00000252211 Q5VSD8 79 aa7.51□□□□□ -1.21
ZKSCAN3-201ENST00000252211 LRBAP50851 2863 aa7.51□□□□□ -1.21
ZKSCAN3-201ENST00000252211 Q6ZSA8 131 aa7.5□□□□□ -1.21
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ZANQ9Y493 2812 aa7.47□□□□□ -1.21
ZKSCAN3-201ENST00000252211 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.47□□□□□ -1.21
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SPRR1BP22528 89 aa7.46□□□□□ -1.21
ZKSCAN3-201ENST00000252211 COA5Q86WW8 74 aa7.46□□□□□ -1.22
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa7.45□□□□□ -1.22
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CELSR2Q9HCU4 2923 aa7.44□□□□□ -1.22
ZKSCAN3-201ENST00000252211 A8MUN3 132 aa7.44□□□□□ -1.22
ZKSCAN3-201ENST00000252211 Q5XG85 94 aa7.43□□□□□ -1.22
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CYSTM1Q9H1C7 97 aa7.4□□□□□ -1.22
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ZKSCAN3-201ENST00000252211 Q8N1X5 172 aa7.39□□□□□ -1.23
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ZKSCAN3-201ENST00000252211 PANO1I0J062 215 aa7.37□□□□□ -1.23
ZKSCAN3-201ENST00000252211 DCHS2Q6V1P9 2916 aa7.37□□□□□ -1.23
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ZKSCAN3-201ENST00000252211 UQCR11O14957 56 aa7.34□□□□□ -1.23
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ZKSCAN3-201ENST00000252211 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa7.33□□□□□ -1.24
ZKSCAN3-201ENST00000252211 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa7.33□□□□□ -1.24
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa7.32□□□□□ -1.24
ZKSCAN3-201ENST00000252211 M0R2T5 61 aa7.31□□□□□ -1.24
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa7.31□□□□□ -1.24
ZKSCAN3-201ENST00000252211 OXTP01178 125 aa7.31□□□□□ -1.24
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
ZKSCAN3-201ENST00000252211 OCR1Q9BZK8 76 aa7.3□□□□□ -1.24
ZKSCAN3-201ENST00000252211 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa7.3□□□□□ -1.24
ZKSCAN3-201ENST00000252211 LINC00472Q9H8W2 130 aa7.3□□□□□ -1.24
ZKSCAN3-201ENST00000252211 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
ZKSCAN3-201ENST00000252211 USP34Q70CQ2 3546 aa7.3□□□□□ -1.24
ZKSCAN3-201ENST00000252211 LINC00483Q53H64 154 aa7.29□□□□□ -1.24
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ZKSCAN3-201ENST00000252211 LINC01554Q52M75 96 aa7.26□□□□□ -1.25
ZKSCAN3-201ENST00000252211 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
ZKSCAN3-201ENST00000252211 HRES1P13985 223 aa7.23□□□□□ -1.25
ZKSCAN3-201ENST00000252211 Q1T7F1 81 aa7.23□□□□□ -1.25
ZKSCAN3-201ENST00000252211 LOC400499M0QZD8 3231 aa7.22□□□□□ -1.25
ZKSCAN3-201ENST00000252211 MIR22HGQ0VDD5 57 aa7.22□□□□□ -1.25
ZKSCAN3-201ENST00000252211 LCA10Q71F78 164 aa7.22□□□□□ -1.25
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SPINK7P58062 85 aa7.21□□□□□ -1.25
ZKSCAN3-201ENST00000252211 A0A087X002 238 aa7.21□□□□□ -1.26
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SPEGQ15772 3267 aa7.2□□□□□ -1.26
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CSAG1Q6PB30 78 aa7.19□□□□□ -1.26
ZKSCAN3-201ENST00000252211 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
ZKSCAN3-201ENST00000252211 FBN2P35556 2912 aa7.17□□□□□ -1.26
ZKSCAN3-201ENST00000252211 MXRA5Q9NR99 2828 aa7.17□□□□□ -1.26
ZKSCAN3-201ENST00000252211 Q5W150 140 aa7.17□□□□□ -1.26
ZKSCAN3-201ENST00000252211 A0A0D9SG42 100 aa7.15□□□□□ -1.26
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SPINT4Q6UDR6 99 aa7.15□□□□□ -1.26
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TENM3Q9P273 2699 aa7.15□□□□□ -1.27
ZKSCAN3-201ENST00000252211 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa7.14□□□□□ -1.27
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa7.14□□□□□ -1.27
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