RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246024.6

TMX4-201, Transcript of thioredoxin related transmembrane protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMX4, Length 6,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX4-201ENST00000246024 SZT2Q5T011 3432 aa8.5□□□□□ -1.05
TMX4-201ENST00000246024 VPS13AQ96RL7 3174 aa8.5□□□□□ -1.05
TMX4-201ENST00000246024 TEX15Q9BXT5 2789 aa8.49□□□□□ -1.05
TMX4-201ENST00000246024 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
TMX4-201ENST00000246024 CSAG1Q6PB30 78 aa8.47□□□□□ -1.05
TMX4-201ENST00000246024 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa8.47□□□□□ -1.05
TMX4-201ENST00000246024 CR1P17927 2039 aa8.46□□□□□ -1.06
TMX4-201ENST00000246024 AKAP13Q12802 2813 aa8.45□□□□□ -1.06
TMX4-201ENST00000246024 S4R3F8 94 aa8.45□□□□□ -1.06
TMX4-201ENST00000246024 HRES1P13985 223 aa8.45□□□□□ -1.06
TMX4-201ENST00000246024 DNAH14Q0VDD8 3507 aa8.44□□□□□ -1.06
TMX4-201ENST00000246024 DSPP15924 2871 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
TMX4-201ENST00000246024 WIPF1O43516 503 aa8.42□□□□□ -1.06
TMX4-201ENST00000246024 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
TMX4-201ENST00000246024 FREM2Q5SZK8 3169 aa8.42□□□□□ -1.06
TMX4-201ENST00000246024 CHD6Q8TD26 2715 aa8.41□□□□□ -1.06
TMX4-201ENST00000246024 R4GN34 69 aa8.4□□□□□ -1.06
TMX4-201ENST00000246024 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
TMX4-201ENST00000246024 BAHCC1Q9P281 2608 aa8.37□□□□□ -1.07
TMX4-201ENST00000246024 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
TMX4-201ENST00000246024 TRANK1O15050 2925 aa8.36□□□□□ -1.07
TMX4-201ENST00000246024 VCANP13611 3396 aa8.34□□□□□ -1.07
TMX4-201ENST00000246024 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
TMX4-201ENST00000246024 FRYQ5TBA9 3013 aa8.33□□□□□ -1.08
TMX4-201ENST00000246024 DMAC1Q96GE9 116 aa8.33□□□□□ -1.08
TMX4-201ENST00000246024 STAB1Q9NY15 2570 aa8.32□□□□□ -1.08
TMX4-201ENST00000246024 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
TMX4-201ENST00000246024 FAM229BQ4G0N7 80 aa8.32□□□□□ -1.08
TMX4-201ENST00000246024 COL6A3P12111 3177 aa8.29□□□□□ -1.08
TMX4-201ENST00000246024 Q5VSD8 79 aa8.29□□□□□ -1.08
TMX4-201ENST00000246024 A0A0A0MQY5 61 aa8.29□□□□□ -1.08
TMX4-201ENST00000246024 ZNF292O60281 2723 aa8.29□□□□□ -1.08
TMX4-201ENST00000246024 REV3LO60673 3130 aa8.29□□□□□ -1.08
TMX4-201ENST00000246024 SPINK7P58062 85 aa8.28□□□□□ -1.08
TMX4-201ENST00000246024 COL6A5A8TX70 2615 aa8.28□□□□□ -1.08
TMX4-201ENST00000246024 OCR1Q9BZK8 76 aa8.28□□□□□ -1.08
TMX4-201ENST00000246024 PLAC4Q8WY50 150 aa8.27□□□□□ -1.09
TMX4-201ENST00000246024 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa8.25□□□□□ -1.09
TMX4-201ENST00000246024 PLAC8Q9NZF1 115 aa8.24□□□□□ -1.09
TMX4-201ENST00000246024 KRTAP10-2P60368 255 aa8.24□□□□□ -1.09
TMX4-201ENST00000246024 LAMA1P25391 3075 aa8.24□□□□□ -1.09
TMX4-201ENST00000246024 PRAC1Q96KF2 57 aa8.22□□□□□ -1.09
TMX4-201ENST00000246024 M0QZ58 72 aa8.22□□□□□ -1.09
TMX4-201ENST00000246024 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa8.21□□□□□ -1.09
TMX4-201ENST00000246024 Q5W150 140 aa8.2□□□□□ -1.1
TMX4-201ENST00000246024 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa8.2□□□□□ -1.1
TMX4-201ENST00000246024 KRTAP10-1P60331 282 aa8.19□□□□□ -1.1
TMX4-201ENST00000246024 Q75L30 129 aa8.19□□□□□ -1.1
TMX4-201ENST00000246024 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa8.18□□□□□ -1.1
TMX4-201ENST00000246024 IGSF10Q6WRI0 2623 aa8.18□□□□□ -1.1
TMX4-201ENST00000246024 LCE6AA0A183 80 aa8.16□□□□□ -1.1
TMX4-201ENST00000246024 UNC79Q9P2D8 2635 aa8.16□□□□□ -1.1
TMX4-201ENST00000246024 NOTCH1P46531 2555 aa8.16□□□□□ -1.1
TMX4-201ENST00000246024 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa8.16□□□□□ -1.1
TMX4-201ENST00000246024 Q8NDZ9 215 aa8.15□□□□□ -1.1
TMX4-201ENST00000246024 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa8.14□□□□□ -1.11
TMX4-201ENST00000246024 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa8.14□□□□□ -1.11
TMX4-201ENST00000246024 EYSQ5T1H1 3165 aa8.12□□□□□ -1.11
TMX4-201ENST00000246024 TACC2O95359 2948 aa8.12□□□□□ -1.11
TMX4-201ENST00000246024 FRYLO94915 3013 aa8.11□□□□□ -1.11
TMX4-201ENST00000246024 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
TMX4-201ENST00000246024 SPEGQ15772 3267 aa8.11□□□□□ -1.11
TMX4-201ENST00000246024 RPL37P61927 97 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
TMX4-201ENST00000246024 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa8.11□□□□□ -1.11
TMX4-201ENST00000246024 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa8.1□□□□□ -1.11
TMX4-201ENST00000246024 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
TMX4-201ENST00000246024 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa8.09□□□□□ -1.11
TMX4-201ENST00000246024 ATMQ13315 3056 aa8.07□□□□□ -1.12
TMX4-201ENST00000246024 ADM2Q7Z4H4 148 aa8.07□□□□□ -1.12
TMX4-201ENST00000246024 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
TMX4-201ENST00000246024 ROMO1P60602 79 aa8.06□□□□□ -1.12
TMX4-201ENST00000246024 PANO1I0J062 215 aa8.05□□□□□ -1.12
TMX4-201ENST00000246024 H3BS24 57 aa8.05□□□□□ -1.12
TMX4-201ENST00000246024 COL12A1Q99715 3063 aa8.05□□□□□ -1.12
TMX4-201ENST00000246024 LINC00472Q9H8W2 130 aa8.03□□□□□ -1.12
TMX4-201ENST00000246024 KALRNO60229 2985 aa8.02□□□□□ -1.13
TMX4-201ENST00000246024 SPRR1AP35321 89 aa8.02□□□□□ -1.13
TMX4-201ENST00000246024 OXTP01178 125 aa8.01□□□□□ -1.13
TMX4-201ENST00000246024 SPATA8Q6RVD6 105 aa7.99□□□□□ -1.13
TMX4-201ENST00000246024 Q5VV11 94 aa7.98□□□□□ -1.13
TMX4-201ENST00000246024 LRBAP50851 2863 aa7.98□□□□□ -1.13
TMX4-201ENST00000246024 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
TMX4-201ENST00000246024 ITPR2Q14571 2701 aa7.96□□□□□ -1.13
TMX4-201ENST00000246024 SPRR1BP22528 89 aa7.96□□□□□ -1.13
TMX4-201ENST00000246024 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa7.93□□□□□ -1.14
TMX4-201ENST00000246024 USP34Q70CQ2 3546 aa7.93□□□□□ -1.14
TMX4-201ENST00000246024 MYO15AQ9UKN7 3530 aa7.92□□□□□ -1.14
TMX4-201ENST00000246024 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
TMX4-201ENST00000246024 ITPR1Q14643 2758 aa7.91□□□□□ -1.14
TMX4-201ENST00000246024 Q6ZR54 194 aa7.9□□□□□ -1.14
TMX4-201ENST00000246024 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa7.89□□□□□ -1.15
TMX4-201ENST00000246024 STAB2Q8WWQ8 2551 aa7.88□□□□□ -1.15
TMX4-201ENST00000246024 A0A087X002 238 aa7.87□□□□□ -1.15
TMX4-201ENST00000246024 CYSTM1Q9H1C7 97 aa7.86□□□□□ -1.15
TMX4-201ENST00000246024 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa7.86□□□□□ -1.15
TMX4-201ENST00000246024 Q5XG85 94 aa7.86□□□□□ -1.15
TMX4-201ENST00000246024 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
TMX4-201ENST00000246024 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
TMX4-201ENST00000246024 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
TMX4-201ENST00000246024 FLNCQ14315 2725 aa7.82□□□□□ -1.16
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