RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220888.9

TRPS1-201, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 5,480 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-201ENST00000220888 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
TRPS1-201ENST00000220888 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.37□□□□□ -1.39
TRPS1-201ENST00000220888 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa6.37□□□□□ -1.39
TRPS1-201ENST00000220888 SPRR1BP22528 89 aa6.36□□□□□ -1.39
TRPS1-201ENST00000220888 EP400Q96L91 3159 aa6.35□□□□□ -1.39
TRPS1-201ENST00000220888 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.3□□□□□ -1.4
TRPS1-201ENST00000220888 A0A0A0MQY5 61 aa6.29□□□□□ -1.4
TRPS1-201ENST00000220888 Q75L30 129 aa6.29□□□□□ -1.4
TRPS1-201ENST00000220888 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.29□□□□□ -1.4
TRPS1-201ENST00000220888 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
TRPS1-201ENST00000220888 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa6.28□□□□□ -1.4
TRPS1-201ENST00000220888 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.27□□□□□ -1.41
TRPS1-201ENST00000220888 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
TRPS1-201ENST00000220888 TEX15Q9BXT5 2789 aa6.26□□□□□ -1.41
TRPS1-201ENST00000220888 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.25□□□□□ -1.41
TRPS1-201ENST00000220888 Q6ZR54 194 aa6.25□□□□□ -1.41
TRPS1-201ENST00000220888 COL6A5A8TX70 2615 aa6.24□□□□□ -1.41
TRPS1-201ENST00000220888 Q8NDZ9 215 aa6.24□□□□□ -1.41
TRPS1-201ENST00000220888 STAB2Q8WWQ8 2551 aa6.24□□□□□ -1.41
TRPS1-201ENST00000220888 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
TRPS1-201ENST00000220888 BAHCC1Q9P281 2608 aa6.21□□□□□ -1.41
TRPS1-201ENST00000220888 AKAP13Q12802 2813 aa6.21□□□□□ -1.42
TRPS1-201ENST00000220888 NOTCH1P46531 2555 aa6.2□□□□□ -1.42
TRPS1-201ENST00000220888 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.2□□□□□ -1.42
TRPS1-201ENST00000220888 ROMO1P60602 79 aa6.19□□□□□ -1.42
TRPS1-201ENST00000220888 UNC79Q9P2D8 2635 aa6.19□□□□□ -1.42
TRPS1-201ENST00000220888 CENPEQ02224 2701 aa6.17□□□□□ -1.42
TRPS1-201ENST00000220888 A0A087X002 238 aa6.16□□□□□ -1.42
TRPS1-201ENST00000220888 PANO1I0J062 215 aa6.16□□□□□ -1.42
TRPS1-201ENST00000220888 PRAC1Q96KF2 57 aa6.13□□□□□ -1.43
TRPS1-201ENST00000220888 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.12□□□□□ -1.43
TRPS1-201ENST00000220888 CHD6Q8TD26 2715 aa6.12□□□□□ -1.43
TRPS1-201ENST00000220888 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
TRPS1-201ENST00000220888 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa6.1□□□□□ -1.43
TRPS1-201ENST00000220888 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.09□□□□□ -1.43
TRPS1-201ENST00000220888 A8MUU9 505 aa6.08□□□□□ -1.44
TRPS1-201ENST00000220888 Q5VV11 94 aa6.06□□□□□ -1.44
TRPS1-201ENST00000220888 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
TRPS1-201ENST00000220888 IGSF10Q6WRI0 2623 aa6.01□□□□□ -1.45
TRPS1-201ENST00000220888 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.01□□□□□ -1.45
TRPS1-201ENST00000220888 CEP350Q5VT06 3117 aa6□□□□□ -1.45
TRPS1-201ENST00000220888 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF292O60281 2723 aa5.96□□□□□ -1.46
TRPS1-201ENST00000220888 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
TRPS1-201ENST00000220888 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa5.95□□□□□ -1.46
TRPS1-201ENST00000220888 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
TRPS1-201ENST00000220888 TNP1P09430 55 aa5.93□□□□□ -1.46
TRPS1-201ENST00000220888 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa5.93□□□□□ -1.46
TRPS1-201ENST00000220888 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
TRPS1-201ENST00000220888 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
TRPS1-201ENST00000220888 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa5.91□□□□□ -1.46
TRPS1-201ENST00000220888 Q5XG85 94 aa5.9□□□□□ -1.46
TRPS1-201ENST00000220888 CYSTM1Q9H1C7 97 aa5.9□□□□□ -1.46
TRPS1-201ENST00000220888 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
TRPS1-201ENST00000220888 C5orf42Q9H799 3197 aa5.86□□□□□ -1.47
TRPS1-201ENST00000220888 A8MU10 97 aa5.85□□□□□ -1.47
TRPS1-201ENST00000220888 H3BS24 57 aa5.85□□□□□ -1.47
TRPS1-201ENST00000220888 KRTAP10-8P60410 259 aa5.83□□□□□ -1.48
TRPS1-201ENST00000220888 ITPR2Q14571 2701 aa5.82□□□□□ -1.48
TRPS1-201ENST00000220888 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
TRPS1-201ENST00000220888 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa5.8□□□□□ -1.48
TRPS1-201ENST00000220888 A0A1B0GVY2 172 aa5.79□□□□□ -1.48
TRPS1-201ENST00000220888 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa5.78□□□□□ -1.48
TRPS1-201ENST00000220888 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa5.77□□□□□ -1.49
TRPS1-201ENST00000220888 TENM4Q6N022 2769 aa5.75□□□□□ -1.49
TRPS1-201ENST00000220888 KRTAP10-10P60014 251 aa5.75□□□□□ -1.49
TRPS1-201ENST00000220888 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.75□□□□□ -1.49
TRPS1-201ENST00000220888 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.74□□□□□ -1.49
TRPS1-201ENST00000220888 MGAQ8IWI9 3026 aa5.73□□□□□ -1.49
TRPS1-201ENST00000220888 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.72□□□□□ -1.49
TRPS1-201ENST00000220888 XP32Q5T750 250 aa5.72□□□□□ -1.49
TRPS1-201ENST00000220888 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
TRPS1-201ENST00000220888 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa5.71□□□□□ -1.5
TRPS1-201ENST00000220888 FRYQ5TBA9 3013 aa5.7□□□□□ -1.5
TRPS1-201ENST00000220888 TPRXLQ17RH7 258 aa5.68□□□□□ -1.5
TRPS1-201ENST00000220888 FLNCQ14315 2725 aa5.67□□□□□ -1.5
TRPS1-201ENST00000220888 PP632Q6XCG6 107 aa5.65□□□□□ -1.5
TRPS1-201ENST00000220888 DSPP15924 2871 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
TRPS1-201ENST00000220888 HIVEP1P15822 2718 aa5.65□□□□□ -1.51
TRPS1-201ENST00000220888 DNAH12Q6ZR08 3092 aa5.64□□□□□ -1.51
TRPS1-201ENST00000220888 REV3LO60673 3130 aa5.63□□□□□ -1.51
TRPS1-201ENST00000220888 A0A0C4DFX4 3053 aa5.63□□□□□ -1.51
TRPS1-201ENST00000220888 CHD7Q9P2D1 2997 aa5.62□□□□□ -1.51
TRPS1-201ENST00000220888 ITPR1Q14643 2758 aa5.62□□□□□ -1.51
TRPS1-201ENST00000220888 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa5.6□□□□□ -1.51
TRPS1-201ENST00000220888 NDUFAF8A1L188 74 aa5.59□□□□□ -1.52
TRPS1-201ENST00000220888 CHD9Q3L8U1 2897 aa5.58□□□□□ -1.52
TRPS1-201ENST00000220888 A6NN06 94 aa5.55□□□□□ -1.52
TRPS1-201ENST00000220888 TRANK1O15050 2925 aa5.53□□□□□ -1.52
TRPS1-201ENST00000220888 UTRNP46939 3433 aa5.52□□□□□ -1.53
TRPS1-201ENST00000220888 CFAP54Q96N23 3096 aa5.51□□□□□ -1.53
TRPS1-201ENST00000220888 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa5.5□□□□□ -1.53
TRPS1-201ENST00000220888 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
TRPS1-201ENST00000220888 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa5.49□□□□□ -1.53
TRPS1-201ENST00000220888 TACC2O95359 2948 aa5.47□□□□□ -1.53
TRPS1-201ENST00000220888 WDFY4Q6ZS81 3184 aa5.47□□□□□ -1.53
TRPS1-201ENST00000220888 TENM3Q9P273 2699 aa5.46□□□□□ -1.54
TRPS1-201ENST00000220888 APCP25054 2843 aa5.46□□□□□ -1.54
TRPS1-201ENST00000220888 P0C880 135 aa5.44□□□□□ -1.54
TRPS1-201ENST00000220888 PCNTO95613 3336 aa5.44□□□□□ -1.54
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