RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637903.1

SPTAN1-238, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, human

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 574 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPTAN1-238	ENST00000637903	CTAG1A	P78358	180 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SPTAN1-238	ENST00000637903	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SPTAN1-238	ENST00000637903	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SPTAN1-238	ENST00000637903	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SPTAN1-238	ENST00000637903		A6NJY4	79 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SPTAN1-238	ENST00000637903	DDT	P30046	118 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SPTAN1-238	ENST00000637903	FXYD2	P54710	66 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SPTAN1-238	ENST00000637903	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SPTAN1-238	ENST00000637903	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SPTAN1-238	ENST00000637903	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SPTAN1-238	ENST00000637903	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SPTAN1-238	ENST00000637903	IGLV6-57	P01721	117 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SPTAN1-238	ENST00000637903	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SPTAN1-238	ENST00000637903	TMEM126A	Q9H061	195 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SPTAN1-238	ENST00000637903	LPA	P08519	4548 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SPTAN1-238	ENST00000637903		A6NDN8	102 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SPTAN1-238	ENST00000637903		M0R143	59 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SPTAN1-238	ENST00000637903	CFC1B	P0CG36	223 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SPTAN1-238	ENST00000637903	CFC1	P0CG37	223 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SPTAN1-238	ENST00000637903	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
SPTAN1-238	ENST00000637903	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SPTAN1-238	ENST00000637903	RAB37	Q96AX2	223 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SPTAN1-238	ENST00000637903	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SPTAN1-238	ENST00000637903	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SPTAN1-238	ENST00000637903		A0A0B4J2C4	111 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SPTAN1-238	ENST00000637903	PRY	O14603	147 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SPTAN1-238	ENST00000637903	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SPTAN1-238	ENST00000637903	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
SPTAN1-238	ENST00000637903	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SPTAN1-238	ENST00000637903	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
SPTAN1-238	ENST00000637903	C1orf137	Q5JT78	98 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SPTAN1-238	ENST00000637903		A0A1B0GWB2	263 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SPTAN1-238	ENST00000637903	PCP4L1	A6NKN8	68 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SPTAN1-238	ENST00000637903		K7ERJ3	54 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SPTAN1-238	ENST00000637903	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
SPTAN1-238	ENST00000637903	BCE1	O60756	84 aa		5	□□□□□ -1.61
SPTAN1-238	ENST00000637903	SPRR1A	P35321	89 aa		5	□□□□□ -1.61
SPTAN1-238	ENST00000637903	BATF	Q16520	125 aa		5	□□□□□ -1.61
SPTAN1-238	ENST00000637903	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		5	□□□□□ -1.61
SPTAN1-238	ENST00000637903	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		5	□□□□□ -1.61
SPTAN1-238	ENST00000637903	DIRC1	Q969H9	104 aa		5	□□□□□ -1.61
SPTAN1-238	ENST00000637903	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		5	□□□□□ -1.61
SPTAN1-238	ENST00000637903	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPTAN1-238	ENST00000637903		H7C2G1	150 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPTAN1-238	ENST00000637903	IGLV7-43	P04211	117 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPTAN1-238	ENST00000637903		Q1RN00	199 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPTAN1-238	ENST00000637903	C6orf99	Q4VX62	202 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPTAN1-238	ENST00000637903	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPTAN1-238	ENST00000637903	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SPTAN1-238	ENST00000637903	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SPTAN1-238	ENST00000637903	UBE2A	P49459	152 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPTAN1-238	ENST00000637903		B5MCH6	92 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPTAN1-238	ENST00000637903		H0Y9J4	135 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPTAN1-238	ENST00000637903	PRLH	P81277	87 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPTAN1-238	ENST00000637903	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPTAN1-238	ENST00000637903	ZNF861P	O60384	105 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPTAN1-238	ENST00000637903	TSPAN13	O95857	204 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPTAN1-238	ENST00000637903	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPTAN1-238	ENST00000637903	COX7B	P24311	80 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPTAN1-238	ENST00000637903	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SPTAN1-238	ENST00000637903	VAMP3	Q15836	100 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPTAN1-238	ENST00000637903		Q6ZRX8	168 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPTAN1-238	ENST00000637903	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPTAN1-238	ENST00000637903	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPTAN1-238	ENST00000637903	PSMB2	P49721	201 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPTAN1-238	ENST00000637903	TRIAP1	O43715	76 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPTAN1-238	ENST00000637903	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPTAN1-238	ENST00000637903	MUC2	Q02817	5179 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPTAN1-238	ENST00000637903	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPTAN1-238	ENST00000637903		Q9BRP9	147 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPTAN1-238	ENST00000637903	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPTAN1-238	ENST00000637903		H0YGX0	51 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPTAN1-238	ENST00000637903	COX6C	P09669	75 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPTAN1-238	ENST00000637903	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPTAN1-238	ENST00000637903	LINC00575	Q6W349	94 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPTAN1-238	ENST00000637903	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SPTAN1-238	ENST00000637903	TAX1BP3	O14907	124 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPTAN1-238	ENST00000637903	SLC25A20	O43772	301 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPTAN1-238	ENST00000637903	ERC2-IT1	O76042	136 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPTAN1-238	ENST00000637903	SCGB1C2	P0DMR2	95 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPTAN1-238	ENST00000637903	PRR4	Q16378	134 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPTAN1-238	ENST00000637903	hADV29S1	A0JD25	119 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPTAN1-238	ENST00000637903	C9orf118	A6NHY6	69 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPTAN1-238	ENST00000637903		H3BUT2	72 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPTAN1-238	ENST00000637903	CLEC2B	Q92478	149 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPTAN1-238	ENST00000637903	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPTAN1-238	ENST00000637903	SNCG	O76070	127 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPTAN1-238	ENST00000637903	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPTAN1-238	ENST00000637903	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SPTAN1-238	ENST00000637903		A0A0U1RQV1	116 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPTAN1-238	ENST00000637903		A0A1B0GX51	115 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPTAN1-238	ENST00000637903	LYRM7	Q5U5X0	104 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPTAN1-238	ENST00000637903	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPTAN1-238	ENST00000637903	SPRR4	Q96PI1	79 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPTAN1-238	ENST00000637903		A0A1W2PPM0	123 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPTAN1-238	ENST00000637903	LCE2A	Q5TA79	106 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SPTAN1-238	ENST00000637903	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPTAN1-238	ENST00000637903	UNQ6493/PRO21345	Q6UXR8	122 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SPTAN1-238	ENST00000637903		Q6ZQY7	126 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPTAN1-238	ENST00000637903	LST1	O00453	97 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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