RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577827.5

PTPRM-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 4,640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-205ENST00000577827 FAM168BA1KXE4 195 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRM-205ENST00000577827 A0A1W2PNM2 257 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRM-205ENST00000577827 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRM-205ENST00000577827 EPG5Q9HCE0 2579 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-205ENST00000577827 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRM-205ENST00000577827 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-205ENST00000577827 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-205ENST00000577827 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-205ENST00000577827 Q5XG85 94 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-205ENST00000577827 F8P00451 2351 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRM-205ENST00000577827 CD164Q04900 197 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-205ENST00000577827 LY6G6CO95867 125 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-205ENST00000577827 Q1T7F1 81 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRM-205ENST00000577827 C8orf87E5RJ46 101 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRM-205ENST00000577827 C1orf134Q5TEV5 83 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRM-205ENST00000577827 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRM-205ENST00000577827 SPRR4Q96PI1 79 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-205ENST00000577827 RETNLBQ9BQ08 111 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-205ENST00000577827 CFAP54Q96N23 3096 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-205ENST00000577827 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-205ENST00000577827 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-205ENST00000577827 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-205ENST00000577827 FAM229AH3BQW9 127 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-205ENST00000577827 IGKV2-30P06310 120 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-205ENST00000577827 MDFIQ99750 246 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-205ENST00000577827 SPINK1P00995 79 aa6.71□□□□□ -1.33
PTPRM-205ENST00000577827 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-205ENST00000577827 FASNP49327 2511 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-205ENST00000577827 BRCA2P51587 3418 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-205ENST00000577827 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-205ENST00000577827 CHTF8P0CG12 524 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-205ENST00000577827 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-205ENST00000577827 LINC00313P59037 77 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-205ENST00000577827 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-205ENST00000577827 KRTAP10-3P60369 221 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-205ENST00000577827 A0A1B0GVX0 72 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-205ENST00000577827 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRM-205ENST00000577827 DSCR10P59022 87 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-205ENST00000577827 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PTPRM-205ENST00000577827 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRM-205ENST00000577827 UQCR11O14957 56 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-205ENST00000577827 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-205ENST00000577827 Q8NDZ9 215 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRM-205ENST00000577827 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-205ENST00000577827 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-205ENST00000577827 RTL8CO15255 209 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-205ENST00000577827 A0A0G2JQZ4 141 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-205ENST00000577827 A0A1W2PNN7 141 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-205ENST00000577827 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-205ENST00000577827 LAMA3Q16787 3333 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-205ENST00000577827 KRTAP10-11P60412 298 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-205ENST00000577827 KRTAP1-1Q07627 177 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-205ENST00000577827 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-205ENST00000577827 SPACA4Q8TDM5 124 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-205ENST00000577827 OXTP01178 125 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-205ENST00000577827 SPRR1AP35321 89 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-205ENST00000577827 LCA10Q71F78 164 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF861PO60384 105 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-205ENST00000577827 MGAQ8IWI9 3026 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF292O60281 2723 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-205ENST00000577827 CR1P17927 2039 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-205ENST00000577827 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRM-205ENST00000577827 CASC10Q5T4H9 136 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRM-205ENST00000577827 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-205ENST00000577827 ITPR3Q14573 2671 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-205ENST00000577827 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRM-205ENST00000577827 Q75L30 129 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRM-205ENST00000577827 USP24Q9UPU5 2620 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRM-205ENST00000577827 CENPEQ02224 2701 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-205ENST00000577827 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-205ENST00000577827 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRM-205ENST00000577827 K7EIL1 84 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-205ENST00000577827 ATRQ13535 2644 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRM-205ENST00000577827 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-205ENST00000577827 UNC80Q8N2C7 3258 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRM-205ENST00000577827 Q96NJ1 140 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-205ENST00000577827 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRM-205ENST00000577827 TRIOO75962 3097 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-205ENST00000577827 VPS13AQ96RL7 3174 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-205ENST00000577827 HECTD1Q9ULT8 2610 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-205ENST00000577827 SPRR1BP22528 89 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-205ENST00000577827 A0A087WTM6 91 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRM-205ENST00000577827 WDFY4Q6ZS81 3184 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-205ENST00000577827 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-205ENST00000577827 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRM-205ENST00000577827 TNP2Q05952 138 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-205ENST00000577827 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRM-205ENST00000577827 DSPP15924 2871 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-205ENST00000577827 Q5VV11 94 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-205ENST00000577827 IGLV7-43P04211 117 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-205ENST00000577827 APLNQ9ULZ1 77 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRM-205ENST00000577827 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-205ENST00000577827 FRYQ5TBA9 3013 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-205ENST00000577827 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-205ENST00000577827 MGAM2Q2M2H8 2515 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRM-205ENST00000577827 CHD6Q8TD26 2715 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-205ENST00000577827 AKAP13Q12802 2813 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRM-205ENST00000577827 NBEAQ8NFP9 2946 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-205ENST00000577827 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-205ENST00000577827 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.44□□□□□ -1.38
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