RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568566.5

TSC2-223, Transcript of TSC complex subunit 2, human

TSL 3

Gene TSC2, Length 542 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TSC2-223	ENST00000568566	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TSC2-223	ENST00000568566	NCR3	O14931	201 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TSC2-223	ENST00000568566	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
TSC2-223	ENST00000568566	REG3G	Q6UW15	175 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TSC2-223	ENST00000568566	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TSC2-223	ENST00000568566	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TSC2-223	ENST00000568566	C1orf137	Q5JT78	98 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TSC2-223	ENST00000568566	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
TSC2-223	ENST00000568566	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TSC2-223	ENST00000568566	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TSC2-223	ENST00000568566	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TSC2-223	ENST00000568566	IGKV2D-28	P01615	120 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TSC2-223	ENST00000568566	UBE2B	P63146	152 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TSC2-223	ENST00000568566	BATF	Q16520	125 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TSC2-223	ENST00000568566	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TSC2-223	ENST00000568566	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TSC2-223	ENST00000568566		A0A0B4J2C4	111 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TSC2-223	ENST00000568566		A0A1B0GWB2	263 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TSC2-223	ENST00000568566	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TSC2-223	ENST00000568566	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TSC2-223	ENST00000568566	NDUFC2	O95298	119 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TSC2-223	ENST00000568566	IGLV7-43	P04211	117 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TSC2-223	ENST00000568566	FXYD2	P54710	66 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TSC2-223	ENST00000568566	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TSC2-223	ENST00000568566	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TSC2-223	ENST00000568566	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TSC2-223	ENST00000568566		M0R378	163 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TSC2-223	ENST00000568566	LYRM7	Q5U5X0	104 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TSC2-223	ENST00000568566	RAB37	Q96AX2	223 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TSC2-223	ENST00000568566	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
TSC2-223	ENST00000568566	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TSC2-223	ENST00000568566	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TSC2-223	ENST00000568566		A4D1N5	150 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TSC2-223	ENST00000568566	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
TSC2-223	ENST00000568566	PRLH	P81277	87 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TSC2-223	ENST00000568566	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TSC2-223	ENST00000568566	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TSC2-223	ENST00000568566	TMEM126A	Q9H061	195 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TSC2-223	ENST00000568566	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TSC2-223	ENST00000568566	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TSC2-223	ENST00000568566	C9orf118	A6NHY6	69 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TSC2-223	ENST00000568566	BCE1	O60756	84 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TSC2-223	ENST00000568566	CFC1B	P0CG36	223 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TSC2-223	ENST00000568566	CFC1	P0CG37	223 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TSC2-223	ENST00000568566	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TSC2-223	ENST00000568566	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		5	□□□□□ -1.61
TSC2-223	ENST00000568566	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
TSC2-223	ENST00000568566	TAX1BP3	O14907	124 aa		5	□□□□□ -1.61
TSC2-223	ENST00000568566	COX6C	P09669	75 aa		5	□□□□□ -1.61
TSC2-223	ENST00000568566	ZNF861P	O60384	105 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TSC2-223	ENST00000568566	ERC2-IT1	O76042	136 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TSC2-223	ENST00000568566	IGLV6-57	P01721	117 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TSC2-223	ENST00000568566	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TSC2-223	ENST00000568566	FABP2	P12104	132 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TSC2-223	ENST00000568566	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TSC2-223	ENST00000568566	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TSC2-223	ENST00000568566	TRBV20-1	A0A075B6N2	111 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TSC2-223	ENST00000568566		A0A0U1RQV1	116 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TSC2-223	ENST00000568566		H0Y9J4	135 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TSC2-223	ENST00000568566	GTF2H5	Q6ZYL4	71 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TSC2-223	ENST00000568566	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TSC2-223	ENST00000568566		A0A1W2PPM0	123 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TSC2-223	ENST00000568566	SPRR1A	P35321	89 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TSC2-223	ENST00000568566	UBE2A	P49459	152 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TSC2-223	ENST00000568566		Q1RN00	199 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TSC2-223	ENST00000568566	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TSC2-223	ENST00000568566		B5MCH6	92 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TSC2-223	ENST00000568566		H3BUT2	72 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TSC2-223	ENST00000568566		K7ERJ3	54 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TSC2-223	ENST00000568566	PRY	O14603	147 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TSC2-223	ENST00000568566	TSPAN13	O95857	204 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TSC2-223	ENST00000568566	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TSC2-223	ENST00000568566	PRR4	Q16378	134 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TSC2-223	ENST00000568566	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TSC2-223	ENST00000568566		Q9BRP9	147 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TSC2-223	ENST00000568566		H0YGX0	51 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TSC2-223	ENST00000568566	SNCG	O76070	127 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TSC2-223	ENST00000568566	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TSC2-223	ENST00000568566	PSMB2	P49721	201 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TSC2-223	ENST00000568566	VAMP3	Q15836	100 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TSC2-223	ENST00000568566	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TSC2-223	ENST00000568566	DIRC1	Q969H9	104 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TSC2-223	ENST00000568566	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TSC2-223	ENST00000568566	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TSC2-223	ENST00000568566		A0A087X002	238 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TSC2-223	ENST00000568566	SCGB1C2	P0DMR2	95 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TSC2-223	ENST00000568566		A0A1B0GV90	55 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TSC2-223	ENST00000568566		K7EP34	96 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TSC2-223	ENST00000568566	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TSC2-223	ENST00000568566	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TSC2-223	ENST00000568566	LCE2A	Q5TA79	106 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TSC2-223	ENST00000568566	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TSC2-223	ENST00000568566	SPCS1	Q9Y6A9	102 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TSC2-223	ENST00000568566	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TSC2-223	ENST00000568566	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TSC2-223	ENST00000568566		A0A1B0GX51	115 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TSC2-223	ENST00000568566	UBE2V1	Q13404	147 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TSC2-223	ENST00000568566	C6orf99	Q4VX62	202 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TSC2-223	ENST00000568566	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TSC2-223	ENST00000568566		H7C2G1	150 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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