RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567690.5

CCNDBP1-212, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-212ENST00000567690 SPINK8P0C7L1 97 aa4.41□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 GAGE2EQ4V326 116 aa4.41□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 C2orf82Q6UX34 121 aa4.41□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa4.41□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 LITAFQ99732 161 aa4.41□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 C6orf48Q9UBA6 75 aa4.41□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 GAGE2DQ9UEU5 116 aa4.41□□□□□ -1.7
CCNDBP1-212ENST00000567690 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa4.4□□□□□ -1.71
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CCNDBP1-212ENST00000567690 C9JAW5 83 aa4.4□□□□□ -1.71
CCNDBP1-212ENST00000567690 IFITM1P13164 125 aa4.4□□□□□ -1.71
CCNDBP1-212ENST00000567690 KRTAP10-8P60410 259 aa4.4□□□□□ -1.71
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CCNDBP1-212ENST00000567690 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa4.4□□□□□ -1.71
CCNDBP1-212ENST00000567690 ANKRD29Q8N6D5 301 aa4.4□□□□□ -1.71
CCNDBP1-212ENST00000567690 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa4.39□□□□□ -1.71
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CCNDBP1-212ENST00000567690 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa4.39□□□□□ -1.71
CCNDBP1-212ENST00000567690 LINC00242Q5T6M2 205 aa4.39□□□□□ -1.71
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CCNDBP1-212ENST00000567690 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa4.39□□□□□ -1.71
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CCNDBP1-212ENST00000567690 TRIAP1O43715 76 aa4.38□□□□□ -1.71
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CCNDBP1-212ENST00000567690 PRR26Q8N8Z3 221 aa4.38□□□□□ -1.71
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CCNDBP1-212ENST00000567690 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa4.37□□□□□ -1.71
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CCNDBP1-212ENST00000567690 CKS1BP61024 79 aa4.36□□□□□ -1.71
CCNDBP1-212ENST00000567690 HERV-K104P63124 156 aa4.36□□□□□ -1.71
CCNDBP1-212ENST00000567690 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
CCNDBP1-212ENST00000567690 DIRC1Q969H9 104 aa4.36□□□□□ -1.71
CCNDBP1-212ENST00000567690 SMIM1B2RUZ4 78 aa4.35□□□□□ -1.71
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CCNDBP1-212ENST00000567690 C6orf226Q5I0X4 101 aa4.33□□□□□ -1.72
CCNDBP1-212ENST00000567690 Q8IZM0 81 aa4.33□□□□□ -1.72
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CCNDBP1-212ENST00000567690 COX7B2Q8TF08 81 aa4.32□□□□□ -1.72
CCNDBP1-212ENST00000567690 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa4.31□□□□□ -1.72
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CCNDBP1-212ENST00000567690 C22orf24Q9Y442 160 aa4.31□□□□□ -1.72
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CCNDBP1-212ENST00000567690 ACYP1P07311 99 aa4.29□□□□□ -1.72
CCNDBP1-212ENST00000567690 LRP2P98164 4655 aa4.29□□□□□ -1.72
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRR4Q16378 134 aa4.29□□□□□ -1.72
CCNDBP1-212ENST00000567690 ANAPC13Q9BS18 74 aa4.29□□□□□ -1.72
CCNDBP1-212ENST00000567690 RNF213Q63HN8 5207 aa4.28□□□□□ -1.72
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF861PO60384 105 aa4.28□□□□□ -1.72
CCNDBP1-212ENST00000567690 BAALC-AS2P0C853 105 aa4.28□□□□□ -1.72
CCNDBP1-212ENST00000567690 CXCL5P42830 114 aa4.28□□□□□ -1.72
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CCNDBP1-212ENST00000567690 LINC00158P58513 81 aa4.28□□□□□ -1.72
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CCNDBP1-212ENST00000567690 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa4.28□□□□□ -1.72
CCNDBP1-212ENST00000567690 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa4.28□□□□□ -1.72
CCNDBP1-212ENST00000567690 NKAPP1Q8N9T2 125 aa4.27□□□□□ -1.73
CCNDBP1-212ENST00000567690 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa4.26□□□□□ -1.73
CCNDBP1-212ENST00000567690 A0A087X002 238 aa4.26□□□□□ -1.73
CCNDBP1-212ENST00000567690 H0YGX0 51 aa4.26□□□□□ -1.73
CCNDBP1-212ENST00000567690 BCE1O60756 84 aa4.26□□□□□ -1.73
CCNDBP1-212ENST00000567690 IGKV2D-28P01615 120 aa4.26□□□□□ -1.73
CCNDBP1-212ENST00000567690 PFN2P35080 140 aa4.26□□□□□ -1.73
CCNDBP1-212ENST00000567690 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
CCNDBP1-212ENST00000567690 LINC00167Q96N53 147 aa4.26□□□□□ -1.73
CCNDBP1-212ENST00000567690 ANAPC11Q9NYG5 84 aa4.26□□□□□ -1.73
CCNDBP1-212ENST00000567690 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa4.25□□□□□ -1.73
CCNDBP1-212ENST00000567690 UBE2AP49459 152 aa4.25□□□□□ -1.73
CCNDBP1-212ENST00000567690 LINC00337Q8N6G1 96 aa4.25□□□□□ -1.73
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CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM218AQ96MZ4 157 aa4.25□□□□□ -1.73
CCNDBP1-212ENST00000567690 DNAL4O96015 105 aa4.24□□□□□ -1.73
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