RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540101.2

C16orf62-211, Transcript of UPF0505 protein C16orf62, humanhuman

TSL 3

Gene C16orf62, Length 461 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf62-211ENST00000540101 M0R143 59 aa4.83□□□□□ -1.64
C16orf62-211ENST00000540101 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
C16orf62-211ENST00000540101 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa4.82□□□□□ -1.64
C16orf62-211ENST00000540101 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa4.82□□□□□ -1.64
C16orf62-211ENST00000540101 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa4.82□□□□□ -1.64
C16orf62-211ENST00000540101 A6NJY4 79 aa4.82□□□□□ -1.64
C16orf62-211ENST00000540101 TMEM126AQ9H061 195 aa4.82□□□□□ -1.64
C16orf62-211ENST00000540101 FAM229AH3BQW9 127 aa4.81□□□□□ -1.64
C16orf62-211ENST00000540101 PRYO14603 147 aa4.81□□□□□ -1.64
C16orf62-211ENST00000540101 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa4.81□□□□□ -1.64
C16orf62-211ENST00000540101 LINC00528Q8N1L1 170 aa4.81□□□□□ -1.64
C16orf62-211ENST00000540101 SNHG12Q9BXW3 62 aa4.81□□□□□ -1.64
C16orf62-211ENST00000540101 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
C16orf62-211ENST00000540101 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa4.81□□□□□ -1.64
C16orf62-211ENST00000540101 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa4.8□□□□□ -1.64
C16orf62-211ENST00000540101 A6NDN8 102 aa4.8□□□□□ -1.64
C16orf62-211ENST00000540101 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
C16orf62-211ENST00000540101 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
C16orf62-211ENST00000540101 UBE2BP63146 152 aa4.8□□□□□ -1.64
C16orf62-211ENST00000540101 S100A7L2Q5SY68 101 aa4.8□□□□□ -1.64
C16orf62-211ENST00000540101 PRO1854Q9UHT4 67 aa4.8□□□□□ -1.64
C16orf62-211ENST00000540101 PCP4L1A6NKN8 68 aa4.79□□□□□ -1.64
C16orf62-211ENST00000540101 BCE1O60756 84 aa4.79□□□□□ -1.64
C16orf62-211ENST00000540101 RPL28P46779 137 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
C16orf62-211ENST00000540101 REG3GQ6UW15 175 aa4.79□□□□□ -1.64
C16orf62-211ENST00000540101 OR13C6PQ8NH95 151 aa4.79□□□□□ -1.64
C16orf62-211ENST00000540101 SMIM11BQ8TCY0 68 aa4.79□□□□□ -1.64
C16orf62-211ENST00000540101 TSPAN13O95857 204 aa4.78□□□□□ -1.64
C16orf62-211ENST00000540101 C6orf99Q4VX62 202 aa4.78□□□□□ -1.64
C16orf62-211ENST00000540101 RAB37Q96AX2 223 aa4.78□□□□□ -1.64
C16orf62-211ENST00000540101 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa4.77□□□□□ -1.65
C16orf62-211ENST00000540101 B5MCH6 92 aa4.77□□□□□ -1.65
C16orf62-211ENST00000540101 H0Y9J4 135 aa4.77□□□□□ -1.65
C16orf62-211ENST00000540101 LCE2BO14633 110 aa4.77□□□□□ -1.65
C16orf62-211ENST00000540101 IGLV7-43P04211 117 aa4.77□□□□□ -1.65
C16orf62-211ENST00000540101 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
C16orf62-211ENST00000540101 C1orf137Q5JT78 98 aa4.77□□□□□ -1.65
C16orf62-211ENST00000540101 TRIAP1O43715 76 aa4.76□□□□□ -1.65
C16orf62-211ENST00000540101 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
C16orf62-211ENST00000540101 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
C16orf62-211ENST00000540101 PRLHP81277 87 aa4.76□□□□□ -1.65
C16orf62-211ENST00000540101 BATFQ16520 125 aa4.76□□□□□ -1.65
C16orf62-211ENST00000540101 Q6ZRX8 168 aa4.76□□□□□ -1.65
C16orf62-211ENST00000540101 DIRC1Q969H9 104 aa4.76□□□□□ -1.65
C16orf62-211ENST00000540101 Q9BRP9 147 aa4.76□□□□□ -1.65
C16orf62-211ENST00000540101 CBY1Q9Y3M2 126 aa4.76□□□□□ -1.65
C16orf62-211ENST00000540101 H7C2G1 150 aa4.75□□□□□ -1.65
C16orf62-211ENST00000540101 TAX1BP3O14907 124 aa4.75□□□□□ -1.65
C16orf62-211ENST00000540101 ZNF861PO60384 105 aa4.75□□□□□ -1.65
C16orf62-211ENST00000540101 SMCR5Q8TEV8 140 aa4.75□□□□□ -1.65
C16orf62-211ENST00000540101 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
C16orf62-211ENST00000540101 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
C16orf62-211ENST00000540101 COX7BP24311 80 aa4.74□□□□□ -1.65
C16orf62-211ENST00000540101 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa4.74□□□□□ -1.65
C16orf62-211ENST00000540101 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa4.73□□□□□ -1.65
C16orf62-211ENST00000540101 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
C16orf62-211ENST00000540101 ERC2-IT1O76042 136 aa4.73□□□□□ -1.65
C16orf62-211ENST00000540101 FAM218AQ96MZ4 157 aa4.73□□□□□ -1.65
C16orf62-211ENST00000540101 HMCN2Q8NDA2 5059 aa4.72□□□□□ -1.65
C16orf62-211ENST00000540101 UBE2AP49459 152 aa4.72□□□□□ -1.65
C16orf62-211ENST00000540101 Q1RN00 199 aa4.72□□□□□ -1.65
C16orf62-211ENST00000540101 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa4.72□□□□□ -1.65
C16orf62-211ENST00000540101 LINC00575Q6W349 94 aa4.72□□□□□ -1.65
C16orf62-211ENST00000540101 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
C16orf62-211ENST00000540101 C9orf118A6NHY6 69 aa4.71□□□□□ -1.66
C16orf62-211ENST00000540101 H0YGX0 51 aa4.71□□□□□ -1.66
C16orf62-211ENST00000540101 SPINK6Q6UWN8 80 aa4.71□□□□□ -1.66
C16orf62-211ENST00000540101 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa4.71□□□□□ -1.66
C16orf62-211ENST00000540101 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa4.7□□□□□ -1.66
C16orf62-211ENST00000540101 VAMP3Q15836 100 aa4.7□□□□□ -1.66
C16orf62-211ENST00000540101 CLEC2BQ92478 149 aa4.7□□□□□ -1.66
C16orf62-211ENST00000540101 HIGD2AQ9BW72 106 aa4.7□□□□□ -1.66
C16orf62-211ENST00000540101 FAT3Q8TDW7 4589 aa4.7□□□□□ -1.66
C16orf62-211ENST00000540101 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa4.69□□□□□ -1.66
C16orf62-211ENST00000540101 A0A1W2PPM0 123 aa4.69□□□□□ -1.66
C16orf62-211ENST00000540101 H3BUT2 72 aa4.69□□□□□ -1.66
C16orf62-211ENST00000540101 PSMB2P49721 201 aa4.69□□□□□ -1.66
C16orf62-211ENST00000540101 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
C16orf62-211ENST00000540101 A0A1B0GX51 115 aa4.68□□□□□ -1.66
C16orf62-211ENST00000540101 hADV29S1A0JD25 119 aa4.68□□□□□ -1.66
C16orf62-211ENST00000540101 LST1O00453 97 aa4.68□□□□□ -1.66
C16orf62-211ENST00000540101 LINC00483Q53H64 154 aa4.68□□□□□ -1.66
C16orf62-211ENST00000540101 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa4.68□□□□□ -1.66
C16orf62-211ENST00000540101 SPRR4Q96PI1 79 aa4.68□□□□□ -1.66
C16orf62-211ENST00000540101 UBR4Q5T4S7 5183 aa4.67□□□□□ -1.66
C16orf62-211ENST00000540101 TCL1BO95988 128 aa4.67□□□□□ -1.66
C16orf62-211ENST00000540101 COX6CP09669 75 aa4.67□□□□□ -1.66
C16orf62-211ENST00000540101 SPRR1BP22528 89 aa4.67□□□□□ -1.66
C16orf62-211ENST00000540101 OXTP01178 125 aa4.66□□□□□ -1.66
C16orf62-211ENST00000540101 TRACP01848 142 aa4.66□□□□□ -1.66
C16orf62-211ENST00000540101 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
C16orf62-211ENST00000540101 Q6ZQY7 126 aa4.66□□□□□ -1.66
C16orf62-211ENST00000540101 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa4.65□□□□□ -1.67
C16orf62-211ENST00000540101 SLC25A20O43772 301 aa4.65□□□□□ -1.67
C16orf62-211ENST00000540101 FABP2P12104 132 aa4.65□□□□□ -1.67
C16orf62-211ENST00000540101 SMIM29Q86T20 159 aa4.65□□□□□ -1.67
C16orf62-211ENST00000540101 A0A087X002 238 aa4.64□□□□□ -1.67
C16orf62-211ENST00000540101 SCGB1C2P0DMR2 95 aa4.64□□□□□ -1.67
C16orf62-211ENST00000540101 FAM229BQ4G0N7 80 aa4.64□□□□□ -1.67
C16orf62-211ENST00000540101 LYRM7Q5U5X0 104 aa4.64□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.7 ms